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枣基因组微卫星及核苷酸序列变化特征分析

致谢第1-4页
摘要第4-5页
Abstract第5-9页
第一章 文献综述第9-22页
   ·枣树研究进展第9-13页
     ·枣树的分布概况第9页
     ·生物学特征第9页
     ·利用价值第9-10页
     ·枣树种质资源研究进展第10-13页
       ·形态学性状第11页
       ·细胞学研究第11页
       ·孢粉研究第11页
       ·同工酶学研究第11-12页
       ·枣树分子标记研究第12-13页
   ·高通量测序技术研究进展第13-15页
     ·罗氏/454GS-FLX 平台第13-14页
     ·Illumina 的 GA/HiSeq 平台第14页
     ·AB SOLiD 平台第14-15页
   ·基因组核苷酸变化特征研究第15-18页
     ·真核生物基因组中的简单重复序列第15页
     ·微卫星在真核生物基因组中的分布第15页
     ·微卫星的起源与消亡第15-16页
     ·微卫星的不稳定性第16页
     ·微卫星的功能第16页
       ·作为染色质折叠的密码第16页
       ·与性别决定有关第16页
       ·与结构基因表达相关第16页
       ·作为重组和复制密码第16页
     ·微卫星标记的开发第16-17页
     ·微卫星标记的应用第17-18页
       ·亲缘关系的比较和鉴定第17页
       ·疾病的诊断和鉴别第17页
       ·遗传图谱及 QTL 分析第17-18页
       ·种群研究及生物保种第18页
   ·单核苷酸多态性及其研究进展第18-20页
     ·SNP 的概念及特点第18页
     ·SNP 的发现和检测第18-19页
       ·直接测序法(direct sequencing)第18-19页
       ·基因芯片(gene chips)第19页
       ·阵列杂交法(array hybridization)第19页
       ·同源杂交(homogenous hybridization)第19页
       ·限制性酶切法第19页
     ·SNP 在植物遗传研究中的应用第19-20页
       ·SNP 用作遗传标记第19-20页
       ·SNP 用于绘制 EST 图谱第20页
       ·SNP 用于遗传图谱和物理图谱的整合第20页
       ·SNP 用于 QTL 定位第20页
   ·插入与缺失突变的研究(InDels)第20-22页
     ·插入比缺失多第21页
     ·单个碱基的插入与缺失最多第21页
     ·插入与缺失的碱基组成第21页
     ·插入与缺失在进化中的作用第21-22页
第二章 枣树基因组测序第22-26页
   ·前言第22页
   ·材料与方法第22-24页
     ·试验材料第22页
     ·主要试剂配制第22页
     ·仪器与设备第22-23页
     ·实验方法第23-24页
       ·基因组 DNA 的提取第23页
       ·基因组 DNA 浓度测定和质量检测第23页
       ·枣树基因组测序文库构建及测序第23-24页
     ·实验技术路线第24页
   ·结果与分析第24-26页
     ·DNA 质量检测结果与分析第24-25页
     ·测序及拼接结果第25-26页
第三章 枣树基因组微卫星特征分析第26-33页
   ·前言第26页
   ·枣树基因组微卫星的查找第26页
   ·结果与分析第26-30页
     ·微卫星序列查找结果第26-27页
     ·枣基因组微卫星丰度分析第27-28页
     ·枣基因组微卫星优势重复单元碱基组成第28页
     ·枣基因组微卫星长度分布及变异分析第28-30页
     ·枣基因组微卫星侧翼序列分析第30页
   ·讨论第30-33页
     ·枣优势重复碱基类型分析第30页
     ·枣优势重复单元碱基组成分析第30-31页
     ·枣不同长度重复单元微卫星长度变异情况分析第31页
     ·枣基因组微卫星侧翼序列分析第31-33页
第四章 枣树 SNP 多态性及 InDel(插入和缺失)序列特征分析第33-36页
   ·前言第33页
   ·枣树基因组 SNP 和 InDel(插入和缺失)的查找第33页
   ·结果与分析第33-35页
     ·SNP 查找后结果分析第33-34页
     ·枣树 SNP 及 InDel 的特征分析第34-35页
   ·枣树 SNP 多态性及 InDel(插入和缺失)序列特征分析第35-36页
第五章 主要研究成果及展望第36-37页
   ·主要研究成果第36页
   ·展望第36-37页
攻读学位期间发表的学术论文第37-38页
参考文献第38-43页

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