| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第15-16页 |
| 第一章 引言 | 第16-27页 |
| 1.1 鸡传染性支气管炎概述 | 第16-18页 |
| 1.1.1 鸡传染性支气管炎病原学及形态学 | 第16页 |
| 1.1.2 鸡传染性支气管炎病毒基因组结构及其编码蛋白 | 第16-17页 |
| 1.1.3 鸡传染性支气管炎病毒分子流行病学 | 第17-18页 |
| 1.2 冠状病毒相关天然免疫研究进展 | 第18-22页 |
| 1.2.1 冠状病毒概述 | 第18-19页 |
| 1.2.2 宿主针对冠状病毒的天然免疫应答 | 第19-22页 |
| 1.3 新城疫病毒致病机制研究进展 | 第22-24页 |
| 1.3.1 新城疫概述 | 第22页 |
| 1.3.2 NDV的生物学特性 | 第22页 |
| 1.3.3 NDV分子致病机制 | 第22-24页 |
| 1.4 干扰素诱导跨膜蛋白的研究进展 | 第24-26页 |
| 1.4.1 病毒抑制因子—干扰素诱导蛋白 | 第24-25页 |
| 1.4.2 IFITM的发现 | 第25页 |
| 1.4.3 IFITM抗病毒研究进展 | 第25-26页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第26-27页 |
| 第二章 鸡传染性支气管炎病毒感染鸡肾脏转录组学分析. | 第27-47页 |
| 2.1 材料和方法 | 第28-30页 |
| 2.1.1 病毒和实验动物 | 第28页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第28页 |
| 2.1.3 主要实验仪器及软件 | 第28页 |
| 2.1.4 动物感染试验及样品采集 | 第28页 |
| 2.1.5 IBV抗体效价检测 | 第28页 |
| 2.1.6 Real-time RT-PCR检测肾脏中病毒载量 | 第28-29页 |
| 2.1.7 IBV感染鸡肾脏组织转录组分析 | 第29页 |
| 2.1.8 数据处理 | 第29页 |
| 2.1.9 生物信息学分析 | 第29-30页 |
| 2.1.10 荧光定量RT-PCR验证差异表达基因 | 第30页 |
| 2.2 结果 | 第30-44页 |
| 2.2.1 临床症状及血清抗体检测结果 | 第30页 |
| 2.2.2 肾脏中病毒载量 | 第30-31页 |
| 2.2.3 IBV感染致死鸡肾脏组织转录组分析结果 | 第31页 |
| 2.2.4 差异表达基因的生物信息学分析 | 第31-43页 |
| 2.2.5 荧光定量RT-PCR验证部分差异表达基因 | 第43-44页 |
| 2.3 讨论 | 第44-47页 |
| 2.3.1 模式识别受体的差异表达情况 | 第45页 |
| 2.3.2 IBV感染激活干扰素通路 | 第45-46页 |
| 2.3.3 IBV感染激发炎症反应 | 第46页 |
| 2.3.4 细胞凋亡参与IBV感染过程 | 第46-47页 |
| 第三章 鸡传染性支气管炎病毒感染鸡脾脏转录组学分析 | 第47-62页 |
| 3.1 材料和方法 | 第48-52页 |
| 3.1.1 病毒和实验动物 | 第48页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第48页 |
| 3.1.3 主要实验仪器及软件 | 第48页 |
| 3.1.4 动物感染试验及样品采集 | 第48-49页 |
| 3.1.5 Real-time RT-PCR检测气管中病毒载量 | 第49页 |
| 3.1.6 IBV感染鸡脾脏组织转录组分析 | 第49页 |
| 3.1.7 数据处理 | 第49页 |
| 3.1.8 生物信息学分析 | 第49页 |
| 3.1.9 荧光定量RT-PCR验证差异表达基因 | 第49-52页 |
| 3.2 结果 | 第52-59页 |
| 3.2.1 检测气管中病毒RNA | 第52页 |
| 3.2.2 IBV感染早期和晚期脾脏组织转录组学分析结果 | 第52-58页 |
| 3.2.3 差异表达基因的KEGG通路分析 | 第58页 |
| 3.2.4 荧光定量RT-PCR验证部分差异表达基因 | 第58-59页 |
| 3.3 讨论 | 第59-62页 |
| 第四章 鸡干扰素诱导跨膜蛋白1抑制NDV和IBV复制的研究 | 第62-80页 |
| 4.1 材料和方法 | 第63-68页 |
| 4.1.1 病毒、菌株、细胞及质粒 | 第63页 |
| 4.1.2 SPF鸡和鸡外周血红细胞 | 第63页 |
| 4.1.3 主要试剂和仪器 | 第63页 |
| 4.1.4 IFITM生物信息学分析及构建系统发育树 | 第63-64页 |
| 4.1.5 检测chIFITM1 mRNA的体内外表达情况 | 第64页 |
| 4.1.6 IBV和NDV感染后靶器官中chIFITM1 mRNA的表达情况 | 第64页 |
| 4.1.7 过表达chIFITM对NDV和IBV复制的影响 | 第64-66页 |
| 4.1.8 chIFITM1蛋白的亚细胞定位 | 第66页 |
| 4.1.9 chIFITM蛋白相互作用研究 | 第66-68页 |
| 4.2 结果 | 第68-77页 |
| 4.2.1 chIFITM1的生物信息学分析 | 第68-70页 |
| 4.2.2 chIFITM1体内外分布情况 | 第70-72页 |
| 4.2.3 chIFITM1抑制NDV和IBV复制 | 第72-74页 |
| 4.2.4 缺失N端和C端对chIFITM1抗病毒活性的影响 | 第74页 |
| 4.2.5 chIFITM1和NDV HN蛋白的亚细胞定位情况 | 第74-75页 |
| 4.2.6 chIFITM1的原核表达和纯化 | 第75-76页 |
| 4.2.7 chIFITM1-His蛋白与EIF5A1蛋白的相互作用 | 第76-77页 |
| 4.2.8 EIF5A1 抑制 NDV 复制 | 第77页 |
| 4.3 讨论 | 第77-80页 |
| 第五章 全文结论 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 作者简历 | 第92页 |
