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杜氏盐藻磷脂酶C基因DsPLC的克隆和表达分析

摘要第1-6页
Abstract第6-15页
第一章 综述第15-25页
 1 盐藻及其耐盐机制的研究进展第15-20页
   ·盐藻介绍第15-16页
   ·盐藻的应用价值第16页
   ·盐藻耐盐机制的研究进展第16-20页
     ·渗透调节第17-19页
     ·Na+外排第19-20页
 2 磷脂酶 C 及其研究进展第20-23页
   ·磷脂酶概述第20-21页
   ·磷脂酶 C 研究进展第21-23页
     ·PLC 参与外界胁迫研究进展第21-22页
     ·植物 PLC 途径的调控机制研究进展第22-23页
 3 研究目的和意义第23-24页
 4 研究内容第24-25页
第二章 盐藻 DsPLC 基因全长 cDNA 的克隆第25-44页
 1 实验材料第25-26页
   ·藻种第25页
   ·菌种和质粒第25页
   ·主要试剂第25页
   ·主要实验仪器第25-26页
   ·引物序列第26页
 2 实验方法第26-36页
   ·盐藻总 RNA 的提取及质量检测第26-28页
     ·盐藻总 RNA 的提取第26-27页
     ·RNA 的质量检测第27-28页
   ·DsPLC 中间段保守序列的 PCR 扩增第28-29页
     ·简并引物的设计第28页
     ·反转录第28-29页
     ·中间段保守序列的 PCR 扩增第29页
   ·电泳检测、凝胶回收、连接、转化第29-31页
     ·电泳检测第29页
     ·凝胶回收第29-30页
     ·感受态细胞的制备及转化第30-31页
     ·目的基因与 pMD18-T 载体连接和转化第31页
   ·双酶切和质粒 PCR 鉴定第31-33页
     ·质粒提取第31-32页
     ·双酶切和质粒 PCR 鉴定第32-33页
   ·RACE 扩增 DsPLC 的 5′末端和 3′末端第33-35页
     ·RACE 引物的设计第33页
     ·RACE 的反转录第33-34页
     ·3′RACE 扩增反应第34-35页
     ·目的片段的检测第35页
     ·5′RACE 扩增反应第35页
   ·PCR 扩增 DsPLC 全长序列第35-36页
     ·引物设计第35-36页
     ·PCR 扩增全长序列第36页
     ·目的片段的检测第36页
 3 实验结果第36-42页
   ·盐藻总 RNA 的提取第36-37页
   ·PCR 扩增 DsPLC 保守中间片段序列第37-38页
     ·氨基酸多序列比对和简并引物的设计第37页
     ·中间片段序列的扩增以及双酶切、质粒 PCR 鉴定第37-38页
   ·RACE 扩增 DsPLC 的 3′末端和 5′末端第38-41页
     ·RACE 扩增 DsPLC 的 3′末端第38-40页
     ·RACE 扩增 DsPLC 的 5′末端第40-41页
   ·PCR 扩增 DsPLC 全长序列第41-42页
 4 讨论第42-44页
   ·RNA 的提取第42页
   ·RACE 扩增第42-44页
第三章 盐藻 DsPLC 基因的生物信息学分析第44-55页
 1 分析方法第44-46页
   ·核酸序列分析第44页
     ·核酸序列组成分析第44页
     ·开放阅读框(ORF)分析第44页
     ·稀有密码子和酶切位点分析第44页
   ·氨基酸序列分析第44-46页
     ·氨基酸序列基本理化性质分析第44-45页
     ·亚细胞定位分析第45页
     ·跨膜区预测第45页
     ·信号肽分析第45页
     ·保守结构域和功能区域预测第45页
     ·磷酸化位点预测第45页
     ·蛋白质高级结构预测第45页
     ·进化分析第45-46页
 2 分析结果第46-53页
   ·核酸序列分析第46-49页
     ·核酸序列组成分析第46页
     ·开放阅读框(ORF)分析第46-48页
     ·稀有密码子和酶切位点分析第48-49页
   ·氨基酸序列分析第49-53页
     ·氨基酸基本理化性质分析第49页
     ·亚细胞定位分析第49页
     ·跨膜区域预测第49-50页
     ·信号肽分析第50-51页
     ·保守结构域和功能区域预测第51页
     ·磷酸化位点预测第51-52页
     ·蛋白质高级结构预测第52-53页
     ·进化分析第53页
 3 讨论第53-55页
第四章 高盐胁迫对盐藻 DsPLC 基因表达的影响第55-61页
 1 实验材料第55页
   ·藻种第55页
   ·主要试剂第55页
   ·实验仪器第55页
 2 实验方法第55-58页
   ·盐藻高盐胁迫的处理第55页
   ·盐藻总 RNA 的提取和质量的检测第55-56页
   ·反转录第56页
   ·特异引物和内参引物的设计及验证第56页
   ·相对标准曲线的制作第56-57页
   ·实时荧光定量 PCR第57页
   ·实验结果的处理第57-58页
 3 实验结果第58-60页
   ·盐藻总 RNA 质量和浓度的检测第58页
   ·引物特异性的检验结果第58页
   ·相对标准曲线的制作第58-59页
   ·荧光定量 PCR 结果第59-60页
 4 讨论第60-61页
结论与展望第61-62页
参考文献第62-67页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第67-70页
致谢第70-71页
附录第71页

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