| 缩略语表 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-21页 |
| ·研究背景 | 第11页 |
| ·湖泊微生物的研究方法 | 第11-19页 |
| ·分子生物学方法在环境微生物学中的应用 | 第11-12页 |
| ·分子生物学方法 | 第12-13页 |
| ·本研究涉及的分子生物学研究方法 | 第13-15页 |
| ·末端限制性片段长度多态性(T-RFLP) | 第13页 |
| ·高通量测序技术 | 第13-15页 |
| ·宏基因组学 | 第15页 |
| ·其他分子生物学方法简介 | 第15-19页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第15-16页 |
| ·实时定量PCR(real-time PCR) | 第16-17页 |
| ·单链构象多态性(SSCP) | 第17-18页 |
| ·原位荧光杂交技术(FISH) | 第18页 |
| ·基因芯片技术 | 第18-19页 |
| ·本研究的研究内容和研究意义 | 第19-21页 |
| ·研究内容 | 第19-20页 |
| ·研究意义 | 第20-21页 |
| 第二章 水生植物分解实验设计和体系构建 | 第21-24页 |
| ·引言 | 第21页 |
| ·采样点和样品采集 | 第21-22页 |
| ·分解实验设计和体系构建 | 第22-24页 |
| 第三章 水生植物分解过程中细菌的T-RFLP | 第24-37页 |
| ·引言 | 第24页 |
| ·材料与方法 | 第24-28页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第24-25页 |
| ·浮游细菌和沉积物细菌的T-RFLP分析 | 第25-26页 |
| ·细菌种群组成及变化的多样性指数 | 第26-28页 |
| ·细菌群落结构相似性分析 | 第28页 |
| ·结果与分析 | 第28-35页 |
| ·基因组DNA提取结果 | 第28-29页 |
| ·PCR扩增结果 | 第29页 |
| ·水体浮游细菌多样性分析 | 第29-32页 |
| ·水体理化指标 | 第29-30页 |
| ·水体浮游细菌的多样性指数分析 | 第30-31页 |
| ·水体浮游细菌群落结构的相似性分析 | 第31-32页 |
| ·表层沉积物细菌多样性分析 | 第32-35页 |
| ·表层沉积物细菌多样性指数分析 | 第32-34页 |
| ·表层沉积物细菌群落结构的相似性分析 | 第34页 |
| ·第30d表层沉积物细菌群落结构的相对丰度分析 | 第34-35页 |
| ·小结与讨论 | 第35-37页 |
| 第四章 454测序技术研究细菌群落多样性和种类 | 第37-45页 |
| ·引言 | 第37页 |
| ·基因组DNA提取方法 | 第37页 |
| ·实验结果 | 第37-43页 |
| ·30d表层沉积物细菌群落α-多样性分析 | 第37-40页 |
| ·高通量454测序序列与GenBank中已知序列比对结果 | 第40-43页 |
| ·门分类水平上的相对分度分析和聚类分析 | 第40-41页 |
| ·纲(class)分类水平上的相对分度分析 | 第41-42页 |
| ·科(family)分类水平上的相对分度分析 | 第42-43页 |
| ·小结与讨论 | 第43-45页 |
| 第五章 水生植物分解过程中真菌群落结构 | 第45-53页 |
| ·引言 | 第45页 |
| ·材料和方法 | 第45-48页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第46页 |
| ·巢式PCR引物对的确定 | 第46-47页 |
| ·克隆和测序 | 第47页 |
| ·测序结果的处理和统计分析 | 第47-48页 |
| ·实验结果与分析 | 第48-51页 |
| ·PCR产物电泳结果 | 第48-49页 |
| ·克隆,测序和系统发生树 | 第49-51页 |
| ·小结与讨论 | 第51-53页 |
| 第六章 结论与展望 | 第53-56页 |
| ·本研究的结论 | 第53-54页 |
| ·本研究的价值 | 第54页 |
| ·研究展望 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-62页 |
| 参与科研项目和论文 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |