| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-22页 |
| 1.1 苹果炭疽病简介 | 第13页 |
| 1.2 葡萄炭疽病简介 | 第13-14页 |
| 1.3 炭疽病病原菌分类 | 第14-16页 |
| 1.3.1 炭疽菌属的分类 | 第14-15页 |
| 1.3.2 炭疽菌种的分类 | 第15-16页 |
| 1.3.3 国内炭疽菌属和种的分类研究 | 第16页 |
| 1.4 胶孢炭疽菌 | 第16-17页 |
| 1.5 尖孢炭疽菌 | 第17-18页 |
| 1.6 分子生物学技术在炭疽菌分类中的应用 | 第18-20页 |
| 1.6.1 常用的分子生物学技术 | 第18-19页 |
| 1.6.2 常用的分子生物学技术优缺点比较 | 第19-20页 |
| 1.6.3 各种分子标记在炭疽菌分类中的应用 | 第20页 |
| 1.7 本研究的目的和意义 | 第20-22页 |
| 第二章 材料与方法 | 第22-36页 |
| 2.1 样本的采集 | 第22页 |
| 2.2 病原菌的分离和纯化 | 第22页 |
| 2.3 致病性测定 | 第22-23页 |
| 2.4 病原菌的形态鉴定 | 第23页 |
| 2.4.1 菌落形态观察和测定 | 第23页 |
| 2.4.2 分生孢子形态、大小观察和测量 | 第23页 |
| 2.4.3 附着胞的观察 | 第23页 |
| 2.5 病原菌的分子鉴定 | 第23-30页 |
| 2.5.1 试剂 | 第23-24页 |
| 2.5.2 仪器 | 第24页 |
| 2.5.3 主要溶液及培养基的配制 | 第24-25页 |
| 2.5.4 改良CTAB 法提取基因组DNA | 第25-26页 |
| 2.5.5 rDNA-ITS 序列PCR 扩增 | 第26页 |
| 2.5.6 rDNA-ITSPCR 扩增产物测序 | 第26-27页 |
| 2.5.7 ITS 序列数据分析和系统树的构建 | 第27-28页 |
| 2.5.8 多基因序列PCR 扩增 | 第28-29页 |
| 2.5.9 多基因PCR 扩增产物测序 | 第29页 |
| 2.5.10 多基因序列数据分析和系统树的构建 | 第29-30页 |
| 2.6 苹果炭疽菌的SSR 引物设计和初步筛选 | 第30-36页 |
| 2.6.1 供试菌株 | 第30页 |
| 2.6.2 半简并引物扩增 | 第30-31页 |
| 2.6.3 目的片段的回收 | 第31-32页 |
| 2.6.4 感受态细胞的制备（0.1MCaCl_2 法） | 第32页 |
| 2.6.5 连接转化 | 第32-33页 |
| 2.6.6 菌落PCR 鉴定 | 第33页 |
| 2.6.7 质粒的提取 | 第33-34页 |
| 2.6.8 SSR 引物的设计和合成 | 第34页 |
| 2.6.9 SSR 引物筛选 | 第34-36页 |
| 第三章 结果与分析 | 第36-56页 |
| 3.1 标本的采集、分离和保存 | 第36页 |
| 3.2 致病性的测定 | 第36页 |
| 3.3 菌株的形态鉴定 | 第36-38页 |
| 3.4 菌株的分子鉴定 | 第38-42页 |
| 3.4.1 rDNA-ITS 序列PCR 扩增产物的检测 | 第38页 |
| 3.4.2 rDNA-ITS 系统发育树 | 第38-40页 |
| 3.4.3 多基因PCR 扩增产物的检测 | 第40-41页 |
| 3.4.4 多基因序列系统发育树 | 第41-42页 |
| 3.5 种类描述 | 第42-51页 |
| 3.5.1 果生炭疽菌Colletotrichum fructicola Prihastuti, L. Cai & K.D. Hyde，Fungal Diversity 39：96，国内新纪录种（图3-8） | 第42-43页 |
| 3.5.2 暹罗炭疽菌Colletotrichum siamense Prihastuti, L. Cai & K.D. Hyde，Fungal Diversity 39：98，国内新纪录种（图3-9） | 第43-44页 |
| 3.5.3 海水仙炭疽菌Colletotrichum hymenocallidis Y.L. Yang, Zuo Y. Liu, K.D. Hyde & L. Cai,Fungal Diversity 39：138（图3-10） | 第44-46页 |
| 3.5.4 松针炭疽菌Colletotrichum fioriniae (Marcelino & Gouli) R.G. Shivas & Y.P.Tan，Fungal Diversity 39：117，国内新纪录种（图3-11） | 第46-47页 |
| 3.5.5 眉县炭疽菌Colletotrichum meixiane R. Qin & R. Zhang, sp. nov.，新种（图3- | 第47-48页 |
| 3.5.6 降帐炭疽菌Colletotrichum jiangzeis R. Qin & R. Zhang, sp. nov.，新种（图3- | 第48-50页 |
| 3.5.7 葡萄炭疽菌Colletotrichum vitise R. Qin & R. Zhang, sp. nov.，新种（图3- | 第50-51页 |
| 3.6 SSR 引物设计和初步筛选 | 第51-56页 |
| 3.6.1 半简并引物的扩增结果 | 第51-52页 |
| 3.6.2 半简并引物测序结果 | 第52-53页 |
| 3.6.3 SSR 引物设计结果 | 第53-54页 |
| 3.6.4 半简并引物筛选结果 | 第54-56页 |
| 第四章 结论与讨论 | 第56-59页 |
| 4.1 讨论 | 第56-58页 |
| 4.1.1 标本的采集、分离和保存 | 第56页 |
| 4.1.2 病原学鉴定 | 第56-57页 |
| 4.1.3 多基因序列分析 | 第57页 |
| 4.1.4 SSR 引物设计 | 第57-58页 |
| 4.2 结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 作者简介 | 第64页 |
