| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-12页 |
| ·课题背景及其意义 | 第7页 |
| ·国内外研究现状与意义 | 第7-10页 |
| ·本文工作概述 | 第10-11页 |
| ·本文结构安排 | 第11-12页 |
| 第二章 蛋白质折叠结构预测问题及其研究模型 | 第12-20页 |
| ·蛋白质折叠结构预测问题 | 第12-14页 |
| ·蛋白质结构预测的方法综述 | 第14-15页 |
| ·同源建模法(Homologous Modeling) | 第14页 |
| ·折叠识别法(Fold Recognition) | 第14-15页 |
| ·从头预测方法(Ab Initio Prediction) | 第15页 |
| ·蛋白质折叠结构预测的优化模型 | 第15-19页 |
| ·二维HP格点模型 | 第16-17页 |
| ·二维Toy模型 | 第17-19页 |
| ·小结 | 第19-20页 |
| 第三章 粒子群优化算法 | 第20-28页 |
| ·粒子群优化算法基本理论 | 第20-24页 |
| ·粒子群优化算法的生物原型 | 第20-21页 |
| ·粒子群优化的算法模型 | 第21-23页 |
| ·粒子群优化算法流程 | 第23-24页 |
| ·粒子群优化算法的行为特性分析 | 第24-26页 |
| ·粒子群优化算法与遗传算法比较 | 第26-27页 |
| ·粒子群优化算法的根本问题 | 第27页 |
| ·小结 | 第27-28页 |
| 第四章 多种群粒子群优化算法在蛋白质折叠结构预测中的应用 | 第28-38页 |
| ·多种群粒子群优化算法的改进方法 | 第28-31页 |
| ·多种群粒子群优化算法描述 | 第31-33页 |
| ·仿真实验及结果分析 | 第33-37页 |
| ·仿真实验相关参数设定 | 第33-34页 |
| ·仿真实验结果 | 第34-35页 |
| ·结果分析 | 第35-37页 |
| ·小结 | 第37-38页 |
| 第五章 自适应分工粒子群优化算法在蛋白质折叠结构预测中的应用 | 第38-48页 |
| ·自适应分工粒子群优化算法的改进方法 | 第38-41页 |
| ·自适应分工原理 | 第38-39页 |
| ·局部环境因数η | 第39-40页 |
| ·种群自适应分工策略 | 第40-41页 |
| ·自适应粒子群优化算法描述 | 第41-43页 |
| ·仿真实验及结果分析 | 第43-47页 |
| ·仿真实验相关参数设定 | 第44页 |
| ·仿真实验结果之一:人工蛋白质序列 | 第44-45页 |
| ·仿真实验结果之二:真实蛋白质序列 | 第45-46页 |
| ·结果分析 | 第46-47页 |
| ·小结 | 第47-48页 |
| 第六章 总结与展望 | 第48-50页 |
| ·工作总结 | 第48页 |
| ·研究与展望 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 附录A 攻读学位期间发表的论文 | 第55页 |
