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小鼠胚胎成纤维细胞mTORC1调控蛋白的鉴定及功能研究

致谢第1-6页
摘要第6-8页
ABSTRACT第8-10页
专业词汇中英文对照表第10-20页
第一章 绪论第20-42页
   ·导言第20-21页
   ·mTORC1和mTORC2第21-23页
     ·mTOR的保守结构域第21页
     ·mTORC1和mTORC2的组成蛋白第21-22页
     ·Rapamycin对mTORC1和mTORC2的抑制作用第22-23页
   ·mTORC1信号通路第23-36页
     ·mTORC1的上游信号通路第23-28页
       ·生长因子第23-25页
       ·氨基酸第25-27页
       ·能量状态第27页
       ·低氧胁迫第27页
       ·其它上游信号第27-28页
     ·mTORC1活化的分子机制模型第28-29页
     ·mTORC1的底物第29-30页
     ·mTORC1调控多种细胞功能第30-36页
       ·mTORC1与蛋白质合成第30-31页
       ·mTORC1与基因转录第31-34页
       ·mTORC1与自噬第34-35页
       ·mTORC1与细胞周期第35-36页
       ·mTORC1与能量代谢第36页
       ·mTORC1与衰老第36页
   ·mTORC2信号通路简介第36-37页
   ·mTORC1与疾病第37-39页
   ·组学被用于mTORC1下游功能的相关研究第39-40页
   ·结语第40-42页
第二章 小鼠胚胎成纤维细胞mTORC1调控蛋白的鉴定第42-64页
   ·引言第42-43页
   ·材料与方法第43-52页
     ·实验材料第43-45页
       ·细胞系第43页
       ·主要试剂第43-44页
         ·抗体第43页
         ·其它第43-44页
       ·主要仪器第44页
       ·计算机分析软件第44-45页
     ·实验方法第45-52页
       ·细胞的处理第45页
       ·细胞的裂解第45页
       ·丙酮沉淀第45页
       ·蛋白质的浓度测定第45-46页
         ·标准曲线的绘制第46页
         ·样品中蛋白质浓度的测定第46页
       ·十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰氨凝胶电泳(SDS-PAGE)第46-48页
       ·Western blot(免疫印迹)第48页
       ·蛋白质的溶液内酶解消化第48-49页
       ·iTRAQ标记第49页
       ·肽段的预分离(SCX-HPLC)第49-50页
       ·肽段的除盐第50页
       ·MALDI-TOF/TOF质谱检测第50页
       ·LC-MS/MS分析第50-51页
       ·数据库搜索及数据的过滤第51页
       ·蛋白的定量分析及功能聚类分析第51-52页
   ·实验结果第52-63页
     ·mTORC1活化/抑制细胞模型的验证第52-53页
     ·定量蛋白质组学研究策略及流程第53-54页
     ·蛋白质组学结果的定性分析第54-55页
     ·蛋白质组学结果的定量分析第55-56页
     ·TSC2调控蛋白的鉴定第56-57页
     ·Rapamycin调控蛋白的鉴定第57页
     ·mTORC1调控蛋白的确定第57-63页
     ·mTORC1调控蛋白的功能聚类分析第63页
   ·小结第63-64页
第三章 mTORC1正调控核转运蛋白质KPNA2的表达第64-84页
   ·引言第64页
   ·材料与方法第64-70页
     ·实验材料(部分同第二章)第64-66页
       ·细胞系第64页
       ·主要试剂第64-65页
         ·抗体(部分同2.2.1.2.1)第64-65页
         ·siRNA第65页
         ·酶类第65页
         ·引物第65页
         ·其它(部分同2.2.1.2.2)第65页
       ·主要仪器(部分同2.2.1.3)第65-66页
       ·计算机分析软件第66页
     ·实验方法(部分同第二章)第66-70页
       ·细胞裂解液的提取第66页
       ·蛋白质的浓度测定第66-67页
         ·标准曲线的绘制第66-67页
         ·样品中蛋白质浓度的测定第67页
       ·SDS-PAGE(同2.2.2.5)第67页
       ·Western blot(同2.2.2.6)第67页
       ·细胞总RNA的提取第67页
       ·反转cDNA第一链第67-68页
       ·Real-time PCR第68-69页
       ·RNA干扰实验(RNA interference,RNAi)第69页
       ·免疫荧光第69-70页
   ·实验结果第70-82页
     ·mTORC1活化上调多个蛋白质核输入通路中关键蛋白的丰度第70-71页
     ·验证mTORC1对KPNA2、RanBP2和RanGAP1的调控第71-79页
       ·验证TSC2~(-/-)和Rapamycin对KPNA2、RanBP2和RanGAP1的影响第71-74页
       ·免疫荧光检测mTORC1对KPNA2、RanBP2和RanGAP1的影响第74-75页
       ·血清诱导mTORC1活化对KPNA2、RanBP2和RanGAP1丰度的影响第75-76页
       ·mTORC2对KPNA2、RanGAP1和RanBP2丰度的影响第76页
       ·在多种细胞系中检测mTORC1对KPNA2、RanGAP1和RanBP2的影响第76-79页
     ·mTORC1调控KPNA2丰度的机制研究第79-82页
       ·抑制S6K1不影响KPNA2的蛋白丰度第79-80页
       ·敲低4E-BP1不影响KPNA2的蛋白丰度第80-81页
       ·mTORC1活化正调控KPNA2的mRNA丰度第81-82页
   ·小结第82-84页
第四章 KPNA2参与mTORC1对糖酵解基因的表达调控第84-94页
   ·引言第84页
   ·材料与方法第84-86页
     ·实验材料(部分同第二、三章)第84-85页
       ·细胞系(同2.2.1.1)第84页
       ·主要试剂第84-85页
         ·抗体(部分同2.2.1.2.1、3.2.1.2.1)第84页
         ·siRNA(部分同3.2.1.2.2)第84页
         ·酶类(同3.2.1.2.3)第84页
         ·引物(部分同3.2.1.2.4)第84-85页
         ·其它(同3.2.1.5)第85页
       ·主要仪器(同3.2.1.6)第85页
       ·计算机分析软件(同3.2.1.7)第85页
     ·实验方法(部分同第二、三章)第85-86页
       ·细胞裂解液的提取(同3.2.2.1)第85页
       ·细胞质和细胞核组分的分离第85页
       ·蛋白质的浓度测定(同3.2.2.2)第85页
       ·SDS-PAGE及Western blot(同2.2.2.5和2.2.2.6)第85页
       ·细胞总RNA的提取(同3.2.2.4)第85页
       ·反转cDNA第一链(同3.2.2.5)第85-86页
       ·Real-time PCR(同3.2.2.6)第86页
       ·RNA干扰实验(同3.2.2.8)第86页
   ·实验结果第86-92页
     ·mTORC1活化正调控糖酵解基因的表达第86-87页
     ·KPNA2参与mTORC1对糖酵解基因的表达调控第87-88页
     ·mTORC1活化正调控HIF1α的表达第88-89页
     ·HIF1α参与mTORC1糖酵解基因的表达调控第89-90页
     ·敲低KPNA2不影响HW1α的表达及亚细胞定位第90-91页
     ·敲低HIF1α不影响KPNA2的表达第91-92页
   ·小结第92-94页
第五章 讨论第94-102页
   ·鉴定mTORC1调控蛋白的实验策略第94-95页
   ·mTORC1调控多条代谢通路第95-97页
   ·mTORC1对蛋白质核输入通路的影响第97页
   ·KPNA2在肿瘤细胞中过表达的分子机制第97页
   ·mTORC1调控KPNA2表达的分子机制第97-99页
   ·mTORC1对RanGAP1/RanBP2和KPNA2的不同影响第99页
   ·mTORC1对糖酵解通路的影响第99-100页
   ·KPNA2对于研究mTORC1的重要意义第100-102页
基本结论第102-104页
参考文献第104-122页
附表第122-136页
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果第136-137页

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