| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩略词表 | 第13-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-28页 |
| 1.1 研究意义 | 第14-15页 |
| 1.2 国内外研究现状及发展动态分析 | 第15-26页 |
| 1.2.1 MRSA的发展概况及耐药机制 | 第15-16页 |
| 1.2.2 MRSA分子分型与遗传进化分析 | 第16-22页 |
| 1.2.3 LA-MRSA对公共卫生安全的威胁日益加重 | 第22-23页 |
| 1.2.4 国外LA-MRSA研究进展 | 第23-24页 |
| 1.2.5 国内LA-MRSA研究进展 | 第24-26页 |
| 1.3 研究目标 | 第26页 |
| 1.4 研究内容与方法 | 第26-28页 |
| 1.4.1 我国不同地区猪源MRSA的流行情况调查 | 第26页 |
| 1.4.2 我国猪源MRSA分子分型研究 | 第26页 |
| 1.4.3 我国猪源MRSA耐药表型及耐药基因型分析 | 第26页 |
| 1.4.4 我国猪源MRSA流行克隆代表菌株完整基因组序列分析 | 第26-27页 |
| 1.4.5 我国猪源MRSA流行克隆基因组特征及遗传进化分析 | 第27-28页 |
| 第二章 我国猪源MRSA流行病学特征 | 第28-61页 |
| 2.1 前言 | 第28页 |
| 2.2 材料与方法 | 第28-44页 |
| 2.2.1 材料 | 第28-31页 |
| 2.2.2 方法 | 第31-44页 |
| 2.3 结果 | 第44-54页 |
| 2.3.1 样本采集情况与分离鉴定结果 | 第44页 |
| 2.3.2 猪源MRSA菌株PFGE分型结果 | 第44-52页 |
| 2.3.3 各地区猪源MRSA代表菌株MLST及spa分型结果 | 第52-54页 |
| 2.3.4 我国猪源MRSA耐药表型检测结果 | 第54页 |
| 2.3.5 我国猪源MRSA耐药基因型检测结果 | 第54页 |
| 2.4 讨论 | 第54-60页 |
| 2.4.1 样本采集与MRSA分离鉴定方法的选择 | 第54-56页 |
| 2.4.2 MRSA分子分型方法的选择与应用 | 第56页 |
| 2.4.3 我国猪源MRSA的流行情况 | 第56-57页 |
| 2.4.4 我国猪源MRSA的分子流行病学特征 | 第57-58页 |
| 2.4.5 我国猪源MRSA的耐药表型特征 | 第58-59页 |
| 2.4.6 我国猪源MRSA的耐药基因型特征 | 第59-60页 |
| 2.5 小结 | 第60-61页 |
| 第三章 猪源利福平不敏感MRSA流行特征及耐药机制研究 | 第61-74页 |
| 3.1 前言 | 第61页 |
| 3.2 材料与方法 | 第61-65页 |
| 3.2.1 材料 | 第61-62页 |
| 3.2.2 方法 | 第62-65页 |
| 3.3 结果 | 第65-70页 |
| 3.3.1 利福平不敏感猪源MRSA的流行情况 | 第65页 |
| 3.3.2 利福平不敏感猪源MRSA的耐药表型及耐药基因型 | 第65页 |
| 3.3.3 利福平不敏感猪源MRSA的分子分型 | 第65-70页 |
| 3.3.4 猪源MRSA利福平耐药遗传基础 | 第70页 |
| 3.4 讨论 | 第70-73页 |
| 3.4.1 我国猪源MRSA利福平不敏感菌株的流行情况 | 第70页 |
| 3.4.2 我国猪源MRSA利福平不敏感菌株的耐药表型及基因型特征 | 第70-71页 |
| 3.4.3 我国猪源MRSA利福平耐药的遗传基础 | 第71-72页 |
| 3.4.4 我国猪源利福平不敏感MRSA的分子分型特征 | 第72-73页 |
| 3.5 小结 | 第73-74页 |
| 第四章 我国猪源MRSA ST9流行克隆完整基因组特征 | 第74-86页 |
| 4.1 前言 | 第74页 |
| 4.2 材料与方法 | 第74-75页 |
| 4.2.1 材料 | 第74-75页 |
| 4.2.2 方法 | 第75页 |
| 4.3 结果 | 第75-83页 |
| 4.3.1 我国猪源MRSA ST9型流行克隆基因组特征 | 第75-78页 |
| 4.3.2 基因组序列比较 | 第78页 |
| 4.3.3 新型SCCmec结构 | 第78-83页 |
| 4.4 讨论 | 第83-85页 |
| 4.4.1 我国猪源MRSA ST9型菌株基因组特征 | 第83-84页 |
| 4.4.2 新型SCCmec结构 | 第84-85页 |
| 4.5 小结 | 第85-86页 |
| 第五章 我国猪源MRSA流行克隆基因组特征及遗传进化分析 | 第86-111页 |
| 5.1 前言 | 第86页 |
| 5.2 材料与方法 | 第86-91页 |
| 5.2.1 材料 | 第86-87页 |
| 5.2.2 方法 | 第87-91页 |
| 5.3 结果 | 第91-105页 |
| 5.3.1 种系进化分析 | 第91-95页 |
| 5.3.2 耐药基因流行情况 | 第95页 |
| 5.3.3 携带耐药基因的可移动遗传元件(MGE) | 第95-105页 |
| 5.3.4 毒力基因流行情况 | 第105页 |
| 5.4 讨论 | 第105-110页 |
| 5.4.1 WGS技术在病原菌流行病学研究中的应用 | 第105页 |
| 5.4.2 我国猪源MRSA遗传进化特征 | 第105-107页 |
| 5.4.3 我国猪源MRSA ST9流行克隆的SCCmec遗传元件发生结构转变 | 第107页 |
| 5.4.4 我国猪源MRSA中携带耐药基因可移动遗传元件流行现状 | 第107-108页 |
| 5.4.5 耐药基因水平转移加剧我国猪源MRSA多药耐药现状 | 第108-110页 |
| 5.5 小结 | 第110-111页 |
| 第六章 结论 | 第111-112页 |
| 创新点 | 第112-113页 |
| 参考文献 | 第113-125页 |
| 致谢 | 第125-126页 |
| 附录 | 第126-134页 |
| 个人简介 | 第134页 |
