| 摘要 | 第4-9页 |
| ABSTRACT | 第9-14页 |
| 第一章 综述 | 第18-39页 |
| 1. 广西巴马小型猪 | 第18-22页 |
| 1.1 广西巴马小型猪的培育与特点 | 第18-19页 |
| 1.2 巴马小型猪在医学研究中的应用 | 第19-22页 |
| 2. 基因组学概述及猪基因组研究进展 | 第22-33页 |
| 2.1 测序技术发展 | 第22-26页 |
| 2.2 全基因组De novo测序 | 第26-33页 |
| 3. 长链非编码RNA与糖尿病 | 第33-37页 |
| 3.1 lncRNA与胰岛 | 第34-35页 |
| 3.2 lncRNA与糖尿病肾病 | 第35页 |
| 3.3 lncRNA与糖脂代谢 | 第35-36页 |
| 3.4 lncRNA与糖尿病性血管综合征 | 第36-37页 |
| 3.5 lncRNA与糖尿病的研究展望 | 第37页 |
| 4. 研究目的 | 第37-39页 |
| 第二章 巴马小型猪全基因组测序 | 第39-60页 |
| 1. 材料与方法 | 第39-45页 |
| 1.1 巴马小型猪全基因组草图绘制 | 第39-41页 |
| 1.2 巴马小型猪高质量基因组组装 | 第41-42页 |
| 1.3 巴马小型猪高质量基因组组装结果评估 | 第42-43页 |
| 1.4 巴马小型猪基因组注释 | 第43-45页 |
| 2. 实验结果 | 第45-57页 |
| 2.1 巴马小型猪全基因组草图绘制 | 第45-47页 |
| 2.2 巴马小型猪高质量基因组组装 | 第47-49页 |
| 2.3 巴马小型猪高质量基因组组装结果评估 | 第49-52页 |
| 2.4 巴马小型猪基因组注释 | 第52-57页 |
| 3. 分析与讨论 | 第57-59页 |
| 4. 小结 | 第59-60页 |
| 第三章 全基因组变异检测分析 | 第60-117页 |
| 1. 材料与方法 | 第60-68页 |
| 1.1 巴马小型猪与巴马香猪混池重测序SNPs分析 | 第60-62页 |
| 1.2 巴马猪与大体型猪全基因组组装变异检测分析 | 第62-65页 |
| 1.3 巴马猪全基因组近交变异分析 | 第65-66页 |
| 1.4 巴马小型猪糖尿病环境抵抗力检测 | 第66-68页 |
| 2. 实验结果 | 第68-107页 |
| 2.1 巴马小型猪与巴马香猪混池重测序SNPs分析 | 第68-78页 |
| 2.2 巴马猪与大体型猪全基因组组装变异检测分析 | 第78-94页 |
| 2.3 巴马猪近交全基因组变异分析 | 第94-101页 |
| 2.4 巴马小型猪糖尿病环境抵抗力检测 | 第101-107页 |
| 3. 分析与讨论 | 第107-115页 |
| 4. 小结 | 第115-117页 |
| 第四章 全基因组测序深度揭示巴马小型猪作为动物模型的潜能 | 第117-133页 |
| 1. 材料与方法 | 第117-119页 |
| 1.1 比较基因组分析 | 第117-118页 |
| 1.2 蛋白相似度分析 | 第118-119页 |
| 2. 实验结果 | 第119-123页 |
| 2.1 比较基因组分析 | 第119-122页 |
| 2.2 蛋白相似度分析 | 第122-123页 |
| 3. 分析与讨论 | 第123-131页 |
| 4. 小结 | 第131-133页 |
| 第五章 糖尿病易感性RNA转录组分析 | 第133-173页 |
| 1. 材料与方法 | 第133-140页 |
| 1.1 lncRNA转录组及mRNA共表达分析 | 第133-140页 |
| 2. 实验结果 | 第140-170页 |
| 2.1 lncRNA转录组分析 | 第140-170页 |
| 3. 分析与讨论 | 第170-172页 |
| 4. 小结 | 第172-173页 |
| 全文总结与创新 | 第173-174页 |
| 1. 总结 | 第173页 |
| 2. 本研究创新点 | 第173-174页 |
| 参考文献 | 第174-190页 |
| 附表 | 第190-191页 |
| 致谢 | 第191-192页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第192页 |
