| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略词表 | 第9-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-45页 |
| 1.1 HPgV病毒的发现和命名 | 第13-14页 |
| 1.2 HPgV的基因组结构 | 第14-20页 |
| 1.2.1 非编码区 | 第15-16页 |
| 1.2.2 结构蛋白区 | 第16-18页 |
| 1.2.3 非结构蛋白区 | 第18-20页 |
| 1.3 HPgV的生活周期 | 第20-23页 |
| 1.3.1 HPgV的细胞嗜性 | 第21-22页 |
| 1.3.2 HPgV的初始复制位点 | 第22-23页 |
| 1.3.3 HPgV的细胞受体 | 第23页 |
| 1.4 HPgV病毒实验室培养和检测方法 | 第23-24页 |
| 1.5 HPgV流行病学 | 第24-27页 |
| 1.5.1 HPgV的流行情况 | 第24-25页 |
| 1.5.2 HPgV的传播途径 | 第25-26页 |
| 1.5.3 HPgV的基因型 | 第26-27页 |
| 1.6 HPgV的致病能力 | 第27-28页 |
| 1.6.1 HPgV的非致病性 | 第27页 |
| 1.6.2 HPgV与非霍奇金淋巴瘤(NHL) | 第27-28页 |
| 1.6.3 HPgV与肝炎相关性再生障碍性贫血(HAAA) | 第28页 |
| 1.7 HPgV与HIV之间的相互关系 | 第28-34页 |
| 1.7.1 HPgV共感染现象 | 第28-30页 |
| 1.7.2 HPgV抑制HIV感染的机制 | 第30-34页 |
| 1.8 HPgV的进化特点 | 第34-36页 |
| 1.8.1 起源假说 | 第34页 |
| 1.8.2 HPgV的突变速度 | 第34-35页 |
| 1.8.3 HPgV基因组的保守性 | 第35-36页 |
| 1.8.4 HPgV的遗传重组 | 第36页 |
| 1.9 RNA病毒的遗传进化 | 第36-45页 |
| 1.8.1 突变(mutation) | 第36-38页 |
| 1.8.2 重组(recombination) | 第38-40页 |
| 1.8.3 选择(selection) | 第40-41页 |
| 1.8.4 遗传漂变(genetic drift) | 第41页 |
| 1.8.5 迁移(migration) | 第41-42页 |
| 1.8.6 “准种”理论(quasispecies) | 第42-43页 |
| 1.8.7 研究RNA病毒进化的意义 | 第43-45页 |
| 2 湖北地区HIV感染者体内HPgV病毒遗传多样性及个体特异性病毒谱系形成的研究 | 第45-69页 |
| 2.1 引言 | 第45页 |
| 2.2 材料与方法 | 第45-56页 |
| 2.2.1 实验仪器 | 第45-46页 |
| 2.2.2 实验耗材 | 第46-47页 |
| 2.2.3 常用试剂 | 第47页 |
| 2.2.4 试剂盒 | 第47页 |
| 2.2.5 溶液配制 | 第47-49页 |
| 2.2.6 质粒、菌种和细胞系 | 第49页 |
| 2.2.7 引物 | 第49-50页 |
| 2.2.8 实验方法 | 第50-54页 |
| 2.2.9 数据分析 | 第54-56页 |
| 2.3 实验结果 | 第56-65页 |
| 2.3.1 标本采集与病毒检测 | 第56-57页 |
| 2.3.2 系统发育分析与基因分型 | 第57-60页 |
| 2.3.3 种群动态分析 | 第60-62页 |
| 2.3.4 溯祖分析 | 第62-63页 |
| 2.3.5 选择压力分析 | 第63-65页 |
| 2.4 讨论 | 第65-69页 |
| 3 HIV感染者体内HPgV病毒遗传重组 | 第69-81页 |
| 3.1 引言 | 第69页 |
| 3.2 实验方法 | 第69-70页 |
| 3.3 实验结果 | 第70-78页 |
| 3.3.1 标本收集和病人情况 | 第70页 |
| 3.3.2 系统发育分析和重组检测 | 第70-76页 |
| 3.3.3 RNA二级结构预测 | 第76-78页 |
| 3.4 讨论 | 第78-81页 |
| 4 HPgV病毒E2蛋白抗原位点序列多样性分析及膜蛋白多肽对HIV的抑制作用 | 第81-91页 |
| 4.1 引言 | 第81页 |
| 4.2 实验方法 | 第81-83页 |
| 4.3 实验结果 | 第83-89页 |
| 4.3.1 抗原位点系统进化分析 | 第83-84页 |
| 4.3.2 抗原位点选择压力分析 | 第84-86页 |
| 4.3.3 HPgV膜蛋白多肽抑制HIV-1的活性 | 第86页 |
| 4.3.4 多肽对HIV-1的抑制可能发生在病毒进入阶段 | 第86-88页 |
| 4.3.5 改造多肽的抑制活性 | 第88-89页 |
| 4.4 讨论 | 第89-91页 |
| 总结 | 第91-93页 |
| 参考文献 | 第93-110页 |
| 博士期间发表和待发表论文 | 第110-111页 |
| 致谢 | 第111页 |
