摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-9页 |
1 绪论 | 第13-28页 |
1.1 抗艾滋病药物的介绍 | 第13-15页 |
1.1.1 HIV蛋白酶 | 第13-14页 |
1.1.2 HIV-1 非核苷类逆转录酶 | 第14-15页 |
1.2 计算机辅助药物设计方法 | 第15-17页 |
1.2.1 基于受体的药物设计(直接药物设计) | 第15-16页 |
1.2.2 基于配体的药物设计(间接药物设计) | 第16-17页 |
1.3 QSAR研究方法与原理 | 第17-23页 |
1.3.1 比较分子力场分析方法(CoMFA) | 第18-19页 |
1.3.2 比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法 | 第19页 |
1.3.3 三维全息原子场作用矢量法 | 第19-21页 |
1.3.4 QASR的建模方法 | 第21-22页 |
1.3.5 模型评价 | 第22-23页 |
1.4 分子对接 | 第23-26页 |
1.4.1 FlexX | 第24页 |
1.4.2 DOCK | 第24页 |
1.4.3 Surflex-Dock | 第24页 |
1.4.4 AutoDock | 第24-25页 |
1.4.5 分子对接的基本步骤 | 第25-26页 |
1.4.6 分子对接的原理 | 第26页 |
1.5 课题研究的目的和意义 | 第26-28页 |
1.5.1 研究目的 | 第26页 |
1.5.2 研究意义 | 第26-28页 |
2 HIV蛋白酶抑制剂的 3D-QSAR和分子对接研究 | 第28-37页 |
2.1 数据集划分 | 第28-30页 |
2.2 模型建立 | 第30-31页 |
2.2.1 分子建模和对齐 | 第30页 |
2.2.2 偏最小二乘回归 | 第30-31页 |
2.2.3 分子对接 | 第31页 |
2.3 结果与讨论 | 第31-36页 |
2.3.1 CoMSIA分析 | 第31-34页 |
2.3.2 药物分子设计 | 第34-35页 |
2.3.3 对接研究 | 第35-36页 |
2.4 小结 | 第36-37页 |
3 5, 6-二氢2吡喃酮的3D-QSAR和对接研究 | 第37-42页 |
3.1 数据集划分 | 第37-39页 |
3.2 模型建立 | 第39-40页 |
3.3 结果与讨论 | 第40-41页 |
3.3.1 药物分子设计 | 第40页 |
3.3.2 对接研究 | 第40-41页 |
3.4 小结 | 第41-42页 |
4 HIV-1 逆转录酶抑制剂的 3D-QSAR和分子对接研究 | 第42-48页 |
4.1 数据集划分 | 第42-44页 |
4.1.1 软件与硬件 | 第42页 |
4.1.2 数据集划分 | 第42-44页 |
4.2 模型建立 | 第44页 |
4.3 结果与讨论 | 第44-47页 |
4.3.1 多元线性回归模型 | 第44-45页 |
4.3.2 分子对接研究 | 第45-47页 |
4.4 小结 | 第47-48页 |
5 3D-QSAR和对接研究HIV-1 蛋白酶抑制剂 | 第48-56页 |
5.1 数据集划分 | 第48-50页 |
5.2 模型建立 | 第50-52页 |
5.2.1 PLS建模 | 第50-51页 |
5.2.2 MLR建模 | 第51页 |
5.2.3 分子对接 | 第51-52页 |
5.3 结果与讨论 | 第52-55页 |
5.3.1 模型分析 | 第52-53页 |
5.3.2 对接结果分析 | 第53-55页 |
5.4 小结 | 第55-56页 |
6 QSAR和分子对接研究噻唑烷甲酸衍生物 | 第56-65页 |
6.1 数据集划分 | 第56-60页 |
6.2 模型建立 | 第60-61页 |
6.2.1 建模方法 | 第60页 |
6.2.2 MLR模型的建立 | 第60-61页 |
6.3 结果与讨论 | 第61-64页 |
6.3.1 模型分析 | 第61-62页 |
6.3.2 药物分子设计 | 第62-63页 |
6.3.3 分子对接研究 | 第63-64页 |
6.4 小结 | 第64-65页 |
7 结论、创新点与展望 | 第65-66页 |
7.1 结论 | 第65页 |
7.2 创新点 | 第65页 |
7.3 展望 | 第65-66页 |
致谢 | 第66-67页 |
参考文献 | 第67-75页 |
攻读学位论文期间发表的学术论文 | 第75页 |