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竞争性内源RNA网络识别喉癌复发中的特征性微小RNA和长链非编码RNA

个人简历第3-10页
中文摘要第10-13页
英文摘要第13-18页
1 前言第18-26页
    1.1 喉癌的临床研究现状第18-20页
        1.1.1 喉癌发病率和死亡率数据第18页
        1.1.2 喉癌治疗现状第18-19页
        1.1.3 本研究的切入点第19-20页
    1.2 喉癌的分子生物学研究现状第20-24页
        1.2.1 非编码RNA概述第20-21页
        1.2.2 微小RNA概述第21页
        1.2.3 长链非编码RNA概述第21-22页
        1.2.4 竞争性内源RNA概述第22-23页
        1.2.5 喉癌相关的分子生物学研究第23页
        1.2.6 本研究切入点第23-24页
    1.3 本研究相关数据库介绍第24-26页
        1.3.1 TCGA数据库介绍第24页
        1.3.2 GEO数据库介绍第24-26页
2 材料与方法第26-35页
    2.1 数据下载及数据预处理第26-28页
        2.1.1 训练集数据第26页
        2.1.2 验证集数据第26-28页
    2.2 分析差异表达的lncRNA、m RNA和 miRNA第28-29页
    2.3 分析DE-lncRNA与复发时间的相关性第29页
    2.4 构建lncRNA-miRNA-mRNA的 ceRNA调控网络第29-30页
        2.4.1 预测miRNA靶向调控的lncRNA第29-30页
        2.4.2 预测miRNA调控的m RNA靶基因第30页
        2.4.3 构建ceRNA调控网络第30页
    2.5 利用支持向量机构建样本分类模型第30-32页
        2.5.1 基于网络介数中心性算法优化特征基因第30-31页
        2.5.2 筛选最优特征基因组合第31页
        2.5.3 利用最优特征基因组合构建SVM分类器第31-32页
        2.5.4 SVM分类器效能独立验证与评估第32页
    2.6 分子功能和通路富集分析第32-34页
    2.7 分析流程图第34-35页
3 结果第35-58页
    3.1 特征性DE-lncR、DE-miR和 DEG的筛选第35-41页
    3.2 DE-lncR与复发时间相关性分析第41-42页
    3.3 lncRNA-miRNA、miRNA-mRNA网络第42-46页
        3.3.1 预测miRNA靶向调控lncRNA关系第42-44页
        3.3.2 预测miRNA调控的靶基因第44-46页
    3.4 利用支持向量机构建样本分类模型第46-52页
        3.4.1 识别特征编码基因第46-47页
        3.4.2 构建SVM分类器第47-49页
        3.4.3 SVM分类器效能验证与评估第49-52页
    3.5 分子功能和通路富集分析第52-56页
    3.6 由32个最优特征编码基因组成的ceRNA调控网络第56-58页
4 讨论第58-63页
    4.1 本研究的意义第58-59页
    4.2 HOTAIR-miR-1-MAGEA2相互作用关系第59-60页
    4.3 HCG4-miR-33b相互作用关系第60页
    4.4 EMX2OS-miR-124-CALCA/GABRG2 相互作用关系第60-62页
    4.5 SVM分类器第62页
    4.6 本研究的局限性第62-63页
5 结论第63-64页
参考文献第64-77页
综述:喉癌发病的相关因素分析第77-108页
    1 不良嗜好第77-80页
        1.1 吸烟第77-78页
        1.2 饮酒第78-79页
        1.3 槟榔第79-80页
    2 环境与职业暴露第80-81页
    3 病毒感染第81-83页
        3.1 HPV感染第81-82页
        3.2 HIV感染第82页
        3.3 HSV感染第82-83页
        3.4 流感病毒感染第83页
    4 饮食第83-85页
    5 疾病状态第85-87页
        5.1 反流性疾病第85页
        5.2 代谢性疾病第85-87页
        5.3 过敏性疾病第87页
    6 其他临床因素第87-88页
    7 基因因素第88-91页
    参考文献第91-108页
致谢第108-109页
攻读学位期间发表的学术论文第109页

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