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基于MS-HRM方法检测非小细胞肺癌相关基因的启动子甲基化的初步应用

中文摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第9-16页
    1.1 非小细胞肺癌简介第9-10页
    1.2 非小细胞肺癌诊断的研究进展第10-11页
    1.3 DNA甲基化及MS-HRM方法简介第11-13页
    1.4 非小细胞肺癌相关基因第13-14页
    1.5 课题的提出和主要内容第14-16页
        1.5.1 课题的提出第14-15页
        1.5.2 主要研究内容第15-16页
第二章 甲基化敏感的高分辨率熔解曲线(MS-HRM)方法的建立第16-29页
    2.1 材料和试剂第16-17页
        2.1.1 实验试剂第16-17页
        2.1.2 实验仪器、耗材第17页
    2.2 实验方法第17-21页
        2.2.1 DNA样品的准备第17页
        2.2.2 全基因组DNA模板的亚硫酸盐转化处理第17-19页
        2.2.3 引物的设计及合成第19-20页
        2.2.4 MS-HRM实验条件的优化第20页
        2.2.5 MS-HRM标准曲线的建立第20-21页
    2.3 实验结果与讨论第21-28页
        2.3.1 六个基因的MS-HRM反应条件优化结果第21-23页
        2.3.2 MS-HRM标准曲线的建立第23-28页
    2.4 本章小结第28-29页
第三章 MS-HRM方法在检测临床病人组织样本中的应用第29-42页
    3.1 材料和试剂第30页
        3.1.1 实验试剂第30页
        3.1.2 实验仪器、耗材第30页
    3.2 实验方法第30-36页
        3.2.1 非小细胞肺癌病人组织样本的收集第31页
        3.2.2 组织中RNA/DNA的提取第31-33页
        3.2.3 全基因组DNA样品的亚硫酸盐转化处理第33-34页
        3.2.4 转化后的样本DNA的全基因组扩增第34-36页
        3.2.5 等温扩增标准品模板的稀释条件第36页
        3.2.6 组织DNA样本的MS-HRM实验第36页
        3.2.7 各基因的甲基化检出率与临床关系评价第36页
    3.3 实验结果与讨论第36-41页
        3.3.1 等温扩增标准品模板稀释条件的选择第36-38页
        3.3.2 组织样本DNA的甲基化检测结果第38-41页
    3.4 本章小结第41-42页
第四章 焦磷酸测序和ROC分析对MS-HRM方法的验证第42-55页
    4.1 材料和试剂第42-44页
        4.1.1 实验试剂第42-43页
        4.1.2 实验仪器、耗材第43-44页
    4.2 实验方法第44-46页
        4.2.1 甲基化水平的定量计算第44页
        4.2.2 焦磷酸测序对MS-HRM的验证第44-46页
        4.2.3 对基因甲基化程度的ROC曲线分析第46页
    4.3 实验结果与讨论第46-54页
        4.3.1 甲基化水平的定量计算结果第46-48页
        4.3.2 用于焦磷酸检测的目的片段的扩增条件第48页
        4.3.3 扩增产物的电泳结果第48-49页
        4.3.4 焦磷酸测序结果与MS-HRM方法的比较第49-53页
        4.3.5 ROC曲线评价及多基因联合检测结果第53-54页
    4.4 本章小结第54-55页
结论与创新第55-57页
参考文献第57-62页
致谢第62-63页
个人简历第63-64页
在学期间的研究成果及发表的学术论文第64页

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