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肿瘤抑制蛋白DLG1与APC的结合机理研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-8页
缩略词表第8-9页
目录第9-12页
第1章 绪论第12-22页
   ·DLG1 蛋白及其PDZ 结构域第12-17页
     ·DLG1 蛋白的结构第12-13页
     ·DLG1 蛋白的功能第13-14页
     ·PDZ 结构域的结构特点第14-16页
     ·PDZ 结构域的配体识别特异性机制第16-17页
   ·APC 蛋白的结构与功能第17-19页
     ·APC 蛋白的结构第17-18页
     ·APC 蛋白的功能第18-19页
   ·DLG1 与APC 蛋白的相互作用第19-20页
   ·蛋白质晶体学的研究进展第20-21页
   ·本实验的研究内容和意义第21-22页
第2章 材料与方法第22-39页
   ·主要仪器及设备第22-23页
   ·实验材料第23-25页
     ·大肠杆菌菌株第23页
     ·质粒载体第23-24页
     ·引物第24页
     ·APC-C 端11 肽第24-25页
     ·主要的酶及试剂第25页
   ·主要试剂的配制第25-28页
     ·培养基及常用溶液的配制第25-27页
     ·亲和层析、凝胶过滤的缓冲液第27-28页
     ·抗生素及其使用浓度第28页
   ·主要实验方法第28-39页
     ·PCR 扩增目的片段第28-29页
     ·PCR 产物的凝胶回收第29-31页
     ·限制性内切酶切割第31页
     ·连接反应第31页
     ·转化感受态细胞第31-32页
     ·小规模质粒提取第32-33页
     ·蛋白质小规模表达测试第33页
     ·蛋白质大规模表达纯化第33-34页
     ·凝胶过滤纯化蛋白第34-35页
     ·蛋白质结晶第35-36页
     ·晶体的X 射线衍射及结构解析第36-37页
     ·GST pull-down 分析第37页
     ·等温滴定量热(ITC)实验第37-39页
第3章 DLG1-PDZ1 与APC 复合物的结构生物学研究第39-52页
   ·前言第39页
   ·实验结果第39-51页
     ·DLG1(220-317)的表达、纯化与结晶第39-43页
     ·DLG1(220-310)的表达、纯化和结晶第43-51页
   ·本章小结第51-52页
第4章 DLG1-PDZ2 与APC 复合物的结构生物学研究第52-61页
   ·前言第52页
   ·实验结果第52-60页
     ·DLG1(315-410)亲和层析纯化第53页
     ·DLG1(315-410)凝胶过滤纯化第53-54页
     ·DLG1(315-410)/APC-C11 复合物的结晶第54-55页
     ·晶体的X-射线衍射数据收集及结构解析第55-57页
     ·PDZ2 与APC-C 末端肽的相互作用第57-59页
     ·APC 结合PDZ2 导致的构象变化第59-60页
   ·本章小结第60-61页
第5章 不同PDZ、APC 及其突变体蛋白的表达纯化研究第61-70页
   ·前言第61-62页
   ·实验结果第62-69页
     ·DLG1 不同PDZ 序列比对第62-63页
     ·PDZ2 Δ339-346 的表达纯化第63-64页
     ·PDZ2 Q340P 的表达纯化第64-65页
     ·GST-APC-C11 的表达纯化第65-66页
     ·GST-APC-C4 的表达纯化第66-67页
     ·PDZ1-PDZ2 的表达纯化第67-68页
     ·PDZ3 的表达纯化第68-69页
   ·本章小结第69-70页
第6章 不同APC 与各种PDZ 的相互作用研究第70-78页
   ·前言第70页
   ·实验结果第70-77页
     ·GST-APC-C11 与不同PDZ 的相互作用第70-72页
     ·GST-APC-C11 与PDZ2 Δ339-346 的相互作用第72-73页
     ·GST-APC-C11 与PDZ2 Q340P 的相互作用第73-75页
     ·GST-APC-C4 与不同PDZ 的相互作用第75-77页
     ·不同物种的APC-C 末端氨基酸比对第77页
   ·本章小结第77-78页
第7章 总结与讨论第78-80页
参考文献第80-84页
附录1第84-87页
附录2第87-90页
附录3第90-94页
致谢第94-95页
攻读学位期间发表的学术论文第95-97页

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