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人类全基因组Sp1结合区域甲基化与基因表达的关联分析

缩略语第1-5页
摘要第5-6页
Abstract第6-7页
目录第7-9页
第1章 绪论第9-15页
   ·课题背景第9页
   ·国内外研究概况第9-14页
     ·DNA甲基化现象第9-10页
     ·Sp1 转录因子第10-12页
     ·已有数据资源第12页
     ·相关预测模型第12-14页
   ·本课题研究目的和意义第14页
   ·技术路线第14-15页
第2章 实验方法第15-19页
   ·实验所用的数据库和软件第15页
     ·实验所用的数据库资源第15页
     ·实验所用的软件第15页
   ·实验方法第15-17页
     ·Sp1 结合位点的获取第15-16页
     ·甲基化数据的预测第16-17页
       ·模型的构建和训练第16-17页
       ·预测分析第17页
     ·基因的表达与功能分类第17页
     ·综合分析第17页
   ·小结第17-19页
第3章 Sp1 结合位点附近甲基化状态的预测第19-24页
   ·Sp1 结合位点位置数据整理第19-21页
   ·Sp1 结合位点附近甲基化状态预测模型的构建第21-23页
     ·模型自身一致性验证第22页
     ·全基因组推广预测第22-23页
   ·小结第23-24页
第4章 Sp1 结合位点附近甲基化同基因分布的关系第24-28页
   ·Sp1 结合位点附近基因分布情况第24-25页
   ·Sp1 结合位点附近甲基化同基因分布的关系第25-26页
   ·小结第26-28页
第5章 Sp1 结合位点附近甲基化状态同基因表达和功能的联系第28-33页
   ·Sp1 结合位点附近基因表达数据第28页
   ·Sp1 结合位点附近甲基化同基因表达的关系第28-30页
     ·同一组织内对比第28-29页
     ·不同组织间对比第29-30页
   ·Sp1 结合位点附近甲基化同基因功能的联系第30-31页
   ·小结第31-33页
结论第33页
展望第33-34页
参考文献第34-37页
附录第37-39页
攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果第39-41页
致谢第41页

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