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人鼻咽癌基因组生物信息学分析与基因差异表达谱的构建

中文摘要第1-15页
英文摘要第15-23页
目录第23-25页
主要缩略词简表第25-26页
第一章 前言第26-31页
第二章 材料与方法第31-44页
第三章 结果第44-171页
 1.U133 Data鼻咽癌相关差异表达基因分析第44-75页
   ·非肿瘤鼻咽上皮与NPC组织全基因组基因表达谱第44-46页
   ·NPC差异表达基因第46-48页
   ·NPC差异表达基因功能生物信息学分析第48-67页
     ·PANTHER在线软件Pathway、GeneOntology的biological process和molecular function分析第48-52页
     ·DAVID在线软件Gene-Enrichment Analysis和Functional Annotation Clustering第52-58页
     ·NPC差异表达基因遗传图谱和物理图谱的绘制第58-67页
   ·筛选NPC潜在分子标记第67-75页
 2.H80s Data NPC差异表达基因功能生物信息学分析第75-82页
     ·PANTHER在线软件Pathway、GO BP和MF分析第75-78页
   ·DAVID在线软件Gene-Enrichment Analysis和Functional Annotation Clustering第78-82页
 3.TW-U133 Data NPC差异表达基因功能生物信息学分析第82-101页
     ·PANTHER在线软件Pathway、GO BP和MF分析第82-86页
     ·DAVID在线软件Gene-Enrichment Analysis和Functional Annotation Clustering第86-91页
     ·差异表达基因遗传图谱和物理图谱的绘制第91-101页
 4.U133、H80s和TW-U133芯片数据NPC相关差异表达基因综合分析第101-153页
     ·三组数据中共有的NPC相关差异表达基因第101-103页
     ·三组数据及ANY2 Data中NPC差异表达基因的生物信息学分析第103-143页
       ·PANTHER软件分析第103-107页
       ·DAVID软件分析第107-126页
       ·NPC差异表达基因功能分类示意图第126-135页
       ·NPC差异表达基因遗传图谱的绘制第135-143页
     ·三组数据共存的NPC差异表达基因生物信息学分析第143-153页
       ·三组数据共存的NPC差异表达基因功能分类第143-152页
       ·三组数据共存的NPC差异表达基因功能关系示意图第152-153页
 5.不同临床分期的NPC差异表达基因第153-160页
     ·HS0s Data筛选不同临床分期的NPC差异表达基因第154-157页
     ·U133 Data筛选不同临床分期的NPC差异表达基因第157-159页
     ·不同临床分期的NPC差异表达基因功能关系示意图第159-160页
 6.本实验室前期克隆NPC候选抑癌基因在U133 Data中的表达第160-161页
 7.三组数据中共有的NPC差异表达基因的验证第161-171页
第四章 讨论第171-192页
 1.正常鼻咽与鼻咽癌组织全基因组表达谱第173-175页
 2.鼻咽癌差异表达基因第175-177页
 3.鼻咽癌差异表达基因的生物信息学功能分析第177-190页
     ·鼻咽癌差异表达基因pathway分析第177-181页
     ·鼻咽癌差异表达基因的GO BP和MF分析第181-185页
     ·鼻咽癌差异表达基因的Functional Annotation Clustering分析第185-186页
     ·鼻咽癌差异表达基因遗传图谱、物理图谱和基因图谱第186-187页
     ·三组数据共存的NPC差异表达基因第187-190页
 4.不同临床分期相关的鼻咽癌差异表达基因第190页
 5.本实验室前期克隆NPC候选抑癌基因在U133 Data中的表达第190-191页
 6.三组数据中共有的NPC差异表达基因的验证第191-192页
结论第192-193页
参考文献第193-203页
综述第203-213页
致谢第213-214页
作者简介第214-216页

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