摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
1 前言 | 第11-20页 |
1.1 鸡传染性贫血病的研究进展 | 第11-16页 |
1.1.1 鸡传染性贫血病毒及其特征 | 第11-12页 |
1.1.2 鸡传染性贫血病毒的流行病学 | 第12页 |
1.1.3 鸡传染性贫血病毒的临床症状及病理变化 | 第12-13页 |
1.1.4 鸡传染性贫血病毒的致病机制 | 第13页 |
1.1.5 鸡传染性贫血病毒的诊断方法 | 第13-16页 |
1.2 基因芯片概述 | 第16-17页 |
1.2.1 基因芯片的定义 | 第16页 |
1.2.2 基因芯片的原理 | 第16页 |
1.2.3 基因芯片的特点 | 第16-17页 |
1.2.4 基因芯片的种类 | 第17页 |
1.2.5 基因芯片的发展 | 第17页 |
1.3 基因芯片的应用 | 第17-18页 |
1.3.1 基因芯片在医学方面的研究 | 第17页 |
1.3.2 基因芯片在药物筛选方面的研究 | 第17-18页 |
1.3.3 基因芯片在环境保护和检测方面的研究 | 第18页 |
1.3.4 表达谱芯片以及差异基因的研究 | 第18页 |
1.4 研究的目的和意义 | 第18-20页 |
2 鸡传染性贫血病毒感染宿主后的表达谱分析 | 第20-40页 |
2.1 研究目的 | 第20页 |
2.2 实验材料 | 第20-21页 |
2.2.1 病毒和细胞 | 第20页 |
2.2.2 实验动物 | 第20页 |
2.2.3 主要实验仪器 | 第20-21页 |
2.2.4 主要试剂及试剂盒 | 第21页 |
2.2.5 试验试剂及其配制 | 第21页 |
2.2.6 分析工具以及网站 | 第21页 |
2.3 鸡感染传染性贫血病毒的动物模型建立 | 第21-23页 |
2.3.1 细胞培养 | 第21-22页 |
2.3.2 病毒增殖与收获 | 第22页 |
2.3.3 间接免疫荧光鉴定(IFA) | 第22页 |
2.3.4 引物设计 | 第22页 |
2.3.5 病毒DNA的提取 | 第22-23页 |
2.3.6 病毒DNA的PCR鉴定 | 第23页 |
2.3.7 病毒滴度的测定 | 第23页 |
2.3.8 雏鸡接种实验 | 第23页 |
2.4 鸡传染性贫血病毒基因表达谱芯片检测 | 第23-30页 |
2.4.1 鸡胸腺总RNA的提取 | 第23-24页 |
2.4.2 RNA变性琼脂糖凝胶电泳法检测RNA的纯度 | 第24页 |
2.4.3 总RNA的纯化 | 第24-25页 |
2.4.4 制备Poly-A RNA Controls稀释液 | 第25页 |
2.4.5 First-Strand cDNA的合成 | 第25-26页 |
2.4.6 Second-Strand cDNA的合成 | 第26-27页 |
2.4.7 Double-Stranded cDNA纯化 | 第27页 |
2.4.8 生物素标记cRNA的体外转录合成 | 第27-28页 |
2.4.9 cRNA的纯化 | 第28页 |
2.4.10 cRNA的片段化 | 第28-29页 |
2.4.11 基因芯片的杂交 | 第29页 |
2.4.12 芯片的清洗、染色和扫描 | 第29-30页 |
2.4.13 基因芯片数据分析 | 第30页 |
2.4.14 实时荧光定量PCR对基因芯片结果进行验证 | 第30页 |
2.5 结果与分析 | 第30-37页 |
2.5.1 间接免疫荧光鉴定(IFA)实验结果 | 第30-31页 |
2.5.2 病毒DNA的鉴定 | 第31页 |
2.5.3 临床症状观察 | 第31页 |
2.5.4 RNA质量检测结果 | 第31-32页 |
2.5.5 芯片杂交扫描结果 | 第32-33页 |
2.5.6 芯片结果分析 | 第33-34页 |
2.5.7 实时荧光定量PCR验证 | 第34页 |
2.5.8 基因表达谱芯片芯片数据聚类分析结果 | 第34-35页 |
2.5.9 差异表达基因的GO分析 | 第35-36页 |
2.5.10 基因表达谱的Pathway分析 | 第36-37页 |
2.6 讨论 | 第37-40页 |
3 鸡传染性贫血病毒SYBR GreenⅠ实时荧光定量检测方法的建立 | 第40-52页 |
3.1 材料 | 第40-41页 |
3.1.1 病毒和细胞 | 第40页 |
3.1.2 主要仪器 | 第40页 |
3.1.3 主要试剂盒 | 第40页 |
3.1.4 试验所用溶液 | 第40-41页 |
3.1.5 试验所用培养基 | 第41页 |
3.2 方法 | 第41-45页 |
3.2.1 病毒的制备 | 第41页 |
3.2.2 CIAV引物设计 | 第41页 |
3.2.3 病毒DNA的提取 | 第41页 |
3.2.4 PCR扩增 | 第41-42页 |
3.2.5 PCR产物的纯化回收 | 第42页 |
3.2.6 胶回收产物连接到PGM-T载体 | 第42页 |
3.2.7 转化 | 第42页 |
3.2.8 筛选阳性克隆 | 第42-43页 |
3.2.9 重组质粒的提取 | 第43页 |
3.2.10 质粒的PCR鉴定 | 第43页 |
3.2.11 标准品的制备 | 第43页 |
3.2.12 定量PCR条件的优化 | 第43-44页 |
3.2.13 标准曲线的建立 | 第44页 |
3.2.14 敏感性试验 | 第44页 |
3.2.15 特异性试验 | 第44页 |
3.2.16 重复性试验 | 第44页 |
3.2.17 临床样品检测 | 第44-45页 |
3.3 试验结果 | 第45-50页 |
3.3.1 病毒DNA的PCR鉴定结果 | 第45页 |
3.3.2 阳性标准质粒的PCR鉴定结果 | 第45-46页 |
3.3.3 标准品的拷贝数 | 第46页 |
3.3.4 实时荧光定量PCR优化条件结果 | 第46页 |
3.3.5 实时荧光定量PCR标准曲线的建立 | 第46-48页 |
3.3.6 敏感性试验结果 | 第48-49页 |
3.3.7 特异性试验结果 | 第49-50页 |
3.3.8 重复性试验结果 | 第50页 |
3.3.9 临床样品检测结果 | 第50页 |
3.4 讨论 | 第50-52页 |
4 结论 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-59页 |
在读期间发表的学术论文 | 第59-60页 |
作者简介 | 第60-61页 |
致谢 | 第61-62页 |