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同源序列高剂量异常表达及病毒编码蛋白对基因沉默的作用

第一章 文献综述第1-39页
   ·RNA沉默--生物中普遍存在的表达监控机制第8-23页
     ·RNA沉默的概况第8页
     ·RNA沉默的过程第8-9页
     ·RNA沉默的机理第9-13页
     ·RNA沉默中的关键因子及相应作用第13-18页
     ·RNA沉默的生物学意义及实际应用第18-23页
   ·RNA监控机制(RNA surveillance)第23-25页
     ·RNA surveillance系统的定义及分类第23页
     ·RNA surveillance系统的特点及过程特征第23-25页
     ·RNA surveillance系统与正常mRNA降解有着不同的分子机制第25页
   ·真核生物mRNA3'非翻译区的组成及对基因表达的影响第25-31页
     ·mRNA3'-UTR内的末端加工信号第26-28页
     ·mRNA3'-UTR加工的复杂性第28-29页
     ·mRNA3'-UTR对基因表达的影响第29-31页
   ·RNA沉默丰富了病毒与宿主植物之间的互作与共进化关系第31-38页
     ·基因沉默--植物抵御外来病毒入侵的一种机制第31-33页
     ·病毒对植物的反应第33-38页
   ·本研究的目的和意义第38-39页
第二章 实验材料和方法第39-57页
   ·实验材料第39-40页
     ·宿主菌第39页
     ·质粒载体第39页
     ·各种酶及试剂第39页
     ·植物材料第39页
     ·病毒基因及侵染性克隆第39-40页
     ·所用引物第40页
   ·常用培养基和溶液的配制第40-43页
     ·培养基配制第40-41页
     ·常用溶液的配制第41页
     ·实验所需试剂及其配制第41-43页
   ·基本实验方法第43-57页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第43页
     ·大肠杆菌感受态细胞的转化第43页
     ·重组质粒的快速鉴定(Cracking)第43-44页
     ·碱裂解活少量提取质粒DNA第44页
     ·碱裂解法大量提取质粒DNA第44页
     ·DNA片段的回收第44-45页
     ·在质粒载体中进行DNA克隆第45-46页
     ·Agro-infiltration方法接种本生烟第46-47页
     ·植物组织基因组DNA的提取第47页
     ·Southern杂交第47-49页
     ·植物组织总RNA的提取第49-50页
     ·低分子量RNA的提取第50页
     ·Northern杂交第50-53页
     ·RT-PCR-Southern第53-54页
     ·Westem Blot第54-55页
     ·本生烟(Ncotiana benthamiana)的遗传转化第55页
     ·细胞核RNA与细胞质RNA的提取第55页
     ·本生烟原生质体的电击转化第55-56页
     ·植物基因沉默的观察记录第56页
     ·转基因植株后代的Kan抗性筛选第56页
     ·转基因植株的ELISA检测第56-57页
第三章 异常mRNA表达在植物基因沉默中的作用第57-65页
   ·载体的来源与结构第58页
   ·注射侵染后表型的观察与统计第58-59页
   ·表型变化后的分子检测第59-62页
     ·Northern Blot第59-60页
     ·沉默植株中的siRNA检测第60-61页
     ·接种本生烟体内正、负意GFP siRNA的积累情况检测第61页
     ·接种本生烟中的GFP基因的甲基化分析第61-62页
   ·沉默植株的嫁接试验第62页
   ·讨论第62-65页
第四章 同源序列诱发系统性基因沉默的剂量效应第65-73页
   ·供试的表达载体第65-66页
   ·不同类型载体接种后诱发基因沉默的效率比较第66-67页
   ·接种植株体内GFP mRNA的Northern blot检测第67-68页
   ·接种植株内siRNA的检测第68-69页
   ·接种植株基因组DNA甲基化的检测第69页
   ·接种植株体内瞬时表达的GFP蛋白Western Blot检测第69-70页
   ·通用表达载体的构建第70-71页
   ·讨论第71-73页
第五章 异常结构GFP基因表达产物的特性分析第73-81页
   ·GFP基因异常表达载体对本生烟的馈传转化第73-76页
     ·本生烟再生植株的获得第73-74页
     ·再生植株的统计及长波紫外下的表型观察第74页
     ·再生植株的分子检测第74-76页
   ·GFP基因异常表达产物的特性分析第76-79页
     ·转录物的结构形式第76-77页
     ·转录物的细胞定位第77-79页
   ·讨论第79-81页
第六章 重复串联基因结构诱发的基因沉默与植物病毒抗性第81-91页
   ·供试转基因烟草第81-82页
   ·转基因纯合系的筛选鉴定第82页
     ·Kan抗性的纯合系的筛选第82页
     ·纯合表型株系的鉴定第82页
   ·抗性植株的分子检测第82-87页
     ·Northern检测表明了转化不同结构的植株GFP基因沉默的程度不同第82-84页
     ·转基因烟草的Southrn Blot检测第84-85页
     ·转基因植株中GFP基因的序列测定第85-86页
     ·不同表型转基因植株的DNA甲基化检测第86-87页
   ·GFP3转基因植株的嫁接试验第87页
   ·GFP1和GFP3株系的抗病性测定第87-90页
     ·T_1代植株的抗病性检测第88-89页
     ·T_3代植株的抗病性检测第89-90页
   ·结果与讨论第90-91页
第七章 BNYVV和RBSDV编码基因沉默抑制子的初步研究第91-103页
   ·嵌合载体的构建第91-95页
     ·PVX载体ND108的改造构建第92-93页
     ·表达外源病毒基因的PVX嵌合载体构建第93-95页
   ·病毒基因嵌合载体接种本生烟后的症状表现与Northern检测第95-96页
   ·BNYVV一14K和RBSDV-S6对本生烟16C基因沉默的抑制第96-98页
     ·嵌合病毒载体对基因沉默的逆转作用第96-97页
     ·对双元载体pinG引发基因沉默的抑制作用第97-98页
   ·RBSDV不同基因组分对PVX症状及GFP瞬时表达的影响第98-100页
     ·嵌合载体混合接种后的症状表现与病毒检测第98-99页
     ·嵌合载体混合接种后GFP基因的瞬时表达情况第99-100页
   ·讨论第100-103页
参考文献第103-123页
缩略词第123-124页
致谢第124页

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