| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 前言 | 第12-21页 |
| 1.1 类风湿性关节炎概述 | 第12-13页 |
| 1.1.1 类风湿性关节炎简介 | 第12页 |
| 1.1.2 类风湿性关节炎研究进展 | 第12-13页 |
| 1.2 COMP概述 | 第13-15页 |
| 1.2.1 COMP简介 | 第13-14页 |
| 1.2.2 COMP的结构 | 第14页 |
| 1.2.3 COMP的生物学功能 | 第14-15页 |
| 1.3 α-烯醇化酶概述 | 第15-16页 |
| 1.3.1 α-烯醇化酶简介 | 第15页 |
| 1.3.2 α-烯醇化酶的生物学功能 | 第15-16页 |
| 1.4 抗原表位概述 | 第16-19页 |
| 1.4.1 抗原表位简介 | 第16-17页 |
| 1.4.2 抗原表位研究方法概述 | 第17页 |
| 1.4.3 T细胞抗原表位研究方法现状 | 第17-18页 |
| 1.4.4 B细胞抗原表位研究方法现状 | 第18-19页 |
| 1.5 分子动力学模拟概述 | 第19-20页 |
| 1.5.1 同源模建 | 第19页 |
| 1.5.2 分子动力学 | 第19-20页 |
| 1.6 本文的研究内容和意义 | 第20-21页 |
| 第二章 COMP蛋白的T细胞表位预测 | 第21-26页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-22页 |
| 2.1.1 目标蛋白选择 | 第21页 |
| 2.1.2 T细胞表位预测软件选择 | 第21-22页 |
| 2.1.3 实验方法和流程 | 第22页 |
| 2.3 结果与分析 | 第22-24页 |
| 2.3.1 COMP的T细胞抗原表位预测结果 | 第22-24页 |
| 2.3.2 其他基因型的T细胞抗原表位预测结果 | 第24页 |
| 2.4 本章小结 | 第24-26页 |
| 第三章 COMP-DR4复合物分子建模及模型评价 | 第26-37页 |
| 3.1 实验材料 | 第26-27页 |
| 3.1.1 目标蛋白序列和模板结构 | 第26页 |
| 3.1.2 计算机软件平台 | 第26-27页 |
| 3.2 实验方法和流程 | 第27-32页 |
| 3.2.1 模型的构建 | 第27-28页 |
| 3.2.2 COMP-DR4复合物结构优化和分子动力学模拟 | 第28-30页 |
| 3.2.3 COMP-DR4复合物模建结构评价结果分析 | 第30-32页 |
| 3.3 COMP多肽与HLA-DR4结合能力评价分析 | 第32-36页 |
| 3.3.1 COMP多肽与HLA-DR4的β1链的结合能力结果分析 | 第33页 |
| 3.3.2 COMP多肽与HLA-DR4的β-片层结构结合模式分析 | 第33-34页 |
| 3.3.3 COMP多肽与HLA-DR4的α1和β1链结合模式分析 | 第34-35页 |
| 3.3.4 COMP-多肽与HLA-DR4的结合能计算结果分析 | 第35-36页 |
| 3.4 本章小结 | 第36-37页 |
| 第四章 人源α-烯醇化酶抗原表位预测及交叉反应预测 | 第37-47页 |
| 4.1 实验材料 | 第37-38页 |
| 4.1.1 蛋白序列和晶体结构 | 第37-38页 |
| 4.2 实验方法和流程 | 第38-39页 |
| 4.3 人源α-烯醇化酶抗原表位预测及交叉反应预测结果与分析 | 第39-45页 |
| 4.3.1 人源α烯醇化酶蛋白的T细胞表位预测结果分析 | 第39-41页 |
| 4.3.2 人类α烯醇化酶蛋白的B细胞线性表位预测结果分析 | 第41-42页 |
| 4.3.3 人源α-烯醇化酶蛋白的B细胞构象表位预测结果分析 | 第42-43页 |
| 4.3.4 人源α-烯醇化酶的免疫交叉反应预测结果分析 | 第43-45页 |
| 4.4 本章小结 | 第45-47页 |
| 参考文献 | 第47-55页 |
| 附录1 攻读学位期间发表的学术论文 | 第55-56页 |
| 衷心感谢以下基金资助 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
