葡萄属叶绿体基因组分析及其系统发育研究
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 1.绪论 | 第11-19页 |
| 1.1 叶绿体基因组研究进展 | 第11-14页 |
| 1.1.1 叶绿体基因组的起源与发展 | 第11-12页 |
| 1.1.2 叶绿体基因组的基本结构 | 第12-13页 |
| 1.1.3 叶绿体基因组的进化 | 第13-14页 |
| 1.1.4 叶绿体基因组的应用 | 第14页 |
| 1.2 葡萄科植物研究进展 | 第14-18页 |
| 1.2.1 葡萄科叶绿体基因组研究进展 | 第16页 |
| 1.2.2 葡萄科属系统发育研究进展 | 第16-18页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第18-19页 |
| 2.材料与方法 | 第19-28页 |
| 2.1 试验材料 | 第19-21页 |
| 2.2 试验试剂和仪器 | 第21-23页 |
| 2.2.1 试剂药品 | 第21页 |
| 2.2.2 试剂配制 | 第21-23页 |
| 2.2.3 仪器设备 | 第23页 |
| 2.3 方法 | 第23-28页 |
| 2.3.1 葡萄基因组DNA提取 | 第23-24页 |
| 2.3.2 DNA浓度和纯度的测定 | 第24-25页 |
| 2.3.2.1 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第24页 |
| 2.3.2.2 分光光度计检测 | 第24-25页 |
| 2.3.3 叶绿体基因组测序、组装与注释 | 第25页 |
| 2.3.4 叶绿体基因组重复序列分析 | 第25-26页 |
| 2.3.5 密码子使用偏好性分析 | 第26页 |
| 2.3.6 叶绿体基因组比较分析 | 第26-27页 |
| 2.3.7 系统发育分析 | 第27-28页 |
| 3.结果 | 第28-52页 |
| 3.1 基因组DNA质量检测 | 第28页 |
| 3.2 叶绿体基因组基本信息 | 第28-39页 |
| 3.2.1 叶绿体基因组结构 | 第28-31页 |
| 3.2.2 叶绿体基因类型和分布 | 第31-34页 |
| 3.2.3 密码子的使用 | 第34-37页 |
| 3.2.4 重复序列与SSR分析 | 第37-39页 |
| 3.2.4.1 重复序列分析 | 第37-38页 |
| 3.2.4.2 SSR分析 | 第38-39页 |
| 3.3 叶绿体基因组的比较 | 第39-47页 |
| 3.3.1 叶绿体基因组全序列比对 | 第39-42页 |
| 3.3.2 IR区域的收缩和扩张 | 第42-45页 |
| 3.3.3 叶绿体基因遗传距离和差异分析 | 第45-47页 |
| 3.4 葡萄科系统发育分析 | 第47-52页 |
| 4.讨论 | 第52-58页 |
| 4.1 葡萄属叶绿体基因组基本信息 | 第52-54页 |
| 4.2 叶绿体基因组的比较分析 | 第54-55页 |
| 4.3 葡萄科系统发育分析 | 第55-58页 |
| 5.总结 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-75页 |
| 致谢 | 第75页 |
