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中华雏蝗和日本鸣蝗全线粒体基因组的测序及分析

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-9页
第一部分 前言第9-13页
 1 线粒体与线粒体基因组第9-10页
 2 线粒体基因组研究方法第10-11页
 3 昆虫线粒体基因组的研究现状第11-12页
 4 研究选题的目的及意义第12-13页
第二部分 材料与方法第13-25页
 1. 实验材料第13-16页
   ·标本的采集、保存与鉴定第13页
   ·仪器和试剂第13-16页
     ·实验仪器第13-14页
     ·实验试剂第14-16页
     ·数据分析软件第16页
 2. 实验方法第16-22页
   ·基因组 DNA提取第16-18页
     ·提取试剂配制第16-17页
     ·DNA提取步骤第17页
     ·总 DNA检测第17-18页
   ·线粒体基因组的LA-PCR 及 Sub-PCR 扩增第18-20页
     ·引物来源第18-19页
     ·LA-PCR & Sub-PCR 扩增原理和条件第19-20页
   ·PCR 扩增产物的回收纯化第20-21页
   ·扩增片段的直接测序第21页
   ·T-载体克隆测序第21-22页
 3. 序列的拼接、注释与分析第22-25页
   ·序列拼接第22页
   ·线粒体基因组的基因定位及注释第22-23页
   ·线粒体基因组序列比对和系统发育分析第23-25页
第三部分 结果分析和讨论第25-80页
 1. DNA 提取及 PCR扩增结果第25-29页
   ·基因组总 DNA 提取结果第25页
   ·LA-PCR & Sub-PCR 扩增结果第25-28页
   ·直接测序和克隆测序第28-29页
 2. 序列拼接结果第29-30页
 3. 中华雏蝗和日本鸣蝗线粒体基因组序列酶切图谱分析第30-33页
 4. 中华雏蝗和日本鸣蝗线粒体基因组基因定位和组成分析第33-73页
   ·基因组组成分析第33-44页
     ·碱基组成情况分析第33-35页
     ·基因结构和基因顺序第35-41页
     ·基因间重叠区域第41页
     ·基因间隔序列(Intergenic spacer region)第41-44页
   ·蛋白质基因和密码子组成分析第44-62页
     ·蛋白质基因的起始密码子与终止密码子第44-45页
     ·蛋白质基因密码子使用情况及氨基酸组成特点第45-61页
     ·蛋白质基因碱基组成偏向性第61-62页
   ·tRNA 基因及二级结构预测第62-68页
   ·rRNA 基因及二级结构预测第68-72页
   ·A+T 富集区及重复序列第72-73页
 5. 直翅目昆虫比较基因组分析结果第73-77页
   ·直翅目昆虫线粒体碱基组成特点第73-74页
   ·直翅目昆虫线粒体蛋白质编码基因比较第74-76页
   ·直翅目昆虫线粒体 A+T 富集区比较第76-77页
 6. 系统发育分析第77-80页
第四部分 结论第80-82页
参考文献第82-90页
致谢第90-91页
攻读学位期间发表论文第91页

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