| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 缩略词表 | 第8-9页 |
| 目录 | 第9-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-22页 |
| ·DLG1 蛋白及其PDZ 结构域 | 第12-17页 |
| ·DLG1 蛋白的结构 | 第12-13页 |
| ·DLG1 蛋白的功能 | 第13-14页 |
| ·PDZ 结构域的结构特点 | 第14-16页 |
| ·PDZ 结构域的配体识别特异性机制 | 第16-17页 |
| ·APC 蛋白的结构与功能 | 第17-19页 |
| ·APC 蛋白的结构 | 第17-18页 |
| ·APC 蛋白的功能 | 第18-19页 |
| ·DLG1 与APC 蛋白的相互作用 | 第19-20页 |
| ·蛋白质晶体学的研究进展 | 第20-21页 |
| ·本实验的研究内容和意义 | 第21-22页 |
| 第2章 材料与方法 | 第22-39页 |
| ·主要仪器及设备 | 第22-23页 |
| ·实验材料 | 第23-25页 |
| ·大肠杆菌菌株 | 第23页 |
| ·质粒载体 | 第23-24页 |
| ·引物 | 第24页 |
| ·APC-C 端11 肽 | 第24-25页 |
| ·主要的酶及试剂 | 第25页 |
| ·主要试剂的配制 | 第25-28页 |
| ·培养基及常用溶液的配制 | 第25-27页 |
| ·亲和层析、凝胶过滤的缓冲液 | 第27-28页 |
| ·抗生素及其使用浓度 | 第28页 |
| ·主要实验方法 | 第28-39页 |
| ·PCR 扩增目的片段 | 第28-29页 |
| ·PCR 产物的凝胶回收 | 第29-31页 |
| ·限制性内切酶切割 | 第31页 |
| ·连接反应 | 第31页 |
| ·转化感受态细胞 | 第31-32页 |
| ·小规模质粒提取 | 第32-33页 |
| ·蛋白质小规模表达测试 | 第33页 |
| ·蛋白质大规模表达纯化 | 第33-34页 |
| ·凝胶过滤纯化蛋白 | 第34-35页 |
| ·蛋白质结晶 | 第35-36页 |
| ·晶体的X 射线衍射及结构解析 | 第36-37页 |
| ·GST pull-down 分析 | 第37页 |
| ·等温滴定量热(ITC)实验 | 第37-39页 |
| 第3章 DLG1-PDZ1 与APC 复合物的结构生物学研究 | 第39-52页 |
| ·前言 | 第39页 |
| ·实验结果 | 第39-51页 |
| ·DLG1(220-317)的表达、纯化与结晶 | 第39-43页 |
| ·DLG1(220-310)的表达、纯化和结晶 | 第43-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第4章 DLG1-PDZ2 与APC 复合物的结构生物学研究 | 第52-61页 |
| ·前言 | 第52页 |
| ·实验结果 | 第52-60页 |
| ·DLG1(315-410)亲和层析纯化 | 第53页 |
| ·DLG1(315-410)凝胶过滤纯化 | 第53-54页 |
| ·DLG1(315-410)/APC-C11 复合物的结晶 | 第54-55页 |
| ·晶体的X-射线衍射数据收集及结构解析 | 第55-57页 |
| ·PDZ2 与APC-C 末端肽的相互作用 | 第57-59页 |
| ·APC 结合PDZ2 导致的构象变化 | 第59-60页 |
| ·本章小结 | 第60-61页 |
| 第5章 不同PDZ、APC 及其突变体蛋白的表达纯化研究 | 第61-70页 |
| ·前言 | 第61-62页 |
| ·实验结果 | 第62-69页 |
| ·DLG1 不同PDZ 序列比对 | 第62-63页 |
| ·PDZ2 Δ339-346 的表达纯化 | 第63-64页 |
| ·PDZ2 Q340P 的表达纯化 | 第64-65页 |
| ·GST-APC-C11 的表达纯化 | 第65-66页 |
| ·GST-APC-C4 的表达纯化 | 第66-67页 |
| ·PDZ1-PDZ2 的表达纯化 | 第67-68页 |
| ·PDZ3 的表达纯化 | 第68-69页 |
| ·本章小结 | 第69-70页 |
| 第6章 不同APC 与各种PDZ 的相互作用研究 | 第70-78页 |
| ·前言 | 第70页 |
| ·实验结果 | 第70-77页 |
| ·GST-APC-C11 与不同PDZ 的相互作用 | 第70-72页 |
| ·GST-APC-C11 与PDZ2 Δ339-346 的相互作用 | 第72-73页 |
| ·GST-APC-C11 与PDZ2 Q340P 的相互作用 | 第73-75页 |
| ·GST-APC-C4 与不同PDZ 的相互作用 | 第75-77页 |
| ·不同物种的APC-C 末端氨基酸比对 | 第77页 |
| ·本章小结 | 第77-78页 |
| 第7章 总结与讨论 | 第78-80页 |
| 参考文献 | 第80-84页 |
| 附录1 | 第84-87页 |
| 附录2 | 第87-90页 |
| 附录3 | 第90-94页 |
| 致谢 | 第94-95页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第95-97页 |