| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第13-33页 |
| 1.1 深海热液系统 | 第13-17页 |
| 1.1.1 深海热液区的形成和发现 | 第13-16页 |
| 1.1.2 深海热液区的环境特征 | 第16页 |
| 1.1.3 深海热液区的生物群落 | 第16-17页 |
| 1.2 深海微生物 | 第17-24页 |
| 1.2.1 深海热液微生物概况 | 第17-21页 |
| 1.2.2 深海致病性微生物概况 | 第21-22页 |
| 1.2.3 深海芽孢杆菌的发现与研究进展 | 第22-23页 |
| 1.2.4 芽孢杆菌属的致病性 | 第23-24页 |
| 1.3 抗菌肽 | 第24-30页 |
| 1.3.1 抗菌肽的分类 | 第25-26页 |
| 1.3.2 抗菌肽的作用机理 | 第26-27页 |
| 1.3.3 抗脂多糖因子的概况 | 第27-28页 |
| 1.3.4 抗脂多糖因子的构效关系 | 第28-29页 |
| 1.3.5 抗脂多糖因子的免疫效应 | 第29-30页 |
| 1.4 本论文的研究目的及意义 | 第30-33页 |
| 第二章 一株深海热液枯草芽孢杆菌的分离鉴定、组学分析及致病性研究 | 第33-74页 |
| 2.1 实验材料和方法 | 第33-49页 |
| 2.1.1 实验菌株、细胞和动物 | 第33-34页 |
| 2.1.2 试剂和耗材 | 第34-36页 |
| 2.1.3 深海热液水体样本的采集 | 第36页 |
| 2.1.4 深海热液微生物的分离与培养 | 第36页 |
| 2.1.5 致病菌株的筛选 | 第36-37页 |
| 2.1.6 细菌16S rDNA的序列扩增 | 第37-39页 |
| 2.1.7 细菌的表型特征分析 | 第39-41页 |
| 2.1.8 细菌的鞭毛特征观察与运动能力检测 | 第41页 |
| 2.1.9 细菌全基因组测序和分析 | 第41-43页 |
| 2.1.10 基于全基因组数据信息的进化树构建 | 第43页 |
| 2.1.11 细菌比较基因组分析 | 第43-44页 |
| 2.1.12 细菌毒力基因分析 | 第44页 |
| 2.1.13 细菌的动物体内感染实验 | 第44-45页 |
| 2.1.14 细菌组织侵染能力检测 | 第45-46页 |
| 2.1.15 细菌的细胞内增殖能力检测 | 第46-48页 |
| 2.1.16 细菌抗血清活性检测 | 第48-49页 |
| 2.1.17 细菌溶血活性检测 | 第49页 |
| 2.2 实验结果 | 第49-70页 |
| 2.2.1 深海热液芽孢杆菌G7 的形态特征及生长分析 | 第49-52页 |
| 2.2.2 G7 的系统发育分析 | 第52-55页 |
| 2.2.3 G7 的基因组特征描述 | 第55-57页 |
| 2.2.4 G7 与对照菌株NCIB3610T的比较基因组学分析 | 第57-60页 |
| 2.2.5 G7 基因组中毒力相关基因分析 | 第60-62页 |
| 2.2.6 G7 的体内毒性分析 | 第62-65页 |
| 2.2.7 G7 抗血清杀伤能力和溶血活性分析 | 第65-67页 |
| 2.2.8 G7 感染细胞及胞内复制能力分析 | 第67-70页 |
| 2.3 讨论 | 第70-74页 |
| 第三章 G7的抗血清机制研究 | 第74-88页 |
| 3.1 实验材料与方法 | 第74-78页 |
| 3.1.1 实验动物 | 第74页 |
| 3.1.2 试剂和耗材 | 第74页 |
| 3.1.3 G7 的补体激活检测 | 第74-75页 |
| 3.1.4 血清对G7 膜结构的影响 | 第75页 |
| 3.1.5 G7 对补体激活的免疫印迹(Western blot)和ELISA分析 | 第75-77页 |
| 3.1.6 趋化实验分析 | 第77页 |
| 3.1.7 G7 经溶菌酶处理后的抗血清能力分析 | 第77-78页 |
| 3.2 实验结果 | 第78-86页 |
| 3.2.1 G7 与血清孵育后血清中剩余补体的活性分析 | 第78-80页 |
| 3.2.2 G7 激活牙鲆血清后形成的MAC成分检测 | 第80页 |
| 3.2.3 G7 激活小鼠血清后形成的MAC成分检测 | 第80-81页 |
| 3.2.4 与G7 孵育后的血清的趋化能力检测 | 第81-84页 |
| 3.2.5 G7 经溶菌酶处理后的抗血清能力分析 | 第84-85页 |
| 3.2.6 血清对G7 细胞形态结构的影响 | 第85-86页 |
| 3.3 讨论 | 第86-88页 |
| 第四章 深海热液阿尔文虾抗脂多糖因子RspALF1 的克隆与表达 | 第88-102页 |
| 4.1 实验材料与方法 | 第88-97页 |
| 4.1.1 实验菌株 | 第88页 |
| 4.1.2 试剂和耗材 | 第88-90页 |
| 4.1.3 样品的采集与处理 | 第90-91页 |
| 4.1.4 RspALF1 基因克隆、重组质粒构建及转化 | 第91-95页 |
| 4.1.5 重组蛋白(rRspALF1)的原核表达及纯化 | 第95-97页 |
| 4.1.6 RspALF1 基因序列及系统进化分析 | 第97页 |
| 4.2 实验结果 | 第97-98页 |
| 4.2.1 RspALF1 基因克隆、蛋白表达纯化的结果 | 第97-98页 |
| 4.2.2 RspALF1 编码序列同源比对与进化分析 | 第98页 |
| 4.3 讨论 | 第98-102页 |
| 第五章 重组RspALF1 对深海热液细菌及其它来源细菌的结合作用及活性影响 | 第102-128页 |
| 5.1 实验材料与方法 | 第102-107页 |
| 5.1.1 实验菌株和动物 | 第102页 |
| 5.1.2 试剂和耗材 | 第102页 |
| 5.1.3 RspALF1 在阿尔文虾组织中的表达情况检测 | 第102-103页 |
| 5.1.4 RspALF1 蛋白三维建模及功能位点分析 | 第103页 |
| 5.1.5 RspALF1 脂多糖结合域及其突变体的设计与人工合成 | 第103-104页 |
| 5.1.6 rRspALF1 及其脂多糖结合域(ALF1P1)的抗菌效果 | 第104-105页 |
| 5.1.7 温度对rRspALF1 及其脂多糖结合域的杀菌活性的影响 | 第105页 |
| 5.1.8 rRspALF1 及其脂多糖结合域的菌结合活性检测 | 第105-106页 |
| 5.1.9rRspALF1 及其脂多糖结合域与细菌来源的病原相关分子模式结合实验 | 第106页 |
| 5.1.10 rRspALF1 及其脂多糖结合域对细菌膜结构的影响 | 第106-107页 |
| 5.1.11 rRspALF1 及其脂多糖结合域对鱼和虾的抗感染保护效应 | 第107页 |
| 5.2 实验结果 | 第107-123页 |
| 5.2.1 RspALF1 的组织特异性表达分析 | 第107-108页 |
| 5.2.2 RspALF1 蛋白质三维结构模型分析 | 第108-109页 |
| 5.2.3 rRspALF1 及其脂多糖结合域抗菌效果分析 | 第109-113页 |
| 5.2.4 rRspALF1 及其脂多糖结合域与细菌的结合能力分析 | 第113-116页 |
| 5.2.5 rRspALF1 及其脂多糖结合域对细菌膜结构的影响分析 | 第116-119页 |
| 5.2.6 温度对rRspALF1 及其脂多糖结合域的杀菌效应的影响 | 第119-121页 |
| 5.2.7 rRspALF1 及其脂多糖结合域的抗感染免疫保护作用分析 | 第121-123页 |
| 5.3 讨论 | 第123-128页 |
| 第六章 结论与展望 | 第128-132页 |
| 参考文献 | 第132-156页 |
| 附录 常见溶液的配制 | 第156-158页 |
| 致谢 | 第158-160页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文 | 第160页 |
