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硫化叶菌CRISPR/Cas系统Csa3a对aCas基因转录激活的研究

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
缩略语表第9-11页
1 前言第11-29页
   ·古菌第11-13页
   ·硫化叶菌第13-14页
   ·硫化叶菌遗传操作体系第14-19页
   ·原核生物CRISPR/Cas获得性免疫系统第19-25页
   ·CRISPR免疫适应阶段机制第25-27页
   ·古菌启动子主要元件第27页
   ·研究目的及内容第27-29页
2 材料与方法第29-41页
   ·实验材料第29-32页
     ·菌株和质粒第29页
     ·培养基成分及培养条件第29-31页
     ·主要仪器和分子生物学试剂第31-32页
   ·实验方法与原理第32-41页
     ·敲除载体构建第32-34页
     ·缺失菌株筛选第34-35页
     ·硫化叶菌S.islandicus E233S感受态细胞制备和电击转化法第35-36页
     ·硫化叶菌总RNA抽提第36-37页
     ·反转录荧光定量PCR第37-38页
     ·大肠杆菌DH5a感受态制备和热击转化法第38页
     ·Csa3a蛋白的表达和纯化第38-39页
     ·SDS-PAGE和蛋白保存和抗体制备第39页
     ·凝胶阻滞分析(EMSA)第39-41页
3 结果与分析第41-56页
   ·构建敲除载体第41-43页
   ·缺失菌株的筛选第43-44页
   ·Csa3a蛋白的表达纯化第44-46页
   ·csa3a、cmr2a、cmr2b缺失菌株Targeting功能检测第46-48页
     ·CRISPR功能验证载体构建第46-47页
     ·缺失菌株CRISPR功能验证第47-48页
   ·反转录荧光定量PCR确定csa3a缺失菌株acas基因转录量变化第48-50页
   ·凝胶阻滞实验(EMSA)确定Csa3a结合位点第50-56页
       ·激活位点初步探索第50-51页
     ·csal结合位点初步探究第51-52页
     ·csal结合位点的确定第52-53页
     ·casl结合位点的确定第53-56页
4 讨论第56-58页
参考文献第58-65页
附录第65-67页
硕士期间学术成果第67-68页
致谢第68页

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