农业昆虫中微RNA基因的生物信息学预测
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 缩略词-中英文对照 | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-23页 |
| 一、miRNA的发现 | 第9-11页 |
| 二、miRNA的特征 | 第11-13页 |
| 三、miRNA的形成 | 第13-15页 |
| 四、miRNA的作用机制及功能 | 第15-17页 |
| 五、miRNA的鉴定方法 | 第17-19页 |
| ·正向遗传筛选法 | 第17-18页 |
| ·直接克隆法 | 第18-19页 |
| ·生物信息学预测 | 第19页 |
| 六、miRNA靶标基因的确定 | 第19-21页 |
| 七、本研究的目的及意义 | 第21-23页 |
| 第二章 材料与方法 | 第23-37页 |
| 1. 数据搜集 | 第23-25页 |
| 2. 使用数据库及软件 | 第25页 |
| 3. Triplet-SVM分类器的重新训练 | 第25-27页 |
| ·昆虫miRNA正样本的选取 | 第26页 |
| ·昆虫miRNA负样本的选取 | 第26页 |
| ·分类器的训练 | 第26-27页 |
| 4. 昆虫miRNA的预测 | 第27-29页 |
| 5. 昆虫miRNA靶基因的预测 | 第29页 |
| 6. 东亚飞蝗中miRNA的实验验证 | 第29-37页 |
| ·供试昆虫 | 第30页 |
| ·主要试剂 | 第30页 |
| ·主要仪器设备 | 第30页 |
| ·总RNA的提取 | 第30-31页 |
| ·cDNA第一链的合成 | 第31-32页 |
| ·PCR引物 | 第32页 |
| ·PCR反应体系 | 第32-33页 |
| ·常规分子克隆 | 第33-37页 |
| ·PCR产物回收与纯化 | 第33页 |
| ·连接反应 | 第33-34页 |
| ·连接产物的转化、单克隆 | 第34页 |
| ·重组质粒的提取及检测 | 第34-35页 |
| ·序列测定与分析 | 第35-37页 |
| 第三章 结果与分析 | 第37-51页 |
| 1. Triplet-SVM的重新训练 | 第37-38页 |
| 2. 农业昆虫中miRNA的鉴定 | 第38-46页 |
| 3. 昆虫miRNA靶基因的鉴定 | 第46-49页 |
| 4. 实验验证东亚飞蝗中的miRNA | 第49-51页 |
| 全文总结 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-61页 |
| 附录:攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第61-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
