| 摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-22页 |
| ·研究背景 | 第14-16页 |
| ·课题来源 | 第14页 |
| ·生物信息学及其主要研究方向 | 第14页 |
| ·生物信息分析系统的定义 | 第14-16页 |
| ·棉花生物信息数据库的国内外研究概况 | 第16-17页 |
| ·基因本体论的提出 | 第17-19页 |
| ·论文的研究方法、主要研究内容和意义 | 第19-20页 |
| ·论文的研究方法 | 第19页 |
| ·论文的主要研究内容和意义 | 第19-20页 |
| ·论文的章节结构 | 第20-22页 |
| 第二章 基因本体论研究概述 | 第22-38页 |
| ·本体概述 | 第22-25页 |
| ·本体的概念和组成 | 第22-24页 |
| ·本体的分类和作用 | 第24-25页 |
| ·基因本体论的结构 | 第25-31页 |
| ·基因本体论的三级标准语言 | 第25-26页 |
| ·基因本体论中的术语及映射文件 | 第26-27页 |
| ·基因本体论的拓扑结构及术语间的关系 | 第27-31页 |
| ·GO术语间语义相似性度量 | 第31-36页 |
| ·语义相似性概述 | 第31-32页 |
| ·基于概念距离的相似度计算 | 第32-33页 |
| ·基于信息量的相似度计算 | 第33-36页 |
| ·GO在生物信息学中的应用 | 第36-38页 |
| ·基因功能注释 | 第36页 |
| ·异构生物数据库整合 | 第36-37页 |
| ·辅助文献检索 | 第37-38页 |
| 第三章 棉花生物信息软件包的开发与应用 | 第38-56页 |
| ·生物信息软件包开发的依据 | 第38-39页 |
| ·现有的典型序列分析软件包 | 第39-41页 |
| ·软件包的设计与实现 | 第41-56页 |
| ·开发环境和工具的选择 | 第42-43页 |
| ·软件包的组织结构 | 第43-45页 |
| ·部分软件的实现 | 第45-56页 |
| 第四章 基于GO的棉花生物信息分析系统的分析与设计 | 第56-70页 |
| ·系统需求分析 | 第56-58页 |
| ·系统的主要功能 | 第58-59页 |
| ·系统的体系结构 | 第59-60页 |
| ·系统关键部分的详细设计 | 第60-70页 |
| ·ETL的实现算法 | 第60-62页 |
| ·数据源之间的互操作 | 第62-63页 |
| ·映射关系的设计 | 第63-64页 |
| ·语义相似性搜索的设计 | 第64-67页 |
| ·主要数据库表之间的关系 | 第67-70页 |
| 第五章 基于GO的棉花生物信息分析系统的实现 | 第70-80页 |
| ·系统开发环境 | 第70页 |
| ·系统软件环境 | 第70页 |
| ·系统硬件环境 | 第70页 |
| ·系统的实现 | 第70-80页 |
| ·系统主要界面 | 第70-71页 |
| ·序列检索 | 第71-72页 |
| ·CMap图谱显示 | 第72-74页 |
| ·数据提交 | 第74页 |
| ·ontology功能 | 第74-78页 |
| ·资源服务 | 第78-80页 |
| 第六章 总结与展望 | 第80-82页 |
| ·总结 | 第80-81页 |
| ·创新点 | 第81页 |
| ·展望 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-88页 |
| 致谢 | 第88页 |