| 中文摘要 | 第4-5页 |
| 英文摘要 | 第5页 |
| 1 引言 | 第8-13页 |
| 1.1 水稻 | 第8页 |
| 1.2 转座元件 | 第8-10页 |
| 1.2.1 转座元件的分类 | 第8-9页 |
| 1.2.2 研究转座子的意义 | 第9-10页 |
| 1.3 植物远缘杂交的研究进展 | 第10-11页 |
| 1.3.1 远缘杂交与新物种的形成 | 第10页 |
| 1.3.2 植物远缘杂交与基因组进化 | 第10-11页 |
| 1.3.3 远缘杂交可以激活沉默的转座子 | 第11页 |
| 1.4 本研究的背景、目的和意义 | 第11-13页 |
| 2 材料方法 | 第13-23页 |
| 2.1 实验材料 | 第13页 |
| 2.2 实验方法 | 第13-23页 |
| 2.2.1用改良的 CTAB 法提取实验材料叶片的基因组 DNA | 第13-14页 |
| 2.2.2 全基因组的重测序技术 | 第14页 |
| 2.2.3 基因组原位杂交（GISH） | 第14-15页 |
| 2.2.4 转座子活性的识别与鉴定 | 第15-16页 |
| 2.2.5 Southern blot分析检测 | 第16-20页 |
| 2.2.6 总RNA提取纯化与反转录 | 第20-22页 |
| 2.2.7 数据分析 | 第22-23页 |
| 3 结果与分析 | 第23-28页 |
| 3.1 渐渗杂交系的鉴定与表型 | 第23-24页 |
| 3.2 全基因组测序揭示X9中多个转座子的转座情况 | 第24-26页 |
| 3.3 通过位点特异性PCR扩增和Southern技术验证X9中转座子的转座情况 | 第26-27页 |
| 3.4 X9中转座子的转座对相邻基因表达的改变 | 第27-28页 |
| 4 讨论 | 第28-31页 |
| 4.1 菰的授粉行为是转座子转座的根本原因 | 第28-29页 |
| 4.2 转座子转座对基因功能的影响 | 第29页 |
| 4.3 外源授粉诱导转座子转座对植物基因组进化和作物改良的影响 | 第29-31页 |
| 结论 | 第31-32页 |
| 参考文献 | 第32-37页 |
| 附录 | 第37-51页 |
| 致谢 | 第51页 |
