| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-25页 |
| ·前言 | 第11-12页 |
| ·miRNA简介 | 第12-14页 |
| ·非编码RNA的分类 | 第12-13页 |
| ·miRNA研究进展 | 第13-14页 |
| ·miRNA生成机制 | 第14-15页 |
| ·pre-miRNA4 | 第14-15页 |
| ·成熟 miRNA与 RISC | 第15页 |
| ·miRNA作用机制与功能 | 第15-18页 |
| ·miRNA作用机制 | 第15-16页 |
| ·miRNA功能与生物学意义 | 第16-18页 |
| ·miRNA的进化 | 第18-20页 |
| ·miRNA研究方法进展 | 第20-23页 |
| ·miRNA鉴定标准 | 第20页 |
| ·miRNA发掘方法 | 第20-21页 |
| ·miRNA功能研究方法 | 第21-23页 |
| ·海鞘miRNA研究进展 | 第23-24页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第24-25页 |
| 第二章 三种尾索动物C.savignyi、C.intestinalis和O.dioica的miRNA的生物信息学预测和MIRNA家族鉴定 | 第25-40页 |
| ·数据来源与算法 | 第26-29页 |
| ·数据来源 | 第26页 |
| ·算法 | 第26-29页 |
| ·结果 | 第29-38页 |
| ·Ciona属海鞘的特有 miRNA预测结果 | 第29-31页 |
| ·保守性miRNA预测结果 | 第31页 |
| ·萨氏海鞘miRNA家族鉴定 | 第31-35页 |
| ·miRNA的基因组分布和miRNA簇 | 第35-38页 |
| ·讨论 | 第38-40页 |
| 第三章 萨氏海鞘miRNA实验表达验证 | 第40-55页 |
| ·材料与方法 | 第40-48页 |
| ·实验材料 | 第40-43页 |
| ·实验方法 | 第43-48页 |
| ·结果 | 第48-52页 |
| ·miRNA表达验证 | 第48-50页 |
| ·miRNAcsa_m-27c的表达时空变化 | 第50-52页 |
| ·讨论 | 第52-55页 |
| 第四章 萨氏海鞘miRNA功能预测 | 第55-65页 |
| ·数据与算法 | 第56-57页 |
| ·数据 | 第56页 |
| ·方法 | 第56-57页 |
| ·结果 | 第57-62页 |
| ·萨氏海鞘miRNA靶基因预测 | 第57页 |
| ·靶基因gene ontology分类 | 第57-61页 |
| ·与胚胎发育和心脏发育相关的miRNA的分析 | 第61-62页 |
| ·讨论 | 第62-65页 |
| 结论 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-71页 |
| 博士期间完成的论文 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
| 附表 | 第73-97页 |
| 附表 1、基于序列保守性预测的萨氏海鞘C. savignyi miRNA | 第73-79页 |
| 附表 2、基于序列保守性预测的玻璃海鞘C. intestinalis miRNA | 第79-85页 |
| 附表 3、基于序列保守性预测的尾海鞘O. dioica miRNA | 第85-94页 |
| 附表 4、萨氏海鞘具有相同种子序列和相似miRNA成熟序列的多拷贝miRNA | 第94-96页 |
| 附表 5、萨氏海鞘与非尾索动物同序列miRNA的pre-miRNA拓扑关系 | 第96-97页 |
