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基于转录组和蛋白质组学研究航天诱变决明株系的变异机制

摘要第6-8页
abstract第8-10页
第一章 文献综述第15-31页
    1.1 引言第15页
    1.2 决明化学成分的研究第15-19页
    1.3 决明提取物药理活性的研究进展第19-23页
        1.3.1 决明提取物对糖尿病的抑制功效第19-20页
        1.3.2 神经保护功效第20-21页
        1.3.3 抗氧化功效第21页
        1.3.4 抗虫抑菌活性第21-22页
        1.3.5 抗癌功效第22页
        1.3.6 降压调脂功效第22页
        1.3.7 保肝功效第22-23页
    1.4 转录组学的发展概况第23-26页
        1.4.1 药用植物转录组学研究进展第23-26页
        1.4.2 航天诱变材料的转录组学研究第26页
    1.5 蛋白质组学研究概述第26-29页
        1.5.1 蛋白质组学的基本技术与方法第26-27页
        1.5.2 药用植物蛋白质组学研究进展第27-29页
    1.6 本研究的目的及意义第29-30页
    1.7 技术路线第30-31页
第二章 决明遗传及质量标志物含量的多样性研究第31-47页
    2.1 引言第31页
    2.2 材料与方法第31-35页
        2.2.1 实验材料第31-33页
        2.2.2 实验方法第33-35页
    2.3 结果与分析第35-44页
        2.3.1 ISSR和SCoT分子标记的多态性第35-36页
        2.3.2 聚类分析第36-38页
        2.3.3 主坐标分析第38页
        2.3.4 决明种群结构分析第38-40页
        2.3.5 决明子形态多样性分析第40-42页
        2.3.6 不同地区决明子质量标志物的含量测定第42-44页
    2.4 讨论第44-47页
        2.4.1 基于分子标记和决明子形态特征的遗传多样性分析第44-45页
        2.4.2 不同地理区域之间决明种群的遗传关系第45-46页
        2.4.3 航天诱变株系质量标志物的含量变化情况第46-47页
第三章 航天诱变决明株系的转录组学研究第47-69页
    3.1 引言第47页
    3.2 材料与方法第47-49页
        3.2.1 实验材料第47-48页
        3.2.2 转录组测序第48页
        3.2.3 转录组拼接及生物信息学分析第48页
        3.2.4 实时荧光定量PCR分析第48-49页
    3.3 结果与分析第49-66页
        3.3.1 样本RNA的质量评价第49页
        3.3.2 转录组测序的基本结果第49-50页
        3.3.3 Unigene的功能注释第50-51页
        3.3.4 Unigene的GO功能注释第51-52页
        3.3.5 Unigene的KOG注释第52-53页
        3.3.6 Unigene的KEGG分类第53-54页
        3.3.7 航天诱变株系与对照株系的对比研究第54-55页
        3.3.8 差异表达基因的GO富集分析第55-59页
        3.3.9 差异表达基因的KEGG注释第59-62页
        3.3.10 差异表达基因的KEGG通路富集分析第62-65页
        3.3.11 转录组分析的qRT-PCR验证第65-66页
    3.4 讨论第66-69页
        3.4.1 转录组测序的结果分析第66-67页
        3.4.2 航天诱变株系与对照株系之间的差异分析第67页
        3.4.3 航天诱变株系的变异机制第67-69页
第四章 航天诱变决明株系QC46的蛋白质组学研究第69-90页
    4.1 引言第69页
    4.2 材料与方法第69-71页
        4.2.1 实验材料第69-70页
        4.2.2 蛋白的质谱鉴定及分析第70页
        4.2.3 决明叶片叶绿素含量的测定第70-71页
        4.2.4 实时荧光定量PCR分析第71页
        4.2.5 转录组与蛋白质组学联合分析第71页
    4.3 结果与分析第71-87页
        4.3.1 质谱鉴定的基本结果第71-73页
        4.3.2 QC46与对照之间的差异表达蛋白第73-75页
        4.3.3 差异表达蛋白质的GO分析第75-78页
        4.3.4 差异表达蛋白的KEGG通路注释第78-80页
        4.3.5 差异表达蛋白的KEGG富集分析第80-82页
        4.3.6 差异表达蛋白的聚类分析第82-83页
        4.3.7 叶绿素含量的测定第83-84页
        4.3.8 蛋白质组分析的qRT-PCR验证第84页
        4.3.9 转录组和蛋白质组学联合分析第84-86页
        4.3.10 基于差异表达基因和差异表达蛋白的蒽醌类代谢途径研究第86-87页
    4.4 讨论第87-90页
        4.4.1 Labelfree蛋白质组学鉴定结果分析第87-88页
        4.4.2 QC46与对照株系之间差异表达蛋白的分析第88-89页
        4.4.3 航天诱变株系QC46的变异机制分析第89-90页
第五章 决明萘甲酸盐合成酶基因的克隆及功能研究第90-109页
    5.1 引言第90页
    5.2 材料与方法第90-98页
        5.2.1 实验材料第90-91页
        5.2.2 决明萘甲酸盐合成酶基因的克隆及分析第91-94页
        5.2.3 决明毛状根遗传转化体系的构建第94-95页
        5.2.4 过表达和反义表达SoMenB基因的载体构建第95-96页
        5.2.5 重组质粒转化发根农杆菌ATCC15834第96页
        5.2.6 决明转基因毛状根的鉴定第96-97页
        5.2.7 转基因毛状根中次生代谢物含量的测定第97页
        5.2.8 转基因毛状根中基因表达量的检测第97-98页
    5.3 结果与分析第98-107页
        5.3.1 SoMenB基因的克隆及结构分析第98-100页
        5.3.2 SoMenB蛋白的系统进化分析第100-101页
        5.3.3 SoMenB蛋白的亚细胞定位第101-102页
        5.3.4 SoMenB基因的时空特异性表达模式第102页
        5.3.5 决明毛状根遗传转化体系的建立第102-104页
        5.3.6 决明转基因毛状根的鉴定第104-105页
        5.3.7 转基因毛状根的形态特征及次生代谢物含量分析第105-106页
        5.3.8 转基因毛状根中基因表达水平的变化第106-107页
    5.4 讨论第107-109页
        5.4.1 决明子中的蒽醌类物质的功效第107页
        5.4.2 SoMenB参与决明中蒽醌类物质的生物合成第107-108页
        5.4.3 决明转基因体系的探讨第108-109页
第六章 结论与创新点第109-111页
    6.1 结论第109-110页
    6.2 创新点第110页
    6.3 展望第110-111页
参考文献第111-123页
附录第123-126页
致谢第126-127页
个人简介第127页

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