| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-20页 |
| ·课题背景(或引言) | 第9页 |
| ·禽流感病毒的研究进展 | 第9-18页 |
| ·禽流感病毒的发现及其发展历史 | 第9-10页 |
| ·禽流感病毒的分类及形态 | 第10页 |
| ·禽流感病毒的命名 | 第10-11页 |
| ·禽流感病毒的理化特征 | 第11页 |
| ·禽流感病毒的流行病学研究 | 第11-12页 |
| ·流感病毒基因组的及其编码的蛋白功能 | 第12-17页 |
| ·病毒的复制 | 第17页 |
| ·禽流感病毒的抗原变异 | 第17-18页 |
| ·LPAIV向HPAIV的转变 | 第18页 |
| ·本课题研究的目的和意义 | 第18-20页 |
| 2 材料和方法 | 第20-27页 |
| ·实验材料 | 第20-21页 |
| ·毒株 | 第20页 |
| ·SPF鸡胚及红细胞 | 第20页 |
| ·受体菌 | 第20页 |
| ·实验试剂 | 第20页 |
| ·实验仪器 | 第20-21页 |
| ·特异性引物 | 第21页 |
| ·实验方法 | 第21-27页 |
| ·样品的采集和病毒的分离 | 第21-22页 |
| ·红细胞凝集实验(HA) | 第22页 |
| ·病毒RNA的提取 | 第22-23页 |
| ·cDNA的合成 | 第23页 |
| ·AIV的RT-PCR检测 | 第23页 |
| ·PCR结果鉴定 | 第23-24页 |
| ·AIV血凝素亚型及神经氨酸酶亚型的鉴定 | 第24页 |
| ·全基因组PCR扩增 | 第24页 |
| ·PCR产物的克隆 | 第24-26页 |
| ·PCR方法鉴定重组质粒 | 第26页 |
| ·序列测定 | 第26页 |
| ·序列比较分析 | 第26-27页 |
| 3 结果 | 第27-62页 |
| ·血凝价 | 第27页 |
| ·AIV阳性样品PCR检测结果 | 第27页 |
| ·RT-PCR电泳结果 | 第27-32页 |
| ·A/Mallard/SanJiang/98/2006(H3N8)基因组序列 | 第32-39页 |
| ·A/Mallard/SanJiang/167/2006(H3N8)基因组序列 | 第39-47页 |
| ·两株H3N8亚型AIV分离株遗传进化树绘制 | 第47-56页 |
| ·血凝素基因(HA)遗传进化树 | 第47-49页 |
| ·神经氨酸酶基因(NA)遗传进化树 | 第49-50页 |
| ·RNA聚合酶基因(PB2,PB1,PA)遗传进化树 | 第50-53页 |
| ·核糖核蛋白基因(NP)遗传进化树 | 第53-54页 |
| ·基质蛋白基因(M)遗传进化树 | 第54-55页 |
| ·非结构蛋白基因(NS)遗传进化树 | 第55-56页 |
| ·两分离株与H3N8亚型AIV基因组序列同源性比较 | 第56-58页 |
| ·血凝素基因(HA)序列比较 | 第58-60页 |
| ·神经氨酸酶基因(NA)潜在糖基化位点 | 第60页 |
| ·基质蛋白(M)离子通道氨基酸位点比较 | 第60-62页 |
| 4 讨论 | 第62-69页 |
| ·基因组分析 | 第62-67页 |
| ·分离株HA基因特征及其遗传进化关系 | 第62-63页 |
| ·分离株NA基因特征及其进化关系 | 第63-64页 |
| ·分离株NS基因的特征及其进化关系 | 第64-65页 |
| ·分离株聚合酶基因的特征及其进化关系 | 第65-66页 |
| ·分离株NP和M基因的特征及其进化关系 | 第66-67页 |
| ·野鸟在AIV传播中的作用的初步探讨 | 第67-69页 |
| 5 结论 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-76页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
