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橡胶胶乳特异表达锌指蛋白基因分离、克隆及表达分析

摘要第1-5页
Abstract第5-9页
1 前言第9-24页
   ·橡胶生物合成分子生物学研究进展第9-12页
     ·橡胶生物合成分子生物学研究现状与不足第9-10页
     ·激素对橡胶生物合成的调控及其分子生物学研究现状与不足第10-11页
     ·橡胶转录因子研究现状与分析第11页
     ·植物锌指蛋白与橡胶胶乳产生的关联性分析第11-12页
   ·差异表达基因的筛选技术第12-16页
     ·mRNA差异显示技术(DDRT-PCR)第12页
     ·RNA随机引物聚合酶链式反应(RAP-PCR)第12-13页
     ·代表性差异分析(cDNA-RDA)第13页
     ·抑制消减杂交(SSH)第13-15页
     ·cDNA微阵列在检测表达差异基因中的应用第15页
     ·基因表达序列分析(SAGE)第15-16页
   ·应用拟南芥cDNA微阵列芯片研究非模式植物的转录谱第16页
   ·锌指蛋白的研究进展第16-22页
     ·锌指蛋白的结构第17-18页
     ·锌指蛋白的分类第18页
     ·锌指蛋白转录因子的调控机理第18-19页
     ·与逆境胁迫相关的植物锌指蛋白第19-22页
       ·与盐胁迫有关的锌指蛋白第20页
       ·与冷胁迫有关的锌指蛋白第20-21页
       ·与干旱胁迫有关的锌指蛋白第21页
       ·与氧胁迫有关的锌指蛋白第21页
       ·与强光胁迫有关的锌指蛋白第21-22页
   ·本研究的目的和意义第22-23页
   ·技术路线第23-24页
2 材料与方法第24-34页
   ·材料第24-25页
     ·植物材料来源第24页
     ·菌株和质粒第24页
     ·生化试剂第24页
       ·质粒载体第24页
       ·工具酶及分子量标准第24页
       ·试剂盒第24页
       ·主要化学试剂第24页
     ·芯片选择第24页
     ·主要仪器设备第24页
     ·引物列表第24-25页
   ·方法第25-34页
     ·利用cDNA微阵列筛选差异表达基因第25-29页
       ·胶乳RNA的提取第25-26页
       ·CTAB结合TRNzol~-A~+提取叶片总RNA第26页
       ·RNA纯化第26-27页
       ·RNA的琼脂糖凝胶电泳检测第27页
       ·总RNA的浓度检测第27页
       ·对样品RNA进行荧光标记(晶芯~(?)cRNA扩增标记试剂盒)第27页
       ·杂交与清洗第27-28页
       ·芯片扫描第28页
       ·芯片图像的采集与数据分析第28-29页
       ·生物信息学分析第29页
     ·橡胶C3HC4型锌指蛋白基因的克隆第29-32页
       ·橡胶基因组DNA的提取第29-30页
       ·cDNA第一链合成第30页
       ·PCR第30页
       ·PCR产物的回收与纯化第30-31页
       ·载体连接第31页
       ·重组质粒的转化第31页
       ·菌落PCR检测第31-32页
     ·激素处理后的表达分析第32-34页
       ·实验材料处理第32页
       ·胶乳RNA的提取第32页
       ·RT-PCR第32页
       ·Real-Time PCR第32-34页
3. 结果与分析第34-49页
   ·胶乳特异表达基因的获得第34-37页
     ·胶乳RNA和叶片RNA的提取第34页
     ·基因芯片表达谱第34-35页
     ·芯片杂交结果第35-36页
     ·芯片结果分析第36-37页
   ·四个锌指蛋白基因的克隆第37-41页
     ·基因组DNA的质量检测第38-39页
     ·基因克隆第39-40页
     ·内含子分析第40-41页
   ·四个锌指蛋白基因在激素刺激下的表达差异分析第41-45页
     ·RNA质量检测第41-42页
     ·real-time PCR结果第42-45页
   ·锌指蛋白基因与橡胶转移酶基因的关联性分析第45-49页
4. 讨论第49-55页
   ·微阵列杂交种关键技术问题及解决方法第49-51页
     ·29k Aabidopsis Genome Array芯片说明第49页
     ·芯片质量控制第49-50页
     ·对弱杂交信号的处理第50页
     ·芯片假阳性问题的处理第50-51页
   ·微阵列杂交结果对研究橡胶代谢合成途径的价值第51页
   ·橡胶DNA、RNA的提取第51-52页
   ·关于荧光定量PCR的实验第52-53页
   ·cDNA质量的检测第53页
   ·关于激素作用下锌指蛋白的功能第53-55页
5. 结论第55-56页
参考文献第56-62页
缩略词表第62-63页
附录第63-68页
致谢第68页

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