| 中文摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 第一章 绪论 | 第9-25页 |
| 1.1 课题研究的背景及意义 | 第9-10页 |
| 1.2 国内外研究现状与发展动态 | 第10-15页 |
| 1.2.1 用于环境微生物的分子生物学技术 | 第10-12页 |
| 1.2.2 除磷微生物简介 | 第12-14页 |
| 1.2.3 除磷菌研究现状 | 第14-15页 |
| 1.3 PCR-DGGE技术简介 | 第15-22页 |
| 1.3.1 环境样品基因组DNA的提取与纯化 | 第15-17页 |
| 1.3.2 聚合酶链式(PCR)反应 | 第17-20页 |
| 1.3.3 变性梯度凝胶电泳技术原理及应用 | 第20-22页 |
| 1.4 生物多样性及微生物种类鉴定 | 第22-24页 |
| 1.4.1 生物多样性 | 第22-23页 |
| 1.4.2 DNA片段克隆测序 | 第23-24页 |
| 1.5 主要研究目的与内容 | 第24-25页 |
| 第二章 研究的技术路线、方法和材料 | 第25-34页 |
| 2.1 研究的技术路线 | 第25页 |
| 2.2 常规实验项目分析和测定方法 | 第25-26页 |
| 2.3 污泥样品的预处理与总细菌DNA的提取纯化 | 第26-27页 |
| 2.3.1 样品预处理 | 第26页 |
| 2.3.2 基因组DNA的提取 | 第26-27页 |
| 2.4 样品DNA的PCR扩增 | 第27-29页 |
| 2.4.1 总细菌的降落式PCR扩增 | 第27-28页 |
| 2.4.2 聚磷菌的嵌套式PCR(Nested PCR)扩增 | 第28-29页 |
| 2.4.3 PCR扩增所用试剂 | 第29页 |
| 2.5 基因组DNA及PCR扩增产物检测 | 第29-30页 |
| 2.5.1 基因组DNA提取产物检测 | 第30页 |
| 2.5.2 PCR扩增结果检测 | 第30页 |
| 2.5.3 琼脂糖电泳所用试剂 | 第30页 |
| 2.6 PCR产物的变性梯度凝胶电泳分析 | 第30-32页 |
| 2.6.1 操作步骤 | 第30-31页 |
| 2.6.2 DGGE试剂和配制 | 第31-32页 |
| 2.7 DGGE凝胶片段的回收及克隆测序 | 第32页 |
| 2.8 多样性的信息度量Shannon-Wiener指数 | 第32-33页 |
| 2.9 DGGE图谱中的相似性分析和聚类分析 | 第33页 |
| 2.10 主要实验仪器 | 第33-34页 |
| 第三章 MBR和常规污水处理系统微生物群落结构分析 | 第34-50页 |
| 3.1 工艺描述与取样条件 | 第34-38页 |
| 3.1.1 工艺概述 | 第34-36页 |
| 3.1.2 污水处理厂运行工况 | 第36-37页 |
| 3.1.3 取样条件及样品编号 | 第37-38页 |
| 3.2 活性污泥样品基因组DNA提取 | 第38页 |
| 3.3 总细菌群落结构分析 | 第38-46页 |
| 3.3.1 总细菌DNA的PCR扩增 | 第38-39页 |
| 3.3.2 总细菌变性梯度凝胶电泳分析 | 第39-42页 |
| 3.3.3 总细菌Shannon-Wiener多样性指数分析 | 第42-43页 |
| 3.3.4 总细菌DGGE图谱相似性分析 | 第43-46页 |
| 3.4 部分优势菌属DNA片段克隆测序分析和菌种鉴定 | 第46-48页 |
| 3.4.1 回收DNA的PCR扩增 | 第46页 |
| 3.4.2 切胶回收克隆测序和细菌系统发育树分析 | 第46-48页 |
| 3.5 本章小结 | 第48-50页 |
| 第四章 除磷菌种群结构多样性的对比研究 | 第50-75页 |
| 4.1 放线菌种群结构分析 | 第50-57页 |
| 4.1.1 放线菌DNA的嵌套式PCR扩增 | 第50-51页 |
| 4.1.2 放线菌扩增产物变性梯度凝胶电泳分析 | 第51-53页 |
| 4.1.3 放线菌的Shannon-Wiener多样性指数分析 | 第53-54页 |
| 4.1.4 放线菌DGGE图谱相似性分析 | 第54-57页 |
| 4.2 酸杆菌种群结构分析 | 第57-63页 |
| 4.2.1 酸杆菌DNA的嵌套式PCR扩增 | 第57-58页 |
| 4.2.2 酸杆菌扩增产物变性梯度凝胶电泳分析 | 第58-60页 |
| 4.2.3 酸杆菌的Shannon-Wiener多样性指数分析 | 第60-61页 |
| 4.2.4 酸杆菌DGGE图谱相似性分析 | 第61-63页 |
| 4.3 α-变形杆菌种群结构分析 | 第63-68页 |
| 4.3.1 α-变形杆菌DNA的嵌套式PCR扩增 | 第63-64页 |
| 4.3.2 α-变形杆菌扩增产物变性梯度凝胶电泳分析 | 第64-66页 |
| 4.3.3 α-变形杆菌Shannon-Wiener多样性指数分析 | 第66页 |
| 4.3.4 α-变形杆菌DGGE图谱相似性分析 | 第66-68页 |
| 4.4 β-变形杆菌种群结构分析 | 第68-73页 |
| 4.4.1 β-变形杆菌的嵌套式PCR扩增 | 第68-69页 |
| 4.4.2 β-变形杆菌第二轮PCR产物的变性梯度凝胶电泳分析 | 第69-71页 |
| 4.4.3 β-变形杆菌Shannon-Wiener多样性指数分析 | 第71页 |
| 4.4.4 β-变形杆菌的DGGE图谱相似性分析 | 第71-73页 |
| 4.5 本章小结 | 第73-75页 |
| 第五章 结论和建议 | 第75-78页 |
| 5.1 结论 | 第75-76页 |
| 5.2 建议 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-84页 |
| 发表论文和科研情况说明 | 第84-85页 |
| 致谢 | 第85页 |
