| 缩略词 | 第2-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Summary | 第8-9页 |
| 第一章 引言 | 第10-27页 |
| 1.1 植物突变体产生方式及机制 | 第10-13页 |
| 1.1.1 自发突变 | 第10-11页 |
| 1.1.2 利用插入序列产生突变 | 第11-12页 |
| 1.1.3 人工诱发突变 | 第12-13页 |
| 1.2 伽马射线辐照育种介绍 | 第13-19页 |
| 1.2.1 伽马射线辐照育种的原理及方法 | 第13-14页 |
| 1.2.2 伽马射线辐照育种材料的选择 | 第14-15页 |
| 1.2.3 伽马射线辐照育种剂量的选择 | 第15页 |
| 1.2.4 伽马射线诱变育种研究进展 | 第15-19页 |
| 1.3 全基因组重测序技术简介 | 第19-24页 |
| 1.3.1 测序技术的历史 | 第19-20页 |
| 1.3.2 测序技术的发展 | 第20-21页 |
| 1.3.3 全基因组重测序技术 | 第21-23页 |
| 1.3.4 全基因组重测序存在问题及发展趋势 | 第23-24页 |
| 1.4 拟南芥突变体研究进展 | 第24-25页 |
| 1.4.1 模式植物拟南芥 | 第24页 |
| 1.4.2 拟南芥突变表型研究进展 | 第24-25页 |
| 1.5 研究意义 | 第25-26页 |
| 1.6 技术路线 | 第26-27页 |
| 第二章 材料和方法 | 第27-31页 |
| 2.1 实验材料 | 第27页 |
| 2.2 培养条件 | 第27页 |
| 2.3 实验方法 | 第27-30页 |
| 2.3.1 伽马射线辐照实验 | 第27-28页 |
| 2.3.2 当代生物学效应测定 | 第28页 |
| 2.3.3 伽马射线辐照拟南芥突变体筛选 | 第28-29页 |
| 2.3.4 高通量全基因组重测序 | 第29-30页 |
| 2.4 数据分析及图像处理 | 第30-31页 |
| 第三章 伽马射线辐照拟南芥的当代效应研究及突变体筛选 | 第31-40页 |
| 3.1 不同剂量的伽马射线对拟南芥M1代存活率的影响 | 第31-32页 |
| 3.2 不同剂量的伽马射线对拟南芥M1代根长及下胚轴长的影响 | 第32-33页 |
| 3.3 突变体筛选 | 第33页 |
| 3.4 突变表型分类统计 | 第33-35页 |
| 3.5 伽马射线辐照对拟南芥M2突变群体表型的多效性分析 | 第35页 |
| 3.6 伽马射线辐照拟南芥对M2突变群体稳定性验证 | 第35-36页 |
| 3.7 讨论 | 第36-40页 |
| 3.7.1 伽马射线辐照对拟南芥具有明显的当代效应 | 第36-37页 |
| 3.7.2 伽马射线辐照拟南芥突变群体表型变异丰富 | 第37-40页 |
| 第四章 伽马射线辐照对部分突变材料在基因组水平上的诱变效应研究 | 第40-56页 |
| 4.1 基因组重测序材料的选取 | 第40页 |
| 4.2 重测序材料DNA质量检测及文库构建 | 第40-41页 |
| 4.3 Illumina测序clean data基本信息 | 第41页 |
| 4.4 与参考基因组比对 | 第41-43页 |
| 4.5 变异检测 | 第43-51页 |
| 4.5.1 SNP和小片段InDel检测 | 第43-44页 |
| 4.5.2 SNP和小片段InDel变异类型分析 | 第44-48页 |
| 4.5.3 SNP和小片段InDel在全基因组范围内的分布情况 | 第48-51页 |
| 4.6 GO注释 | 第51-53页 |
| 4.7 讨论 | 第53-56页 |
| 第五章 结论与展望 | 第56-58页 |
| 5.1 结论 | 第56-57页 |
| 5.2 展望 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 导师简介 | 第68-72页 |
| 作者简介 | 第72-73页 |
