| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRCT | 第5-6页 |
| 缩略词表 | 第8-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-38页 |
| 1 奶牛乳腺炎的研究进展 | 第12-17页 |
| 1.1 奶牛乳腺炎类型及症状 | 第12页 |
| 1.2 奶牛乳腺炎的病因 | 第12-14页 |
| 1.3 奶牛乳腺炎的诊断 | 第14-15页 |
| 1.4 奶牛乳腺炎的治疗 | 第15-16页 |
| 1.5 奶牛乳腺炎抗性性状选择 | 第16页 |
| 1.6 奶牛乳腺炎抗性候选基因研究现状 | 第16-17页 |
| 2 金黄色葡萄球菌诱导动物乳腺炎研究进展 | 第17-19页 |
| 2.1 金黄色葡萄球菌简介 | 第17页 |
| 2.2 金黄色葡萄球菌诱导动物乳腺炎模型研究进展 | 第17-19页 |
| 3 高通量技术在奶牛乳腺炎上的应用 | 第19-26页 |
| 3.1 基因芯片 | 第19-20页 |
| 3.2 microRNA | 第20-25页 |
| 3.3 高通量技术在奶牛乳腺炎研究中的进展 | 第25-26页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第26页 |
| 5 参考文献 | 第26-38页 |
| 第二章 奶牛乳腺组织感染金黄色葡萄球菌基因表达谱分析 | 第38-56页 |
| 1 材料与方法 | 第38-45页 |
| 1.1 试验动物 | 第38页 |
| 1.2 菌种 | 第38页 |
| 1.3 主要试剂及配制方法 | 第38-39页 |
| 1.4 主要仪器和设备 | 第39页 |
| 1.5 人工诱导奶牛金黄色葡萄球菌乳腺炎模型的建立 | 第39-41页 |
| 1.6 牛全基因组表达谱芯片检测 | 第41-44页 |
| 1.7 芯片结果数据分析与处理 | 第44-45页 |
| 1.8 实时荧光定量PCR验证 | 第45页 |
| 2 结果 | 第45-52页 |
| 2.1 奶牛金黄色葡萄球菌型乳腺炎人工诱导试验 | 第45-46页 |
| 2.2 RNA提取及质量检测 | 第46-47页 |
| 2.3 基因芯片杂交及数据标准化 | 第47-51页 |
| 2.4 差异表达基因的Q-PCR验证 | 第51-52页 |
| 3 讨论 | 第52-55页 |
| 3.1 奶牛乳腺炎疾病模型的建立 | 第52页 |
| 3.2 奶牛金黄色葡萄球菌人工诱导型乳房炎全基因组表达谱分析 | 第52-55页 |
| 3.3 差异表达基因的Q-PCR验证分析 | 第55页 |
| 4 参考文献 | 第55-56页 |
| 第三章 奶牛乳腺组织感染金黄色葡萄球菌miRNA表达谱研究 | 第56-78页 |
| 1 材料和方法 | 第57-63页 |
| 1.1 试验动物 | 第57页 |
| 1.2 主要试剂及其配置 | 第57页 |
| 1.3 主要仪器和设备 | 第57页 |
| 1.4 乳腺组织采集 | 第57页 |
| 1.5 组织总RNA的提取纯化 | 第57页 |
| 1.6 小RNA文库构建及测序 | 第57-58页 |
| 1.7 小RNA测序原始数据处理及生物信息学分析 | 第58-61页 |
| 1.8 miRNA靶基因预测 | 第61页 |
| 1.9 靶基因GO分析和通路分析 | 第61-62页 |
| 1.10 QRT-PCR对差异miRNA的验证 | 第62-63页 |
| 1.11 QRT-PCR对靶基因的验证 | 第63页 |
| 2 结果 | 第63-74页 |
| 2.1 测序结果概述 | 第63-68页 |
| 2.2 候选miRNA的预测 | 第68页 |
| 2.3 miRNA的差异分析 | 第68-71页 |
| 2.4 Q-PCR验证差异miRNA表达趋势 | 第71页 |
| 2.5 对已知差异miRNA的靶基因预测 | 第71-72页 |
| 2.6 miRNA-mRNA表达的关联分析 | 第72-73页 |
| 2.7 Q-PCR验证关键靶基因的表达趋势 | 第73-74页 |
| 3 讨论 | 第74-75页 |
| 4 参考文献 | 第75-78页 |
| 第四章 结论和创新点 | 第78-79页 |
| 附录 | 第79-91页 |
| 附录一：文中涉及到QRT-PCR引物信息 | 第79-81页 |
| 附录二：表达谱芯片分析结果 | 第81-88页 |
| 附录三：miRNA-mRNA表达的关联分析 | 第88-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 博士期间发表的论文 | 第92-93页 |
