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副猪嗜血杆菌脂蛋白PalA基因的克隆及生物信息学分析

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
1. 文献综述第11-23页
     ·副猪嗜血杆菌研究进展第11-21页
       ·病原学和血清学研究进展第11-13页
       ·基因分型研究第13-14页
       ·细菌分离鉴定与培养第14页
       ·致病机理第14-15页
       ·副猪嗜血杆菌毒力因子的研究第15-19页
       ·临床用药的研究第19-20页
       ·预防和免疫第20-21页
     ·生物信息学在病原研究中的应用第21-22页
     ·课题研究的目的和意义第22-23页
2. 材料和设备第23-26页
     ·试验材料第23-24页
       ·病料第23页
       ·试验所涉及的菌株和质粒第23页
       ·试验所涉及的酶,试剂盒及生化试剂第23-24页
     ·主要仪器设备第24-25页
     ·分析软件及网站第25-26页
3. 实验方法第26-36页
     ·副猪嗜血杆菌的分离鉴定第26-27页
       ·培养基的制备第26页
       ·细菌的分离培养第26页
       ·NAD依赖性试验第26页
       ·CAMP试验第26页
       ·生化试验第26-27页
       ·血清型鉴定第27页
     ·PalA基因的克隆第27-32页
       ·PalA基因的引物设计与合成第27页
       ·PaLA基因的PCR扩增第27-28页
       ·PaLA基因PCR扩增产物胶回收第28-29页
       ·PCR纯化产物与pMD19-T Vector连接第29页
       ·DH5α感受态细胞的制备(CaCl_2法)第29-30页
       ·连接产物的转化第30-31页
       ·重组质粒提取第31页
       ·重组质粒测序第31-32页
       ·重组质粒的双酶切第32页
     ·pET32a-PalA表达载体的构建第32-34页
       ·表达载体pET32a进行双酶切第32-33页
       ·目的片段与载体片段的连接第33页
       ·载体质粒的修复转化到DH5α及阳性菌株的筛选第33页
       ·表达载体质粒的提取第33页
       ·重组质粒测序第33页
       ·BL21感受态细胞的制备(CaCl_2法)第33页
       ·重组表达载体的转化第33-34页
       ·阳性检测第34页
     ·生物信息学分析第34-36页
       ·ORF的查找分析第34页
       ·蛋白质理化性质分析第34页
       ·蛋白质的疏水性分析第34页
       ·蛋白质跨膜区分析第34页
       ·蛋白质的主要抗原域预测第34页
       ·蛋白质的表面可能性预测第34-35页
       ·蛋白质的信号肽预测第35页
       ·氨基酸二级结构的预测第35页
       ·蛋白质三维结构预测第35页
       ·序列同源性和相似性搜索第35页
       ·多序列比对和系统进化树的建立第35-36页
4. 结果与分析第36-50页
     ·副猪嗜血杆菌的分离鉴定第36-37页
       ·细菌的分离培养特性第36页
       ·细菌的鉴定结果第36-37页
       ·血清型鉴定第37页
     ·HPS四川分离株PaLA基因的克隆第37-40页
       ·PaLA基因的PCR扩增第37-38页
       ·pMD19-T-PalA克隆载体的获得第38-40页
     ·pET32a-PalA表达载体的构建第40-42页
       ·重组表达载体pET32a-PalA的获得第40页
       ·表达菌株BL21(pET32a-PalA)的获得第40-42页
     ·HPS-PalA生物信息学分析第42-50页
       ·HPS-PalA基因编码氨基酸序列基本理化性质的分析第42-43页
       ·HPS-PalA基因编码蛋白质的疏水性分析第43页
       ·跨膜区分析第43-44页
       ·PalA基因编码蛋白质的主要抗原域预测第44页
       ·HPS-PalA基因编码蛋白质的表面可能性预测第44-45页
       ·HPS-PalA基因编码蛋白信号肽预测第45-46页
       ·HPS-PalA基因编码蛋白质的二级结构预测第46-47页
       ·蛋白质三维结构预测第47-48页
       ·进化树分析第48-50页
5. 讨论第50-53页
     ·副猪嗜血杆菌的分离鉴定第50页
     ·PaLA基因的PCR扩增及克隆第50-51页
     ·pET32a-PalA表达载体的构建第51页
     ·PaLA基因的生物信息学分析第51-53页
6. 结论第53-54页
参考文献第54-59页
致谢第59页

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