| 摘要 | 第3-6页 |
| abstract | 第6-9页 |
| 第1章 引言 | 第13-19页 |
| 1.1 概述 | 第13页 |
| 1.2 家族性高胆固醇血症的发病机制和致病基因 | 第13-14页 |
| 1.3 RNA剪接 | 第14-16页 |
| 1.4 剪接突变的生物信息学预测方法 | 第16-19页 |
| 第2章 材料与方法 | 第19-36页 |
| 2.1 gkm-SVM预测模型的建立 | 第19-25页 |
| 2.1.1 数据来源 | 第19-21页 |
| 2.1.2 训练集和测试集组成 | 第21-22页 |
| 2.1.3 gkm-SVM和deltaSVM | 第22-23页 |
| 2.1.4 评估gkm-SVM的预测性能 | 第23-24页 |
| 2.1.5 gkm-SVM与其它方法的比较 | 第24-25页 |
| 2.2 基于Shiny框架建立splicesites可视化界面 | 第25页 |
| 2.3 FH相关剪接突变的筛查 | 第25页 |
| 2.4 FH相关剪接突变的minigene功能验证 | 第25-36页 |
| 2.4.1 实验材料 | 第25-27页 |
| 2.4.2 试剂配制 | 第27-28页 |
| 2.4.3 实验方法 | 第28-36页 |
| 第3章 结果 | 第36-54页 |
| 3.1 建立gkm-SVM剪接预测模型 | 第36-39页 |
| 3.1.1 模型训练 | 第36-38页 |
| 3.1.2 模型测试 | 第38-39页 |
| 3.2 gkm-SVM对剪接突变的预测性能 | 第39-42页 |
| 3.2.1 评估gkm-SVM对剪接突变的预测性能 | 第39-41页 |
| 3.2.2 gkm-SVM方法与其它方法的比较 | 第41-42页 |
| 3.3 基于shiny框架的splicesites可视化界面 | 第42-44页 |
| 3.4 筛查FH相关剪接突变 | 第44-51页 |
| 3.5 minigene结果分析 | 第51-54页 |
| 第4章 讨论 | 第54-58页 |
| 4.1 建立gkm-SVM预测方案 | 第54-55页 |
| 4.2 筛查FH相关剪接突变 | 第55-56页 |
| 4.3 minigene功能验证 | 第56-58页 |
| 第5章 结论 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-64页 |
| 综述 预测剪接位点的生物信息学方法研究进展 | 第64-73页 |
| 参考文献 | 第71-73页 |
