| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第13-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-22页 |
| 1.1 犬细小病毒 | 第14-17页 |
| 1.1.1 病毒学分类及病毒结构 | 第14-15页 |
| 1.1.2 流行和进化 | 第15-16页 |
| 1.1.3 与宿主相互作用研究进展 | 第16-17页 |
| 1.1.3.1 CPV依赖宿主复制 | 第16-17页 |
| 1.1.3.2 CPV对宿主嗜性及致病性 | 第17页 |
| 1.2 iTRAQ及其在病毒研究中的应用 | 第17-21页 |
| 1.2.1 蛋白质组学概述 | 第17-18页 |
| 1.2.2 iTRAQ概述 | 第18-19页 |
| 1.2.3 iTRAQ在病毒研究中的应用 | 第19-21页 |
| 1.3 研究目的和意义 | 第21-22页 |
| 第二章 犬细小病毒中国东北部流行病学调查 | 第22-35页 |
| 2.1 材料和方法 | 第22-24页 |
| 2.1.1 试剂及耗材 | 第22页 |
| 2.1.2 主要仪器 | 第22页 |
| 2.1.3 主要软件 | 第22页 |
| 2.1.4 样品采集 | 第22-23页 |
| 2.1.5 VP2基因全长扩增、测序及序列拼接 | 第23页 |
| 2.1.6 分析突变位点及病毒的基因分型 | 第23页 |
| 2.1.7 预测突变位点选择压力 | 第23页 |
| 2.1.8 遗传进化分析 | 第23-24页 |
| 2.2 结果 | 第24-32页 |
| 2.2.1 样品测序结果 | 第24页 |
| 2.2.2 氨基酸位点突变情况及病毒的基因分型 | 第24-28页 |
| 2.2.3 选择压力预测 | 第28-29页 |
| 2.2.4 遗传进化分析 | 第29-32页 |
| 2.3 讨论 | 第32-33页 |
| 2.4 小结 | 第33-35页 |
| 第三章 F81细胞感染CPV流行毒株与疫苗毒株的比较蛋白质组学分析 | 第35-53页 |
| 3.1 材料和方法 | 第35-41页 |
| 3.1.1 试剂及耗材 | 第35页 |
| 3.1.2 主要仪器 | 第35页 |
| 3.1.3 主要软件 | 第35-36页 |
| 3.1.4 溶液配制 | 第36页 |
| 3.1.5 样品制备 | 第36-37页 |
| 3.1.5.1 细胞样品收集 | 第36-37页 |
| 3.1.5.2 蛋白质提取及粗定量 | 第37页 |
| 3.1.6 iTRAQ定量 | 第37-40页 |
| 3.1.6.1 样品蛋白酶解 | 第37页 |
| 3.1.6.2 iTRAQ标记 | 第37-38页 |
| 3.1.6.3 反向色谱分离酶解肽段 | 第38页 |
| 3.1.6.4 纳升级反相色谱联合质谱分析 | 第38-39页 |
| 3.1.6.5 蛋白质鉴定 | 第39-40页 |
| 3.1.6.6 差异蛋白质的筛选和定量 | 第40页 |
| 3.1.7 差异蛋白质定量数据生物信息学解析 | 第40-41页 |
| 3.1.7.1 差异蛋白质层次聚类 | 第40页 |
| 3.1.7.2 差异蛋白质功能注释 | 第40-41页 |
| 3.1.7.3 差异蛋白质功能富集分析 | 第41页 |
| 3.1.7.4 差异蛋白质通路富集分析 | 第41页 |
| 3.2 结果 | 第41-48页 |
| 3.2.1 样品收集及蛋白质粗定量 | 第41-43页 |
| 3.2.2 差异蛋白质鉴定及定量 | 第43-44页 |
| 3.2.3 差异蛋白层次聚类 | 第44页 |
| 3.2.4 差异蛋白功能注释 | 第44-45页 |
| 3.2.5 差异蛋白质功能富集分析 | 第45-47页 |
| 3.2.6 差异蛋白质通路富集分析 | 第47-48页 |
| 3.3 讨论 | 第48-51页 |
| 3.4 小结 | 第51-53页 |
| 第四章 F81细胞感染CPV流行毒株不同时间点比较蛋白质组学分析 | 第53-69页 |
| 4.1 材料和方法 | 第53-57页 |
| 4.1.1 试剂及耗材 | 第53页 |
| 4.1.2 主要仪器 | 第53页 |
| 4.1.3 主要软件 | 第53页 |
| 4.1.4 溶液配制 | 第53-54页 |
| 4.1.5 样品制备 | 第54页 |
| 4.1.6 iTRAQ定量 | 第54页 |
| 4.1.7 差异蛋白质定量数据生物信息学解析 | 第54-56页 |
| 4.1.7.1 差异蛋白质韦恩分析 | 第54-55页 |
| 4.1.7.2 差异蛋白质层次聚类 | 第55页 |
| 4.1.7.3 差异蛋白质功能注释 | 第55页 |
| 4.1.7.4 差异蛋白质功能富集分析 | 第55页 |
| 4.1.7.5 差异蛋白质通路富集分析 | 第55-56页 |
| 4.1.8 差异蛋白质多时间点表达差异验证 | 第56-57页 |
| 4.1.8.1 样品制备 | 第56页 |
| 4.1.8.2 SDS-PAGE电泳 | 第56页 |
| 4.1.8.3 免疫印迹 | 第56-57页 |
| 4.1.8.4 图像分析 | 第57页 |
| 4.2 结果 | 第57-63页 |
| 4.2.1 样品收集及蛋白质粗定量 | 第57页 |
| 4.2.2 差异蛋白的鉴定及定量 | 第57-58页 |
| 4.2.3 差异蛋白层次聚类 | 第58-59页 |
| 4.2.4 差异蛋白功能注释 | 第59-60页 |
| 4.2.5 差异蛋白质功能富集分析 | 第60-61页 |
| 4.2.6 差异蛋白质通路富集分析 | 第61-62页 |
| 4.2.7 差异蛋白质多时间点表达差异验证 | 第62-63页 |
| 4.3 讨论 | 第63-68页 |
| 4.4 小结 | 第68-69页 |
| 第五章 结论 | 第69-71页 |
| 5.1 本论文主要结论 | 第69页 |
| 5.2 本论文创新点 | 第69-70页 |
| 5.3 尚待进一步解决的问题 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-85页 |
| 致谢 | 第85-86页 |
| 作者简历 | 第86-87页 |