| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 第一章 文献综述 | 第7-18页 |
| 1 引言 | 第7页 |
| 2 猪肉品质评价指标 | 第7-8页 |
| 2.1 pH值和肌糖原含量 | 第7-8页 |
| 2.2 系水力 | 第8页 |
| 2.3 肉色 | 第8页 |
| 3 几种常见的劣质肉 | 第8-9页 |
| 3.1 PSE肉 | 第8-9页 |
| 3.2 DFD肉 | 第9页 |
| 3.3 RSE肉 | 第9页 |
| 4 影响猪肉品质的因素 | 第9页 |
| 5 猪肉品质的遗传解析 | 第9-16页 |
| 5.1 遗传解析技术进展 | 第9-11页 |
| 5.1.1 候选基因法及连锁分析法 | 第10页 |
| 5.1.2 GWAS | 第10页 |
| 5.1.3 QTL到QTN | 第10-11页 |
| 5.1.4 解析性状及运用 | 第11页 |
| 5.2 猪肉肉质性状的QTL定位 | 第11-12页 |
| 5.3 猪肉质性状的主效基因 | 第12-16页 |
| 5.3.1 HAL基因 | 第12-13页 |
| 5.3.2 PRKAG3基因 | 第13-15页 |
| 5.3.3 IGF2基因 | 第15-16页 |
| 5.3.4 PHKG1基因 | 第16页 |
| 6 本研究的目的和意义 | 第16-18页 |
| 6.1 研究目的 | 第16-17页 |
| 6.2 研究意义 | 第17-18页 |
| 第二章 | 第18-38页 |
| 1 前言 | 第18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-22页 |
| 2.1 实验动物 | 第18页 |
| 2.2 表型测定 | 第18-19页 |
| 2.3 DNA样品的制备及质量检测、全基因组60K SNP芯片扫描及质控 | 第19页 |
| 2.4 统计分析方法与模型 | 第19-20页 |
| 2.4.1 肉质性状简单统计及相关性分析 | 第19-20页 |
| 2.4.2 全基因组关联分析 | 第20页 |
| 2.4.3 群体层化分析 | 第20页 |
| 2.4.4 单倍型框的构建 | 第20页 |
| 2.5 位置候选基因的鉴别研究 | 第20-22页 |
| 2.5.1 位置候选基因的筛选 | 第20-21页 |
| 2.5.2 QTL_1区域位置候选基因PRKAG3关键突变位点鉴别 | 第21页 |
| 2.5.3 QTL_2区域位置候选基因FASTKD2、MDH1B关键突变位点的鉴别 | 第21-22页 |
| 3 结果与分析 | 第22-34页 |
| 3.1 杜长大群体10个肉质性状的表型变异分析 | 第22-23页 |
| 3.2 杜长大10个肉质性状间的相关性分析 | 第23-24页 |
| 3.3 群体层化分析结果 | 第24页 |
| 3.4 杜长大肉质性状全基因组关联分析结果 | 第24-26页 |
| 3.4.1 不同肉质性状的GWAS结果 | 第24-25页 |
| 3.4.2 推断15号染色体上两个相互独立的QTL | 第25-26页 |
| 3.5 单倍型框分析结果 | 第26-27页 |
| 3.6 QTL_1解析 | 第27-31页 |
| 3.6.1 PRKAG3基因两个已知错义突变位点效应分析 | 第27-28页 |
| 3.6.2 QTL_1区域内新增13个多态位点与肉质性状相关性分析 | 第28-31页 |
| 3.7 QTL_2解析 | 第31-34页 |
| 3.7.1 QTL_2区域新增SNP标记后的分析结果 | 第31-33页 |
| 3.7.2 候选基因FASTKD2多态位点与肉质性状相关性分析 | 第33-34页 |
| 3.7.3 候选基因MDH1B多态位点与肉质性状相关性分析 | 第34页 |
| 4 分析与讨论 | 第34-37页 |
| 4.1 杜长大猪肉质特性及遗传力 | 第34页 |
| 4.2 对QTL_1的解析 | 第34-35页 |
| 4.3 对QTL_2的解析 | 第35页 |
| 4.4 对候选基因PRKAG3的解析 | 第35-36页 |
| 4.5 对候选基因FASTKD2、MDH1B的研究 | 第36-37页 |
| 5 小结 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-44页 |
| 致谢 | 第44-45页 |
| 攻读硕士期间发表的论文 | 第45页 |
