| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-18页 |
| 1.1 流感病毒 | 第10-11页 |
| 1.1.1 流感病毒的结构 | 第10-11页 |
| 1.1.2 流感病毒的分类 | 第11页 |
| 1.1.3 抗流感药物研究现状 | 第11页 |
| 1.2 神经氨酸酶 | 第11-14页 |
| 1.2.1 神经氨酸酶的结构 | 第11-12页 |
| 1.2.2 NA活性位点 | 第12-14页 |
| 1.2.3 150-loop区 | 第14页 |
| 1.3 NA抑制剂的国内外研究现状 | 第14-17页 |
| 1.3.1 唾液酸类 | 第14页 |
| 1.3.2 苯甲酸类 | 第14-15页 |
| 1.3.3 吡咯烷类 | 第15页 |
| 1.3.4 环戊烷类 | 第15页 |
| 1.3.5 环己烯类 | 第15-16页 |
| 1.3.6 天然产物 | 第16-17页 |
| 1.4 本文的研究内容 | 第17-18页 |
| 第2章 理论基础及计算方法 | 第18-25页 |
| 2.1 分子对接概述 | 第18-21页 |
| 2.1.1 分子对接原理及原则 | 第18-19页 |
| 2.1.2 分子对接方法的分类 | 第19页 |
| 2.1.3 分子对接常用软件 | 第19-21页 |
| 2.2 分子动力学模拟 | 第21-24页 |
| 2.2.1 MD模拟的一般过程 | 第21页 |
| 2.2.2 分子动力学思想的演化过程 | 第21-22页 |
| 2.2.3 积分算法 | 第22-23页 |
| 2.2.4 系综 | 第23-24页 |
| 2.3 本章小结 | 第24-25页 |
| 第3章 奥司他韦及其衍生物与神经氨酸酶分子对接 | 第25-35页 |
| 3.1 引言 | 第25页 |
| 3.2 分子对接方法的验证 | 第25-30页 |
| 3.2.1 受体的选取和准备 | 第25-28页 |
| 3.2.2 分子对接的步骤 | 第28页 |
| 3.2.3 分子对接结果 | 第28-30页 |
| 3.3 奥司他韦衍生物的分子对接结果 | 第30-33页 |
| 3.3.1 配体的选取和准备 | 第30-31页 |
| 3.3.2 分子对接参数设置 | 第31页 |
| 3.3.3 分子对接结果 | 第31-33页 |
| 3.4 本章小结 | 第33-35页 |
| 第4章 奥司他韦及其衍生物与神经氨酸酶的分子动力学模拟 | 第35-51页 |
| 4.1 引言 | 第35页 |
| 4.2 GROMACS分子动力学模拟 | 第35-37页 |
| 4.3 分子动力学模拟结果分析 | 第37-49页 |
| 4.3.1 RMSD | 第37-38页 |
| 4.3.2 氢键分析 | 第38-41页 |
| 4.3.3 主成分分析 | 第41-45页 |
| 4.3.4 自由能面图 | 第45-48页 |
| 4.3.5 结合自由能 | 第48-49页 |
| 4.4 本章小结 | 第49-51页 |
| 结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-59页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60页 |