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中国螽蟖总科部分种类Cyt b和28S rDNA分子进化与系统学研究

中文摘要第1-6页
英文摘要第6-12页
第一部分 前言第12-39页
 1 螽蟖总科简介及其系统学研究现状第12-25页
   ·螽蟖的分类特征第13页
   ·螽蟖的研究概况第13-20页
     ·世界范围螽蟖的研究概况第13-19页
       ·分类区系研究第13-14页
       ·螽蟖的染色体研究第14页
       ·螽蟖的发声研究第14-15页
       ·螽蟖的生物学研究第15页
       ·螽蟖的系统学研究第15页
       ·螽蟖系统学的系统发育分析实践第15-19页
     ·我国螽蟖的研究概况第19-20页
     ·螽蟖的分类系统第20-25页
     ·直翅目高级阶元分类系统第20-22页
     ·螽蟖总科分类特征及其分类系统第22-25页
 2 动物线粒体基因组第25-30页
   ·线粒体基因组概述第25-26页
   ·动物线粒体基因组组成特点第26-29页
     ·动物线粒体基因组结构特点第27-28页
     ·动物线粒体基因组与核基因组的关系第28页
     ·动物线粒体基因组的遗传第28-29页
     ·线粒体基因组的进化第29页
   ·线粒体基因在分子系统学研究中的应用第29-30页
 3 细胞色素b基因(Cyt b)第30-33页
   ·细胞色素b基因(Cyt b)的分子特征第30-31页
   ·Cyt b在分子系统学中的应用第31-33页
 4 rDNA分子进化及其在系统发育的应用第33-35页
 5 多源数据集分析第35-37页
   ·多源数据集分析的基本概念第35-36页
   ·不同进化史与多源数据集分析的基本方法第36-37页
 6 本课题研究的目的和意义第37-39页
第二部分 实验材料与方法第39-52页
 1 实验材料第39-45页
   ·标本的采集、鉴定、保存、整理与选择第39页
   ·仪器和试剂第39-45页
 2 实验方法第45-48页
   ·总DNA提取第45-46页
   ·PCR扩增目的基因序列第46-47页
   ·目的片段序列的测定第47-48页
 3 实验数据处理和分析第48-49页
   ·序列编辑第48页
   ·序列组成分析第48-49页
   ·数据组信号检测第49页
 4 建树第49-51页
 5 四种建树方法得到的系统树的比较和总结第51-52页
第三部分 结果分析第52-102页
 1 基因组总DNA的提取、PCR扩增及序列的测定第52页
 2 Cyt b基因序列结果第52-70页
   ·Cyt b基因的部分序列片段分析第52-56页
     ·Cyt b基因序列多态位点及信号位点第53页
     ·Cyt b基因的碱基替换第53-55页
     ·碱基替换饱和性分析第55-56页
   ·螽蟖总科不同种间Cyt b基因的遗传距离分析第56-67页
   ·螽蟖总科不同种间Cyt b基因的遗传密码及其应用第67-68页
   ·卡方及系统发育信号检验第68-70页
 3 28SrDNA序列结果第70-75页
   ·28SrDNA的部分片段分析第71页
   ·28S基因碱基替换饱和性分析第71-73页
   ·螽蟖总科不同种间28基因的遗传距离分析第73页
   ·卡方及系统发育信号检验第73-75页
 4 细胞色素b与28S联合数据集分析第75-79页
   ·联合数据集序列多态位点及信号位点第75页
   ·联合数据集碱基替换饱和性分析第75-76页
   ·联合数据集的遗传距离分析第76-77页
   ·卡方及系统发育信号检验第77-79页
 5 螽蟖总科部分昆虫系统发育重建第79-102页
   ·距离法第79-83页
   ·简约法建树第83-91页
   ·最大似然法建树第91-93页
   ·贝叶氏系统发育推论结果第93-97页
   ·四种建树方法得到的系统树的比较和总结第97-102页
     ·Cyt b四种建树方法得到的系统树的比较和总结第97-99页
     ·联合数据集四种建树方法得到的系统树的比较和总结第99页
     ·螽蟖总科的科间和几个科的科内关系第99-102页
第四部分 讨论第102-113页
   ·目的基因片段的获得第102-103页
   ·基因片段的序列组成与分子进化特征第103-104页
   ·系统发育信号评估第104-105页
   ·线粒体基因与核基因的比较第105-106页
   ·系统发育的噪音第106页
   ·建树方法的比较与联合树第106-107页
   ·螽蟖的系统关系第107-112页
     ·螽蟖总科内各科的关系第108-110页
     ·科下分类阶元的关系第110-112页
   ·两个分子标记在螽蟖总科昆虫系统发育关系研究中的有效性第112-113页
第五部分 总结第113-115页
参考文献第115-133页
附录一:论文中的省略语和系统树中分类单元的缩写第133-135页
附录二:比对结果第135-146页
附录三:部分测序结果第146-150页
致谢第150-151页
攻读博士学位期间发表的论文第151-152页

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