| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 符号对照表 | 第10-11页 |
| 缩略语对照表 | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-20页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第14-16页 |
| 1.2 国内外的研究现状 | 第16-17页 |
| 1.3 本文的主要工作 | 第17-18页 |
| 1.4 本文的结构安排 | 第18-20页 |
| 第二章 长非编码RNA与mRNA识别的相关基础 | 第20-34页 |
| 2.1 长非编码RNA和mRNA数据 | 第20-23页 |
| 2.2 长非编码RNA和mRNA的生物检测方法 | 第23-24页 |
| 2.3 长非编码RNA与mRNA识别方法 | 第24-27页 |
| 2.3.1 CNCI识别方法 | 第26页 |
| 2.3.2 CPC识别方法 | 第26页 |
| 2.3.3 CSF识别方法 | 第26-27页 |
| 2.4 支持向量机介绍 | 第27-33页 |
| 2.5 本章小结 | 第33-34页 |
| 第三章 基于ME和k-mer的长非编码RNA与mRNA识别方法 | 第34-44页 |
| 3.1 基于k-mer的识别算法简介 | 第34-37页 |
| 3.1.1 k-mer的生物定义 | 第34-35页 |
| 3.1.2 改进的k-mer统计方法 | 第35-37页 |
| 3.1.3 算法总结 | 第37页 |
| 3.2 最大熵方法简介 | 第37-42页 |
| 3.2.1 信息熵的定义 | 第38页 |
| 3.2.2 一个简单的例子 | 第38-39页 |
| 3.2.3 最大熵方法 | 第39-42页 |
| 3.2.4 算法总结 | 第42页 |
| 3.3 基于ME和k-mer的长非编码RNA和mRNA识别算法 | 第42页 |
| 3.4 本章小结 | 第42-44页 |
| 第四章 实验结果与分析 | 第44-52页 |
| 4.1 实验平台 | 第44页 |
| 4.2 实验数据 | 第44-45页 |
| 4.3 基于ME和k-mer的识别算法的实验分析 | 第45-51页 |
| 4.3.1 基于ME的k-mer特征选择 | 第45-47页 |
| 4.3.2 跨物种实验分析 | 第47-49页 |
| 4.3.3 模拟indel数据实验分析 | 第49-50页 |
| 4.3.4 PacBio和454测序序列实验分析 | 第50-51页 |
| 4.4 本章小结 | 第51-52页 |
| 第五章 总结与展望 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 作者简介 | 第61-62页 |