| 英文缩略词对照表 | 第5-6页 |
| 中文摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 1 引言 | 第10-13页 |
| 2 实验材料与方法 | 第13-39页 |
| 2.1 实验材料 | 第13-17页 |
| 2.1.1 主要仪器 | 第13-14页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第14-15页 |
| 2.1.3 主要耗材 | 第15-16页 |
| 2.1.4 主要溶液的配制 | 第16-17页 |
| 2.2 实验方法 | 第17-39页 |
| 2.2.1 NDD相关基因信息统计学分析 | 第17-18页 |
| 2.2.2 NDD患儿样本的收集 | 第18-20页 |
| 2.2.3 制定XLNDD基因测序panel | 第20页 |
| 2.2.4 使用Ion AmpliSeqTM library Kit 2.0 完成文库（library）准备 | 第20-24页 |
| 2.2.5 文库扩增 | 第24-27页 |
| 2.2.6 富集样本-阳性ISPs | 第27-28页 |
| 2.2.7 创建运行程序 | 第28页 |
| 2.2.8 Ion PGMTM测序仪清洗 | 第28-32页 |
| 2.2.9 测序数据分析 | 第32-34页 |
| 2.2.10 采用Sanger测序和q-PCR完成可疑SNVs和CNVs验证 | 第34-36页 |
| 2.2.11 X染色体失活分析 | 第36-38页 |
| 2.2.12 可疑基因变异的致病性评估 | 第38-39页 |
| 3 实验结果 | 第39-52页 |
| 3.1 NDD相关基因及其变异在常染色体和X染色体的富集情况 | 第39-43页 |
| 3.1.1 NDD相关基因数、基因总长度和编码区域总长度在X染色体和常染色体的富集情况 | 第39页 |
| 3.1.2 IPA数据库中NDD表型相关基因数、基因总长度和基因编码区域总长度在X染色体和常染色体的富集情况 | 第39-41页 |
| 3.1.3 ClinVar和ExAC数据库中NDD相关基因LOF变异在X染色体和常染色体的富集情况 | 第41-42页 |
| 3.1.4 ClinGene数据库和中国患者中含有NDD基因的CNVs在常染色体和X染色体的富集情况 | 第42-43页 |
| 3.2 Ion Torrent平台靶向测序技术检测SNVs和CNVs流程的优化 | 第43-46页 |
| 3.2.1 Ion Torrent测序数据相关信息 | 第43-44页 |
| 3.2.2 分析阳性样本测序数据，获得合适的测序数据比对参数及变异识别参数 | 第44-45页 |
| 3.2.3 6 个SNVs阳性样本的实验室评估结果 | 第45页 |
| 3.2.4 5 个CNVs样本的实验室评估结果 | 第45-46页 |
| 3.3 100 例病因未明男性NDD患儿的检测结果 | 第46-52页 |
| 3.3.1 100 例病因未明的男性NDD患儿的病因诊断率 | 第46页 |
| 3.3.2 9 例患者携带致病性或可能致病性单核苷酸变异 | 第46-50页 |
| 3.3.3 一例患者携带致病性CNV | 第50-52页 |
| 4 讨论 | 第52-54页 |
| 5 结论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-63页 |
| 综述 | 第63-89页 |
| 参考文献 | 第78-89页 |
| 致谢 | 第89-90页 |
| 附录 | 第90页 |
