| 中文摘要 | 第1-11页 |
| 英文摘要 | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-27页 |
| ·生物芯片技术 | 第14-16页 |
| ·DNA 结合蛋白 | 第16-17页 |
| ·DNA-蛋白相互作用 | 第16页 |
| ·DNA 结合蛋白的结构域 | 第16-17页 |
| ·DNA/蛋白质相互作用的研究方法 | 第17-24页 |
| ·电泳迁移率分析 | 第18页 |
| ·体外DNA 酶Ⅰ保护足迹法 | 第18页 |
| ·South-western 印迹法 | 第18-20页 |
| ·蛋白质－核酸紫外交联法 | 第20页 |
| ·甲基化干扰分析 | 第20-21页 |
| ·染色质免疫沉淀分析 | 第21-22页 |
| ·指数富集的配基系统进化技术 | 第22页 |
| ·基因芯片与染色质免疫沉淀分析技术的结合（ChIP-chip 法） | 第22-23页 |
| ·双链DNA芯片 | 第23-24页 |
| ·本研究的意义和目的 | 第24-27页 |
| ·本研究的意义 | 第24-25页 |
| ·本研究的目的 | 第25-26页 |
| ·本文的结构 | 第26-27页 |
| 第二章 双链 DNA 芯片的制备 | 第27-37页 |
| ·引言 | 第27页 |
| ·实验材料与方法 | 第27-34页 |
| ·生物芯片的基底材料 | 第27-28页 |
| ·生物芯片基底的表面修饰 | 第28-30页 |
| ·载玻片的氨基硅烷化 | 第28页 |
| ·玻片表面琼脂糖膜的制备及活化 | 第28-30页 |
| ·双链DNA 芯片的制备 | 第30-34页 |
| ·传统的双链DNA 芯片制备方法 | 第30-31页 |
| ·双链DNA 芯片制备方法一 | 第31-32页 |
| ·双链DNA 芯片制备方法二 | 第32-33页 |
| ·双链DNA 芯片制备方法三 | 第33-34页 |
| ·结果与讨论 | 第34-36页 |
| ·小结 | 第36-37页 |
| 第三章 双链 DNA 芯片制备条件的优化 | 第37-47页 |
| ·引言 | 第37页 |
| ·实验材料与方法 | 第37-39页 |
| ·发卡结构探针的设计与双链DNA 芯片的制备 | 第37-38页 |
| ·在片延伸温度及MG~(2+)浓度的优化 | 第38页 |
| ·双链DNA 芯片与荧光标记的rhNF-κB p50 二聚体的结合反应 | 第38-39页 |
| ·rhNF-κB p50 二聚体的Cy3 标记 | 第39页 |
| ·Cy3 标记rhNF-κB p50 二聚体与双链DNA 芯片的杂交反应 | 第39页 |
| ·双链DNA 芯片制备方法的优化 | 第39-46页 |
| ·发卡结构探针的设计优化 | 第39-43页 |
| ·在片延伸条件的优化 | 第43-46页 |
| ·小结 | 第46-47页 |
| 第四章 内切酶与 DNA 序列特异性的相互作用研究 | 第47-54页 |
| ·引言 | 第47-49页 |
| ·限制性内切酶法 | 第47-48页 |
| ·甲基化酶法 | 第48-49页 |
| ·实验材料与方法 | 第49-50页 |
| ·双链DNA 芯片的制备 | 第49-50页 |
| ·双链DNA 芯片分别与Rsa I、EcoR I 内切酶的反应 | 第50页 |
| ·双链DNA芯片经EcoR I 甲基化酶修饰后分别与Rsa I、EcoR I 内切酶的反应 | 第50页 |
| ·结果与讨论 | 第50-53页 |
| ·小结 | 第53-54页 |
| 第五章 rh NF-κB p50 二聚体与 DNA 序列特异性的相互作用研究 | 第54-63页 |
| ·引言 | 第54页 |
| ·实验材料与方法 | 第54-57页 |
| ·双链DNA 芯片的制备 | 第54-56页 |
| ·单链寡核苷酸的合成 | 第55页 |
| ·局部双链DNA 探针的制备 | 第55-56页 |
| ·局部双链DNA 芯片的制备 | 第56页 |
| ·完整的双链DNA 芯片的制备 | 第56页 |
| ·rhNF-κB p50 二聚体的Cy3 标记 | 第56页 |
| ·Cy3 标记rhNF-κB p50 二聚体与双链DNA 芯片的杂交反应 | 第56-57页 |
| ·实验结果 | 第57-59页 |
| ·讨论 | 第59-62页 |
| ·小结 | 第62-63页 |
| 第六章 rh NF-κB p50 二聚体与单碱基错配 DNA 的相互作用研究 | 第63-67页 |
| ·引言 | 第63页 |
| ·实验材料与方法 | 第63-64页 |
| ·双链DNA 芯片的制备 | 第63-64页 |
| ·NF-κB 蛋白p50 二聚体与双链DNA 芯片的杂交反应 | 第64页 |
| ·结果与讨论 | 第64-66页 |
| ·小结 | 第66-67页 |
| 第七章 基于双链DNA芯片的NF-κB蛋白检测方法研究 | 第67-80页 |
| ·引言 | 第67页 |
| ·实验材料与方法 | 第67-72页 |
| ·NF-κB 蛋白直接荧光标记检测法 | 第67-68页 |
| ·双链DNA 芯片的制备 | 第67页 |
| ·NF-κB 蛋白浓度-荧光强度曲线的建立 | 第67-68页 |
| ·标记抗体检测法 | 第68页 |
| ·NF-κB 抗体蛋白的标记 | 第68页 |
| ·非标记的NF-κB 蛋白与制备的双链DNA 芯片杂交 | 第68页 |
| ·标记的NF-κB 抗体蛋白与NF-κB 蛋白结合后的芯片杂交 | 第68页 |
| ·内切酶酶切介导的NF-κB 蛋白非标记检测法 | 第68-70页 |
| ·双链DNA 芯片的制备 | 第69页 |
| ·非标记的NF-κB 蛋白与双链DNA 芯片杂交 | 第69-70页 |
| ·蛋白质结合后芯片EcoR I 内切酶消化 | 第70页 |
| ·芯片酶切消化后的在片延伸 | 第70页 |
| ·基于半位点双链DNA 芯片的NF-κB 蛋白非标记检测法 | 第70-72页 |
| ·寡核苷酸探针的合成及双链DNA 芯片的制备 | 第71页 |
| ·优化半位点粘性末端的碱基数 | 第71-72页 |
| ·双链DNA芯片与不同浓度的NF-κB蛋白的杂交反应 | 第72页 |
| ·实验结果 | 第72-77页 |
| ·NF-κB 蛋白直接荧光标记检测法 | 第72-73页 |
| ·抗体标记检测法 | 第73-75页 |
| ·内切酶酶切介导的NF-κB 蛋白非标记检测法 | 第75-76页 |
| ·基于半位点双链DNA 芯片的非标记检测DNA 结合蛋白的方法 | 第76-77页 |
| ·讨论 | 第77-78页 |
| ·小结 | 第78-80页 |
| 第八章 不同结构的固定化双链DNA探针核酸杂交性能的比较 | 第80-87页 |
| ·引言 | 第80-81页 |
| ·实验材料与方法 | 第81-83页 |
| ·芯片基底的处理 | 第81页 |
| ·寡核苷酸探针的合成及双链DNA 芯片的制备 | 第81-83页 |
| ·双链DNA 芯片的杂交 | 第83页 |
| ·结果与讨论 | 第83-86页 |
| ·三种不同结构探针的 DNA 杂交性能比较 | 第83-84页 |
| ·不同茎干区的探针的杂交性能的比较 | 第84-86页 |
| ·小结 | 第86-87页 |
| 第九章 一种新的用于单碱基错配识别的固定化双链发卡结构探针 | 第87-93页 |
| ·引言 | 第87页 |
| ·实验材料与方法 | 第87-88页 |
| ·芯片基底的处理 | 第87页 |
| ·寡核苷酸探针的合成及双链DNA 芯片的制备 | 第87-88页 |
| ·双链DNA 芯片的杂交 | 第88页 |
| ·结果与讨论 | 第88-92页 |
| ·不同长度茎干区的SHP 的杂交性能比较 | 第88-90页 |
| ·固定的新型双链探针在不同温度下的单碱基错配识别能力 | 第90-92页 |
| ·固定的新型双链探针在不同MG~(2+)浓度下的单碱基错配识别能力 | 第92页 |
| ·小结 | 第92-93页 |
| 第十章 总结与展望 | 第93-96页 |
| ·双链DNA 芯片在DNA/蛋白质相互作用研究中的应用 | 第93-95页 |
| ·双链DNA 芯片的制备 | 第93页 |
| ·双链DNA 芯片的制备条件的优化 | 第93页 |
| ·内切酶与DNA 序列特异性的相互作用研究 | 第93-94页 |
| ·rh NF-κB p50 二聚体与DNA 序列特异性的相互作用研究 | 第94页 |
| ·rh NF-κB p50 二聚体与单碱基错配DNA 的相互作用研究 | 第94页 |
| ·基于双链DNA 芯片的NF-κB 蛋白检测方法研究 | 第94-95页 |
| ·用于单碱基错配识别的固定化双链DNA探针的研究 | 第95页 |
| ·不同结构的固定化双链DNA探针核酸杂交性能的比较 | 第95页 |
| ·固定化的双链DNA探针结构与核酸杂交功能的研究 | 第95页 |
| ·进一步工作需要解决的问题 | 第95-96页 |
| 参考文献 | 第96-110页 |
| 附录 | 第110-112页 |
| 致谢 | 第112页 |
