中文摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-10页 |
第一章 文献综述 | 第10-22页 |
1 北极概况 | 第10-12页 |
·北极的生态环境特点 | 第10页 |
·资源的开发和利用概况 | 第10-11页 |
·北极微生物学研究概况 | 第11-12页 |
2 深海沉积物中微生物的研究方法与研究现状 | 第12-18页 |
·微生物分子生态学研究方法 | 第12-17页 |
·深海沉积物中微生物的研究现状 | 第17-18页 |
3 深海沉积物中微生物多样性的研究的发展前景 | 第18-20页 |
·深海微生物多样性 | 第18页 |
·极地沉积物中微生物的研究进展及前景 | 第18-20页 |
4 本研究的目的及意义 | 第20-22页 |
第二章 沉积物宏基因组DNA提取及PCR-DGGE条件优化 | 第22-35页 |
1 材料与方法 | 第22-26页 |
·北极深海沉积物 | 第22页 |
·主要试剂配方 | 第22页 |
·北极深海沉积物微生物总DNA提取 | 第22-24页 |
·沉积物宏基因组DNA纯化 | 第24页 |
·沉积物微生物16SrDNA基因PCR扩增 | 第24-25页 |
·选择DGGE条件 | 第25-26页 |
2 结果与分析 | 第26-32页 |
·沉积物总DNA提取方法的比较 | 第26-28页 |
·最佳PCR退火温度 | 第28-29页 |
·最佳引物浓度 | 第29页 |
·最佳PCR稀释模板浓度 | 第29-30页 |
·最佳DGGE胶中变性剂浓度 | 第30-31页 |
·DGGE电泳时间 | 第31页 |
·DGGE胶的染色 | 第31-32页 |
3 讨论 | 第32-35页 |
·深海沉积物微生物总DNA的提取质量 | 第32-33页 |
·环境样品微生物DNA的纯化 | 第33页 |
·PCR条件优化 | 第33-34页 |
·DGGE条件的优化 | 第34-35页 |
第三章 北极深海沉积物微生物多样性的DGGE分析 | 第35-50页 |
1 材料与方法 | 第35-39页 |
·材料 | 第35页 |
·沉积物微生物总DNA的提取纯化 | 第35-38页 |
·16SrDNA基因PCR扩增 | 第38页 |
·16SrDNA基因PCR产物DGGE检测 | 第38页 |
·优势条带的回收及PCR扩增 | 第38页 |
·回收条带的克隆 | 第38页 |
·感受态细胞的制备 | 第38页 |
·PCR产物的连接转化 | 第38页 |
·质粒DNA提取 | 第38-39页 |
·阳性克隆的鉴定 | 第39页 |
·16SrDNA V3-V5区的PCR扩增及DGGE再鉴定确定位置 | 第39页 |
·甘油菌的制备及测序 | 第39页 |
·序列分析 | 第39页 |
·聚类分析及进化数的构建 | 第39页 |
2 结果与分析 | 第39-48页 |
·表层沉积物总DNA提取及特异性扩增 | 第39-41页 |
·柱式沉积物总DNA提取及特异性扩增 | 第41页 |
·表层沉积物细菌DGGE图谱 | 第41-43页 |
·同一站位不同深度沉积物细菌DGGE图谱 | 第43-45页 |
·酶切图谱 | 第45页 |
·五个站位表层沉积物中细菌16S rDNA序列系统发育分析 | 第45-48页 |
3 关于表层沉积物结果的讨论 | 第48-50页 |
参考文献 | 第50-55页 |
附录 | 第55-63页 |
致谢 | 第63-64页 |