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毛竹HD-Zip转录因子家族基因的鉴定及PeHDZ45的克隆与分子特征分析

致谢第4-5页
摘要第5-7页
Abstract第7-8页
缩写和符号清单第12-13页
1 文献综述第13-18页
    1.1 毛竹简介第13页
    1.2 植物转录因子研究进展第13-15页
        1.2.1 植物转录因子的结构第14-15页
        1.2.2 植物转录因子的调控作用第15页
    1.3 植物HD-Zip转录因子概述第15-17页
        1.3.1 HD-Zip转录因子的结构及分类第15-16页
        1.3.2 HD-Zip转录因子生物学功能第16-17页
    1.4 生物信息学在基因研究中的作用第17-18页
2 引言第18-20页
    2.1 研究目的与意义第18-19页
    2.2 技术路线第19-20页
3 材料与方法第20-35页
    3.1 研究材料第20-21页
        3.1.1 植物材料第20页
        3.1.2 菌株和载体第20页
        3.1.3 酶及试剂第20页
        3.1.4 主要仪器设备第20-21页
        3.1.5 引物合成及测序第21页
    3.2 研究方法第21-35页
        3.2.1 毛竹全基因组HD-Zip转录因子的鉴定第21页
        3.2.2 毛竹HD-Zip转录因子氨基酸序列属性分析第21页
        3.2.3 毛竹HD-Zip转录因子的命名第21页
        3.2.4 毛竹HD-Zip转录因子进化树的构建第21页
        3.2.5 毛竹HD-Zip转录因子结构分析第21-22页
        3.2.6 毛竹HD-Zip转录因子保守基序分析第22页
        3.2.7 毛竹HD-Zip转录因子同源基因对的鉴定及Ka/Ks值的计算第22页
        3.2.8 毛竹HD-Zip转录因子基因表达谱分析第22页
        3.2.9 培养基、抗生素和主要试剂的配制第22-23页
        3.2.10 毛竹HD-ZipI家族基因干旱诱导表达模式分析第23-27页
        3.2.11 毛竹、拟南芥、水稻和玉米HD-ZipI基因系统发育树比对第27页
        3.2.12 毛竹PeHDZ45基因的克隆第27-30页
        3.2.13 PeHDZ45基因的组织表达模式分析第30页
        3.2.14 PeHDZ45基因的亚细胞定位分析第30-32页
        3.2.15 PeHDZ45基因的转录活性分析第32-35页
4 结果与分析第35-57页
    4.1 毛竹全基因组HD-Zip转录因子候选基因的确定及命名第35页
    4.2 毛竹HD-Zip转录因子的进化树关系及基因结构分析第35-38页
    4.3 毛竹HD-Zip转录因子的保守基序分析第38-39页
    4.4 毛竹、水稻、玉米和高粱HD-Zip转录因子进化树比较分析第39-42页
    4.5 毛竹和水稻HD-Zip转录因子基因家族进化模式及分歧时间分析第42页
    4.6 毛竹HD-Zip转录因子基因表达谱分析第42-47页
    4.7 毛竹HD-ZipI家族基因干旱诱导表达模式分析第47-51页
    4.8 PeHDZ45基因的克隆和序列分析第51-53页
    4.9 PeHDZ45基因的组织表达模式分析第53页
    4.10 PeHDZ45基因的亚细胞定位分析第53-55页
    4.11 PeHDZ45基因的转录活性分析第55-57页
5 讨论第57-60页
6 结论第60-61页
参考文献第61-65页
个人简介第65-66页
附录A:MEME网站搜索得到的所有保守基序第66-67页
附录B:保守基序编号、长度以及基序最佳匹配氨基酸序列第67页

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