| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-20页 |
| 1.1 人体肠道微生物概述 | 第10-14页 |
| 1.1.1 人体肠道微生物的物种组成 | 第10页 |
| 1.1.2 人体肠道微生物的作用 | 第10-11页 |
| 1.1.3 人体肠道微生物的稳定性 | 第11-12页 |
| 1.1.4 人体肠道微生物与疾病的关系 | 第12-14页 |
| 1.1.5 人体肠道微生物研究前沿 | 第14页 |
| 1.2 肠道微生物的研究技术介绍 | 第14-16页 |
| 1.2.1 基于纯培养方法对肠道微生物的研究 | 第14-15页 |
| 1.2.2 基于非培养方法对肠道微生物的研究 | 第15-16页 |
| 1.3 人体肠道细菌的功能研究 | 第16-18页 |
| 1.3.1 基于细菌全基因组的分类研究 | 第16页 |
| 1.3.2 基于肠道细菌全基因组的功能分析 | 第16-17页 |
| 1.3.3 肠道新型益生菌的功能研究 | 第17-18页 |
| 1.4 本论文研究的内容和意义 | 第18-20页 |
| 第二章 人体肠道微生物多样性研究 | 第20-34页 |
| 2.1 样品收集 | 第20页 |
| 2.2 材料与方法 | 第20-27页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第20-22页 |
| 2.2.1.1 实验试剂 | 第20页 |
| 2.2.1.2 实验耗材 | 第20-21页 |
| 2.2.1.3 实验仪器 | 第21页 |
| 2.2.1.4 培养基 | 第21-22页 |
| 2.2.2 实验方法 | 第22-27页 |
| 2.2.2.1 肠道细菌的分离培养 | 第22-23页 |
| 2.2.2.2 菌种保藏 | 第23-24页 |
| 2.2.2.3 肠道细菌的分子生物学鉴定 | 第24-25页 |
| 2.2.2.4 肠道细菌全基因组测序 | 第25-27页 |
| 2.2.2.5 细菌全基因组比对 | 第27页 |
| 2.3 实验结果统计与分析 | 第27-32页 |
| 2.3.1 菌株分离鉴定统计 | 第27-29页 |
| 2.3.1.1 菌株分离培养统计 | 第27-28页 |
| 2.3.1.2 分离菌株的分子生物学鉴定结果 | 第28-29页 |
| 2.3.2 分离菌株的全基因组测序 | 第29-30页 |
| 2.3.2.1 全基因组测序菌株选取 | 第29页 |
| 2.3.2.2 基因组提取 | 第29页 |
| 2.3.2.2 测序菌株组装结果统计 | 第29-30页 |
| 2.3.3 基于全基因组序列的分类结果 | 第30-31页 |
| 2.3.4 讨论 | 第31-32页 |
| 2.3.4.1 不同培养基的分离效果分析 | 第31-32页 |
| 2.3.4.2 筛选菌株的物种多样性分析 | 第32页 |
| 2.4 小结 | 第32-34页 |
| 第三章 测序菌株的功能研究 | 第34-51页 |
| 3.1 材料与方法 | 第34-39页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第34-36页 |
| 3.1.1.1 实验试剂 | 第34页 |
| 3.1.1.2 实验耗材 | 第34页 |
| 3.1.1.3 实验仪器 | 第34页 |
| 3.1.1.4 培养基 | 第34-36页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第36-39页 |
| 3.1.2.1 菌株耐受性测试 | 第36-37页 |
| 3.1.2.2 菌株胆固醇降解能力测试 | 第37-38页 |
| 3.1.2.3 菌株胆盐水解酶活性测试 | 第38页 |
| 3.1.2.4 菌株活性代谢产物检测 | 第38-39页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第39-49页 |
| 3.2.1 基于全基因组序列的功能分析 | 第39-45页 |
| 3.2.1.1 菌株功能基因和代谢通路概览 | 第39-40页 |
| 3.2.1.2 菌株功能基因的特性分析 | 第40-44页 |
| 3.2.1.3 试验菌株选取 | 第44-45页 |
| 3.2.2 基于体外培养的功能研究 | 第45-49页 |
| 3.2.2.1 试验菌株的理化性质 | 第45-46页 |
| 3.2.2.2 试验菌株耐受性 | 第46-48页 |
| 3.2.2.3 菌株胆固醇降解能力及胆盐水解酶活性 | 第48页 |
| 3.2.2.4 菌株活性代谢产物分析 | 第48-49页 |
| 3.3 小结 | 第49-51页 |
| 结论与展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-63页 |
| 附录 | 第63-81页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
| 答辩委员会对论文的评定意见 | 第83页 |