基于组合分类算法的蛋白质过敏原预测方法研究和平台开发
摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第一章 绪论 | 第10-16页 |
1.1 研究背景 | 第10-11页 |
1.2 研究意义 | 第11-12页 |
1.3 研究现状 | 第12-15页 |
1.3.1 过敏原预测研究现状 | 第12-14页 |
1.3.2 存在问题和挑战 | 第14-15页 |
1.4 本文主要工作和组织结构 | 第15-16页 |
1.4.1 主要工作 | 第15页 |
1.4.2 章节安排 | 第15-16页 |
第二章 蛋白质过敏原预测的理论研究 | 第16-24页 |
2.1 过敏原预测基本框架 | 第16-19页 |
2.1.1 基于序列对比的过敏原预测 | 第16-17页 |
2.1.2 基于特征的过敏原预测方法 | 第17-19页 |
2.2 过敏原预测代表方法 | 第19-22页 |
2.2.1 WHO/FAO方法 | 第19页 |
2.2.2 Motif-based方法 | 第19-20页 |
2.2.3 基于指纹描述符的过敏原预测方法 | 第20-22页 |
2.2.4 基于支持向量机的方法 | 第22页 |
2.3 本章小结 | 第22-24页 |
第三章 基于组合分类器的蛋白质过敏原预测方法 | 第24-32页 |
3.1 实验数据集 | 第24-25页 |
3.2 特征提取 | 第25-26页 |
3.3 特征降维 | 第26-28页 |
3.3.1 主成分分析 | 第26-28页 |
3.3.2 生成特征 | 第28页 |
3.4 分类方法 | 第28-29页 |
3.4.1 组合分类算法 | 第28-29页 |
3.4.2 Boosting | 第29页 |
3.5 交叉验证 | 第29-30页 |
3.6 预测算法的评价标准 | 第30-31页 |
3.7 本章小结 | 第31-32页 |
第四章 对比实验 | 第32-36页 |
4.1 实验设备与环境 | 第32页 |
4.2 实验设计 | 第32页 |
4.3 实验结果与分析 | 第32-34页 |
4.3.1 准确率 | 第32-33页 |
4.3.2 查全率 | 第33-34页 |
4.3.3 F1综合评定指标 | 第34页 |
4.4 附加实验 | 第34-35页 |
4.5 本章小结 | 第35-36页 |
第五章 蛋白质过敏原预测服务平台分析与设计 | 第36-50页 |
5.1 可行性研究 | 第36页 |
5.2 需求分析 | 第36-37页 |
5.3 概要设计 | 第37页 |
5.4 详细设计 | 第37-40页 |
5.4.1 过敏原信息查询模块 | 第37-39页 |
5.4.2 过敏原预测模块 | 第39-40页 |
5.5 编码实现 | 第40-43页 |
5.5.1 Maven Web APP | 第40-41页 |
5.5.2 数据库长连接 | 第41页 |
5.5.3 Spring MVC框架 | 第41-42页 |
5.5.4 上传/下载文件 | 第42-43页 |
5.5.5 DisplayTag | 第43页 |
5.6 系统测试 | 第43-49页 |
5.6.1 软硬件环境测试 | 第43页 |
5.6.2 性能测试 | 第43-44页 |
5.6.3 功能测试 | 第44-49页 |
5.7 本章小结 | 第49-50页 |
第六章 总结与展望 | 第50-52页 |
6.1 总结 | 第50页 |
6.2 展望 | 第50-52页 |
参考文献 | 第52-54页 |
致谢 | 第54页 |