第1章 概述 | 第1-21页 |
·本文研究的提出 | 第11页 |
·生物信息数据库发展概况 | 第11-12页 |
·个人数据库概念 | 第12-14页 |
·基因本体论研究概况 | 第14页 |
·蛋白质亚细胞位置预测方法综述 | 第14-21页 |
·蛋白质亚细胞位置预测的研究概况 | 第15-17页 |
·蛋白质亚细胞位置预测算法的研究概况 | 第17-21页 |
第2章 生物信息数据库中的基因本体论 | 第21-28页 |
·基因本体论概述 | 第21-24页 |
·本体论 | 第21页 |
·本体论对于生物学上知识共享的作用 | 第21-23页 |
·基因本体论 | 第23-24页 |
·基因本体论术语对蛋白质序列的注释 | 第24-28页 |
第3章 基于基因本体论的生物信息个人数据库系统的设计 | 第28-39页 |
·基于基因本体论的生物信息个人数据库系统的结构及功能 | 第28-32页 |
·系统功能 | 第29-30页 |
·系统结构 | 第30-32页 |
·用基因本体论对蛋白质序列进行查询 | 第32-36页 |
·蛋白质序列查询的数据库设计 | 第32-33页 |
·蛋白质序列查询功能的实现 | 第33-36页 |
·BIODB_GO中的蛋白质序列查询模块的实现 | 第36-39页 |
第4章 基于全序列特征的蛋白质亚细胞位置预测研究 | 第39-55页 |
·蛋白质亚细胞位置预测研究简介 | 第39-44页 |
·蛋白质亚细胞位置预测算法的步骤 | 第39-40页 |
·提取序列描述符的方法 | 第40-44页 |
·表征全序列特征的随机信号处理法 | 第44-48页 |
·李氏指数法 | 第45-47页 |
·贝塞尔函数法 | 第47页 |
·切比雪夫滤波器法 | 第47-48页 |
·基于全序列特征的伪氨基酸预测法及其实现 | 第48-52页 |
·蛋白质序列的编码 | 第48-50页 |
·基于全序列特征的伪氨基酸预测法 | 第50-51页 |
·基于全序列特征的伪氨基酸预测法的实现 | 第51-52页 |
·预测结果分析 | 第52-55页 |
·检验方法 | 第52-53页 |
·预测结果 | 第53-55页 |
第5章 基于全序列特征的亚细胞定位法在BIODB_GO中的实现 | 第55-62页 |
·亚细胞预测算法在BIODB_GO中的应用 | 第55-56页 |
·亚细胞预测研究相关文献的检索 | 第56-58页 |
·用于亚细胞位置预测的协同工作 | 第58-60页 |
·协同工作的概念 | 第58-59页 |
·网络环境下的亚细胞位置预测的协同工作 | 第59-60页 |
·研究成果发布及BIODB_GO更新 | 第60-62页 |
总结与展望 | 第62-63页 |
参考文献 | 第63-70页 |
附录1 BIODB GO数据库的数据结构 | 第70-75页 |
附录2 部分蛋白质亚细胞定位算法程序 | 第75-79页 |
攻读硕士期间发表学术论文目录 | 第79页 |
攻读硕士期间参与项目 | 第79-80页 |
致谢 | 第80页 |