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利用TALEN技术建立低免疫原性的人类胚胎干细胞

摘要第4-5页
Abstract第5页
第1章 引言第10-15页
    1.1 人类胚胎干细胞是理想的种子细胞第10页
    1.2 个体化定制的诱导多能干细胞第10-11页
    1.3 异体移植的免疫排斥第11-12页
    1.4 利用新型基因打靶技术建立低免疫原性hESC第12-15页
        1.4.1 锌指核酸酶(ZFNS)技术第12-13页
        1.4.2 类转录激活因子效应物核酸酶(TALENS)技术第13页
        1.4.3 规律成簇间隔短回文重复序列(CRISPR/CAS9)技术第13-15页
第2章 实验材料第15-18页
    2.1 细胞第15页
    2.2 菌株第15页
    2.3 质粒第15页
    2.4 主要试剂和试剂盒第15-16页
    2.5 抗体第16页
    2.6 主要实验仪器第16-18页
第3章 实验方法第18-42页
    3.1 细胞培养相关试剂的配置第18页
        3.1.1 人类胚胎干细胞培养液第18页
        3.1.2 人类胚胎干细胞冻存液第18页
        3.1.3 小鼠成纤维细胞培养液第18页
        3.1.4 小鼠成纤维细胞冻存液第18页
    3.2 分子克隆相关试剂的配置第18-19页
        3.2.1 LB培养基第18页
        3.2.2 LB平板第18-19页
        3.2.3 Mg2+ 溶液第19页
        3.2.4 蔗糖溶液第19页
        3.2.5 SOB培养基配制第19页
        3.2.6 RF1:180ml的配制第19页
        3.2.7 RF2的配制第19页
    3.3 感受态细菌的制备第19-20页
    3.4 人类胚胎干细胞的饲养层细胞—小鼠胚胎成纤维细胞的相关培养第20-23页
        3.4.1 小鼠胚胎成纤维细胞的原代培养第20-22页
        3.4.2 小鼠胚胎成纤维细胞的冻存第22页
        3.4.3 小鼠胚胎成纤维细胞的复苏第22页
        3.4.4 小鼠胚胎成纤维细胞的传代第22-23页
        3.4.5 饲养层细胞的制备第23页
    3.5 人类胚胎干细胞的培养第23-25页
        3.5.1 人类胚胎干细胞条件培养基(CM)的收集第23-24页
        3.5.2 人类胚胎干细胞的复苏第24页
        3.5.3 人类胚胎干细胞的传代第24-25页
    3.6 基因组抽提第25-26页
    3.7 PCR及PCR产物纯化第26页
        3.7.1 PCR体系第26页
        3.7.2 PCR产物纯化第26页
    3.8 免疫印迹第26-29页
        3.8.1 免疫印迹相关试剂准备第26-27页
        3.8.2 免疫印迹相关溶液的配制第27-28页
        3.8.3 免疫印迹的步骤第28-29页
            3.8.3.1 蛋白质样品获取第28页
            3.8.3.2 电泳第28-29页
            3.8.3.3 电转第29页
            3.8.3.4 免疫反应第29页
            3.8.3.5 发光检测第29页
    3.9 建立HLA-A敲除的人类胚胎干细胞系的方法第29-36页
        3.9.1 从NCBI上下载HLA-A基因序列第29-30页
        3.9.2 设计引物,PCR扩增基因组上打靶位点片段并测序第30-32页
            3.9.2.1 引物设计第30-31页
            3.9.2.2 PCR扩增基因组上打靶位点片段并测序第31-32页
        3.9.3 设计靶向敲除HLA-A基因的TALENS第32-33页
            3.9.3.1 测序确定 HLA-A的序列第32页
            3.9.3.2 在HLA-AEXON2上设计TALEN识别位点及序列第32-33页
        3.9.4 在人类胚胎干细胞系X2里进行HLA-A基因打靶第33-35页
            3.9.4.1 TALENS转染人类胚胎干细胞系X2细胞验证TALENS打靶效率第33-35页
            3.9.4.2 挑克隆测序并计算TALEN的打靶效率第35页
        3.9.5 在人类胚胎干细胞X2中建立敲除HLA-A基因的单克隆细胞系第35-36页
    3.10 建立HLA-B5101敲除的人类胚胎干细胞系的方法第36-42页
        3.10.1 步骤同 HLA-A,从 NCBI 上下载 HLA-B 基因序列第36页
        3.10.2 设计引物,PCR扩增基因组上打靶位点片段并测序设计TELENS第36-39页
        3.10.3 挑克隆测序并计算TALENS的把靶效率第39-40页
        3.10.4 在HLA-A基因敲除的人类胚胎干细胞X2第40-42页
第4章 实验结果与讨论第42-47页
    4.1 建立 HLA-A 敲除的人类胚胎干细胞系第42-44页
        4.1.1 构建靶向HLA-A的TALEN第42页
        4.1.2 在人类胚胎干细胞系X2中检测TALEN效率第42-43页
        4.1.3 建立HLA-A敲除的人类胚胎干细胞系第43页
        4.1.4 HLA-A基因敲除人类胚胎干细胞的HLA I类分子表达情况第43-44页
            4.1.4.1 DNA水平第43页
            4.1.4.2 蛋白水平第43-44页
    4.2 在HLA-A基因敲除的人类胚胎干细胞X2中建立敲除HLA-B5101基因的单克隆细胞系第44-47页
        4.2.1 设计靶向敲除HLA-B5101基因的TALENS第44页
        4.2.2 筛选出有活性的TALENS第44-45页
        4.2.3 在HLA-A基因敲除的人类胚胎干细胞X2中建立敲除HLA-B5101基因的单克隆细胞系第45-47页
第5章 总结与展望第47-49页
    5.1 成功利用TALENS把靶技术将人类胚胎干细胞的HLA-A基因高效敲除第47页
    5.2 HLA-A基因敲除的人类胚胎干细胞不表达HLA-A蛋白第47页
    5.3 在HLA-A基因敲除的基础上获得了HLA-B5101敲除的人类胚胎干细胞第47-49页
参考文献第49-53页
致谢第53-54页
附录第54-58页
    附录1 发表的论文第54页
    附录2 测序得到的人胚胎干细胞系X2的HLA-A、B序列HLA-A 0201的序列第54-58页

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