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桑树青枯病病原菌的分离鉴定及其活体检测方法的建立

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第1章 绪论第16-28页
    1.1 前言第16页
    1.2 青枯菌概述第16-18页
        1.2.1 青枯菌描述及分类第17页
        1.2.2 青枯菌寄主及致病机理第17-18页
    1.3 桑树青枯病概述第18-19页
        1.3.1 桑树青枯病病原描述第18-19页
        1.3.2 桑树青枯病发病规律及防治第19页
    1.4 青枯菌检测研究进展第19-22页
        1.4.1 培养基分离法第20页
        1.4.2 核酸分子杂交第20-21页
        1.4.3 基于PCR技术的检测第21-22页
    1.5 PMA用于活菌检测技术概论第22-25页
        1.5.1 PMA的作用机理第23-24页
        1.5.2 PMA‐q PCR用于活菌检测研究进展第24-25页
    1.6 本课题的研究意义和主要内容第25-28页
        1.6.1 研究的目的与意义第25页
        1.6.2 研究内容第25-27页
        1.6.3 技术路线第27-28页
第2章 桑青枯病病原菌的分离、鉴定第28-40页
    2.1 实验材料第28-30页
        2.1.1 样品来源第28页
        2.1.2 培养基第28页
        2.1.3 主要溶液配制及试剂盒第28-29页
        2.1.4 主要实验仪器和设备第29-30页
    2.2 实验方法第30-35页
        2.2.1 病原菌的分离第30页
        2.2.2 病原菌回接致病验证第30页
        2.2.3 病原菌 16S r DNA基因PCR扩增第30-32页
        2.2.4 PCR产物回收及测序第32-34页
        2.2.5 序列比对分析第34-35页
    2.3 结果与分析第35-38页
        2.3.1 病原菌分离及回复致病结果第35-36页
        2.3.2 病原菌 16S r DNA序列扩增及比对结果第36-38页
    2.4 讨论第38页
    2.5 本章小结第38-40页
第3章 桑青枯菌特异性检测引物的设计及q PCR方法的建立第40-59页
    3.1 实验材料第40-41页
        3.1.1 供试菌株第40页
        3.1.2 主要药品和试剂第40页
        3.1.3 主要仪器与设备第40-41页
    3.2 实验方法第41-47页
        3.2.1 特异性引物的设计与合成第41页
        3.2.2 引物的特异性验证第41-45页
        3.2.3 荧光定量PCR反应程序第45-46页
        3.2.4 常规PCR和q PCR的检测灵敏性第46页
        3.2.5 q PCR对土壤样品的检测第46-47页
    3.3 结果与分析第47-55页
        3.3.1 引物设计结果第47页
        3.3.2 引物的特异性验证第47-49页
        3.3.3 常规PCR和q PCR的检测灵敏性第49-54页
        3.3.4 q PCR对土壤样品的检测第54-55页
    3.4 讨论第55-56页
    3.5 本章小结第56-59页
第4章 基于PMA-q PCR的青枯菌5号小种活体检测技术的建立第59-71页
    4.1 实验材料第59-60页
        4.1.1 主要药品及试剂第59页
        4.1.2 主要仪器与设备第59-60页
    4.2 实验方法第60-63页
        4.2.1 桑青枯菌菌悬液的制备第60页
        4.2.2 引物的合成与设计第60页
        4.2.3 荧光定量PCR反应程序第60页
        4.2.4 PMA预处理条件的优化第60-62页
        4.2.5 PMA‐q PCR的检测限第62页
        4.2.6 PMA‐q PCR对活死菌混合体系的检测第62页
        4.2.7 数据分析第62-63页
    4.3 结果与分析第63-67页
        4.3.1 PMA预处理的最优浓度第63-64页
        4.3.2 PMA预处理的最优孵育时间第64页
        4.3.3 PMA预处理的最优曝光时间第64-65页
        4.3.4 PMA‐q PCR的检测限第65-66页
        4.3.5 PMA‐q PCR对活死菌混合体系的检测第66-67页
    4.4 讨论第67-68页
    4.5 本章小结第68-71页
结论第71-73页
参考文献第73-79页
附录第79-83页
攻读学位期间发表的学术论文第83-85页
致谢第85页

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