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猪碱性氨基酸转运载体cDNA克隆及其mRNA表达与调控

摘要第1-5页
Abstract第5-19页
前言第19-23页
第一章 猪肠道碱性氨基酸转运载体RBAT、4F2HC 的电子克隆及序列验证第23-46页
 1 试验材料第24-26页
   ·菌种和质粒第24页
   ·主要试剂及试剂盒第24页
   ·主要仪器设备第24-25页
   ·试剂配制第25-26页
     ·PBS 缓冲液第25页
     ·LB 培养基第25页
     ·TE 缓冲液第25-26页
     ·50 X TAE 电泳缓冲液pH8.0 (1L)第26页
     ·其它试剂第26页
   ·试验动物第26页
 2 试验方法第26-34页
   ·猪rBAT、4F2hc 基因EST 序列检索第26-27页
   ·猪rBAT、4F2hc 基因EST 序列与人的比对分析、电子克隆第27页
   ·猪rBAT、4F2hc 基因的RT-PCR 克隆验证第27-34页
     ·组织样品采集第27页
     ·总RNA 的提取及纯化第27-30页
       ·总RNA 的提取第28页
       ·总RNA 的普通琼脂糖凝胶电泳第28-29页
       ·总RNA 的消化第29页
       ·1%琼脂糖凝胶电泳第29-30页
     ·猪肠道组织cDNA 合成第30页
     ·PCR 扩增rBAT、4F2hc 基因cDNA 部分序列第30-32页
     ·1%琼脂糖凝胶电泳第32页
     ·PCR 产物回收第32页
     ·目的基因片段的T/A 克隆第32-34页
       ·目的基因与T 载体的连接第32-33页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备第33页
       ·重组质粒的转化第33-34页
       ·克隆转化子的扩大培养第34页
       ·重组质粒的PCR 鉴定第34页
     ·序列测定第34页
     ·序列比对分析第34页
 3 结果与分析第34-44页
   ·猪EST 序列的检索第34-35页
   ·猪rBAT、4F2hc 基因cDNA 序列的电子克隆第35-40页
   ·猪rBAT、4F2hc 基因cDNA 序列的试验验证第40-44页
     ·猪肠道总RNA 制备第40页
     ·RT-PCR 结果第40-41页
     ·重组质粒的鉴定第41-42页
     ·克隆片段的核苷酸序列和同源性比较第42-44页
 4 讨论第44页
 5 小结第44-46页
第二章 猪肠道碱性氨基酸转运载体B~(0,+)AT、Y~+LAT1 的分子克隆第46-72页
 1 试验材料第46-47页
   ·菌种和质粒第46页
   ·主要试剂及试剂盒第46-47页
   ·主要仪器设备第47页
   ·试剂配制第47页
   ·试验动物第47页
 2 试验方法第47-57页
   ·b~(0,+)AT、y~+LAT1 cDNA 部分序列的获取第47-48页
     ·b~(0,+)AT 部分序列和y~+LAT1 的EST 序列检索及引物设计第47-48页
     ·组织样品采集第48页
     ·猪肠道总RNA 的提取第48页
   ·b~(0,+)AT、y~+LAT1 已知片段至Poly A 尾端克隆(3'RACE)第48-51页
     ·SMART 3' cDNA 快速扩增(3'RACE)原理第48页
     ·引物设计第48页
     ·cDNA 第一链合成第48-50页
     ·用GSP2 和UPM 进行第一轮PCR 扩增第50页
     ·用NGSP2 和NUP 进行第二轮(nest)PCR 扩增第50页
     ·PCR 产物回收第50-51页
     ·3'RACE 产物的T/A 克隆第51页
     ·序列测定第51页
     ·序列比对分析第51页
   ·b~(0,+)AT、y~+LAT1 已知片段至5'UTR 的克隆(5'RACE)第51-55页
     ·SMART 5' cDNA 末端快速扩增(5'RACE)原理第51-52页
     ·引物设计第52页
     ·cDNA 第一链合成第52-53页
     ·用GSP1 和UPM 进行第一轮PCR 扩增第53-54页
     ·用NGSP1 和NUP 进行第二轮(nest)PCR 扩增第54-55页
     ·PCR 产物回收第55页
     ·5'RACE 产物的T/A 克隆第55页
     ·序列测定第55页
     ·序列比对分析第55页
   ·b~(0,+)AT、y~+LAT1 全基因序列ORF 的克隆第55-56页
     ·引物设计第55-56页
     ·PCR 扩增第56页
     ·重组质粒的构建及克隆(T/A 克隆) 及测序第56页
   ·b~(0,+)AT、y~+LAT1 的序列分析第56-57页
 3 结果与分析第57-70页
   ·猪肠道总RNA 提取第57页
   ·3'RACE 结果第57-59页
   ·5'RACE 结果第59-61页
   ·序列拼接第61页
   ·ORF 的克隆第61页
   ·b~(0,+)AT、y~+LAT1 的序列分析第61-70页
     ·b~(0,+)AT、y~+LAT1 的核酸序列分析第61-65页
     ·b~(0,+)AT、y~+LAT1 的蛋白序列分析第65-70页
       ·理化性质分析第65页
       ·跨膜区分析第65-67页
       ·蛋白质序列比对及功能预测第67-70页
 4 讨论第70-71页
 5 小结第71-72页
第三章 猪肠道碱性氨基酸转运载体RBAT、4F2HC 的 MRNA 表达发育性变化第72-92页
 1 试验材料第72-75页
   ·菌种和质粒第72页
   ·主要试剂和试剂盒第72页
   ·主要仪器设备第72-73页
   ·试剂配制第73页
   ·试验动物与饲养第73-75页
     ·日粮组成及营养水平第73-75页
     ·饲养管理第75页
 2 试验方法第75-80页
   ·组织采样第75-80页
     ·总RNA 的提取及纯化第76页
     ·猪肠道组织cDNA 的合成第76页
     ·引物的设计第76页
     ·PCR 扩增rBAT、4F2hc 基因cDNA 部分序列第76-77页
     ·PCR 产物回收第77页
     ·目的基因片段的T/A 克隆第77页
     ·重组质粒的提取第77-78页
     ·序列测定第78页
     ·序列比对分析第78页
     ·荧光定量PCR第78页
     ·通过标准曲线筛选引物和模板的浓度第78页
     ·实时荧光定量PCR 反应体系第78-80页
   ·数据分析第80页
 3 结果与分析第80-86页
   ·总RNA 的提取第80页
   ·各目的基因RT-PCR 产物测序结果第80页
   ·RFQ-PCR 标准曲线的建立第80-81页
   ·猪肠道组织cDNA 的荧光定量结果第81-86页
     ·长白和蓝塘猪十二指肠rBAT、4F2hc m RNA 表达的发育性变化第81-83页
       ·十二指肠rBAT mRNA 表达的发育性变化第81-82页
       ·十二指肠4F2hc mRNA 表达的发育性变化第82-83页
     ·长白和蓝塘猪空肠rBAT、4F2hc m RNA 表达的发育性变化第83-85页
       ·空肠rBAT mRNA 表达的发育性变化第83-84页
       ·空肠4F2hc mRNA 表达的发育性变化第84-85页
     ·长白和蓝塘猪回肠rBAT、4F2hc m RNA 表达的发育性变化第85-86页
       ·回肠rBAT mRNA 表达的发育性变化第85页
       ·回肠4F2hc mRNA 表达的发育性变化第85-86页
 4 讨论第86-91页
   ·荧光定量的试验方法及数据统计第86-89页
   ·rBAT 和4F2hc m RNA 在猪肠道中的发育性表达谱第89-91页
 5 小结第91-92页
第四章 猪肠道碱性氨基酸转运载体MRNA 表达的组织特异性第92-100页
 1 试验材料第92-93页
   ·菌种和质粒第92页
   ·主要试剂和试剂盒第92页
   ·主要仪器设备第92页
   ·试剂配制第92-93页
   ·试验动物第93页
 2 试验方法第93-95页
   ·组织采样第93页
   ·总RNA 的提取及纯化第93页
   ·猪各个组织cDNA 的合成第93页
   ·引物的设计第93-94页
   ·PCR 扩增rBAT、4F2hc 基因cDNA 部分序列第94页
   ·PCR 产物回收第94页
   ·目的基因片段的T/A 克隆第94页
   ·重组质粒的提取第94页
   ·序列测定第94-95页
   ·序列比对分析第95页
   ·荧光定量PCR第95页
   ·数据分析第95页
 3 结果与分析第95-98页
   ·总RNA 的提取第95页
   ·猪4F2hc mRNA 表达的组织特异性第95-96页
   ·猪rBAT mRNA 表达的组织特异性第96-97页
   ·猪b~(0,+)AT mRNA 表达的组织特异性第97页
   ·猪y~+LAT1 mRNA 表达的组织特异性第97-98页
 4 讨论第98-99页
 5 小结第99-100页
第五章 不同赖氨酸对体外培养的IEC 碱性氨基酸转运载体MRNA 表达的调控第100-116页
 1 试验材料第101-102页
   ·试验动物第101页
   ·主要仪器设备第101页
   ·主要试剂及配制方法第101-102页
     ·DMEM/F12 基础培养基的配制第102页
     ·DMEM/F12 完全培养基(含双抗)的配制第102页
     ·1%胶原酶Ⅱ型(10×母液)的配制第102页
     ·PBS 缓冲液(pH=7.2) 的配制第102页
     ·赖氨酸溶液(Sigma)(100mM) 的配制第102页
 2 试验方法第102-105页
   ·猪小肠黏膜上皮细胞的分离培养第102-103页
   ·传代培养第103页
   ·赖氨酸对IEC 增殖的影响第103-104页
   ·猪IEC 的鉴定第104-105页
     ·碱性磷酸酶的鉴定第104页
     ·免疫学方法鉴定第104-105页
   ·不同赖氨酸浓度处理猪IEC 细胞第105页
   ·总RNA 的提取和纯化第105页
   ·cDNA 第一链的合成第105页
   ·实时荧光定量PCR第105页
 3 结果与分析第105-112页
   ·猪IEC 的分离培养第105-106页
   ·猪IEC 的鉴定第106-107页
     ·碱性磷酸酶的鉴定第106-107页
     ·免疫学方法鉴定第107页
   ·赖氨酸对IEC 增殖的影响第107-108页
   ·总RNA 的提取第108-109页
   ·赖氨酸对猪碱性氨基酸转运载体mRNA 表达的影响第109-112页
     ·赖氨酸对CAT-1 mRNA 表达的影响第109页
     ·赖氨酸对CAT-2 mRNA 表达的影响第109-110页
     ·赖氨酸对y~+LAT1 mRNA 表达的影响第110-111页
     ·赖氨酸对4F2hc mRNA 表达的影响第111页
     ·赖氨酸对b~(0,+)AT、rBAT mRNA 表达的影响第111-112页
 4 讨论第112-114页
   ·猪IEC 的原代培养第112-113页
   ·猪IEC 转运载体mRNA 的表达调控第113-114页
 5 小结第114-116页
结论第116-117页
创新点第117-118页
致谢第118-119页
参考文献第119-131页
附录A 文献综述动物碱性氨基酸转运载体研究进展第131-144页
附录B 技术路线第144-145页
附录C:部分测序图谱(以ORF 测序为代表)第145-151页
附录D:荧光定量曲线第151-153页
附录E:在学期间参加的科研课题、学术活动及发表的论文第153-155页

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